| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1 淡水蚌概述 | 第12-14页 |
| ·淡水蚌的主要生物学特征 | 第12页 |
| ·鄱阳湖的淡水蚌 | 第12-13页 |
| ·淡水蚌的生物多样性 | 第13页 |
| ·淡水蚌研究现状 | 第13-14页 |
| 2 遗传多样性的检测方法及其在水产研究中的应用 | 第14-18页 |
| ·形态学水平 | 第14-15页 |
| ·染色体(细胞学)水平 | 第15页 |
| ·同功酶水平 | 第15页 |
| ·DNA水平 | 第15-18页 |
| ·RFLP及其在水产研究中的应用 | 第16页 |
| ·RAPD及其在水产研究中的应用 | 第16-17页 |
| ·线粒体DNA及其在水产研究中的应用 | 第17页 |
| ·AFLP及其在水产研究中的应用 | 第17页 |
| ·SSR及其在水产研究中的应用 | 第17-18页 |
| ·单核苷酸多态性技术 | 第18页 |
| 3 微卫星标记在水产动物中的应用前景 | 第18-20页 |
| ·群体遗传变异分析 | 第18-19页 |
| ·物种鉴定与亲缘关系研究 | 第19页 |
| ·系统发育和进化研究 | 第19页 |
| ·遗传图谱构建和基因定位 | 第19-20页 |
| ·辅助育种 | 第20页 |
| ·资源管理和保护 | 第20页 |
| 4 微卫星位点的筛选 | 第20-24页 |
| ·从数据库中查找微卫星位点 | 第21页 |
| ·从相近物种获得微卫星引物 | 第21页 |
| ·从基因组DNA中筛选微卫星位点 | 第21-24页 |
| ·杂交法富集微卫星 | 第22-23页 |
| ·引物法富集微卫星 | 第23页 |
| ·PIMA法 | 第23-24页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 第2章 青岚湖五种淡水蚌群体的微卫星DNA分析 | 第26-55页 |
| 1 材料和方法 | 第26-34页 |
| ·样本采集 | 第26页 |
| ·主要仪器及试剂 | 第26-28页 |
| ·主要仪器 | 第26页 |
| ·主要试剂 | 第26-27页 |
| ·溶液的配制 | 第27-28页 |
| ·基因组DNA的提取和检测 | 第28-29页 |
| ·微卫星引物的筛选及PCR反应体系的优化 | 第29-31页 |
| ·微卫星引物的来源 | 第29页 |
| ·微卫星引物的筛选 | 第29-30页 |
| ·PCR反应体系的优化 | 第30-31页 |
| ·微卫星多态扩增及扩增产物检测 | 第31页 |
| ·数据处理与分析 | 第31-34页 |
| ·等位基因频率 | 第32页 |
| ·遗传杂合度和平均遗传杂合度 | 第32页 |
| ·多态信息含量 | 第32页 |
| ·有效等位基因数 | 第32-33页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检验 | 第33页 |
| ·F-统计量 | 第33页 |
| ·遗传距离 | 第33-34页 |
| ·聚类分析 | 第34页 |
| 2 结果与分析 | 第34-48页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第34页 |
| ·微卫星引物筛选结果 | 第34-36页 |
| ·PCR反应体系优化结果 | 第36-37页 |
| ·模板DNA浓度的优化结果 | 第36页 |
| ·dNTPs的优化结果 | 第36页 |
| ·引物浓度的优化结果 | 第36-37页 |
| ·Mg~(2+)浓度的优化结果 | 第37页 |
| ·Taq DNA聚合酶浓度的优化结果 | 第37页 |
| ·退火温度的优化 | 第37页 |
| ·8个微卫星位点PCR扩增结果 | 第37-40页 |
| ·五种蚌群体微卫星位点的多态性 | 第40-48页 |
| ·等位基因和基因频率 | 第40-43页 |
| ·各种群各位点的多态信息含量和杂和度 | 第43-45页 |
| ·各种群各位点的Hardy-Weinberg平衡检验 | 第45-46页 |
| ·微卫星位点的遗传分化 | 第46-47页 |
| ·各个种群间的遗传距离 | 第47页 |
| ·聚类分析 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48-53页 |
| ·关于样本含量 | 第48页 |
| ·关于固定组织基因组DNA的提取 | 第48页 |
| ·影响PCR扩增及银染效果的主要因素 | 第48-49页 |
| ·影响PCR扩增的因素 | 第48-49页 |
| ·影响聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测效果的因素 | 第49页 |
| ·关于“影子带”的问题 | 第49-50页 |
| ·关于特异的微卫星位点 | 第50页 |
| ·关于种群内和种群间遗传变异 | 第50-52页 |
| ·等位基因和基因频率 | 第50-51页 |
| ·杂合度和多态信息含量 | 第51-52页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡 | 第52页 |
| ·遗传距离和聚类分析 | 第52页 |
| ·微卫星在我国淡水蚌研究中的前景及对淡水蚌保护的建议 | 第52-53页 |
| 4 小结 | 第53-55页 |
| 第3章 三角帆蚌微卫星DNA的分离 | 第55-65页 |
| 1 材料和方法 | 第55-59页 |
| ·实验材料 | 第55-56页 |
| ·样本采集 | 第55页 |
| ·质粒和菌株 | 第55-56页 |
| ·引物 | 第56页 |
| ·实验仪器和药品 | 第56-57页 |
| ·实验仪器 | 第56页 |
| ·主要药品和试剂 | 第56-57页 |
| ·主要溶液的配制 | 第57页 |
| ·小片段基因组文库的构建 | 第57-58页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第57页 |
| ·小片段基因组DNA的获得和纯化 | 第57页 |
| ·质粒DNA的提取和酶切 | 第57-58页 |
| ·连接 | 第58页 |
| ·转化 | 第58页 |
| ·PCR扩增筛选含有微卫星序列的阳性克隆 | 第58页 |
| ·含微卫星序列的阳性克隆DNA序列测定 | 第58页 |
| ·DNA序列分析 | 第58-59页 |
| 2 实验结果 | 第59-63页 |
| ·三角帆蚌基因组DNA的提取结果 | 第59页 |
| ·三角帆蚌基因组DNA酶切结果 | 第59页 |
| ·质粒DNA提取和酶切结果 | 第59-60页 |
| ·PCR法筛选阳性克隆的结果 | 第60-61页 |
| ·DNA测序结果 | 第61-63页 |
| 3 讨论 | 第63-64页 |
| ·微卫星标记分离方法的选择 | 第63页 |
| ·关于酶切基因组DNA的回收和纯化 | 第63页 |
| ·关于重组阳性克隆的PCR筛选 | 第63页 |
| ·关于三角帆蚌微卫星序列的类型 | 第63-64页 |
| 4 小结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-73页 |
| 致谢 | 第73页 |