| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-46页 |
| ·环境微生物及研究发展历程 | 第13-14页 |
| ·环境微生物的定义 | 第13-14页 |
| ·传统环境微生物研究方法的局限 | 第14页 |
| ·环境微生物研究的新发展 | 第14页 |
| ·基于165 rRNA/rDNA 序列分析的分子生态学技术在环境微生物研究中的应用现状 | 第14-46页 |
| ·分子生物学概述 | 第14-18页 |
| ·分子生物学的基本含义 | 第14-15页 |
| ·分子生物学的发展历程 | 第15-17页 |
| ·分子生物学的主要研究内容 | 第17-18页 |
| ·分子生物学的新发展—分子生态学 | 第18页 |
| ·165 rRNA/rDNA 序列分析技术在环境微生物研究中的应用现状 | 第18-46页 |
| ·165 rRNA/rDNA 序列分析技术的基本原理 | 第19-20页 |
| ·核酸提取与纯化 | 第20-22页 |
| ·165 rRNA/rDNA 序列的PCR 扩增 | 第22-23页 |
| ·梯度凝胶电泳技术 | 第23-27页 |
| ·限制性片段长度多态性（RFLP）分析 | 第27-28页 |
| ·末端限制性片段长度多态性（TRFLP）分析 | 第28页 |
| ·扩增性限制性酶切片段分析（ARDRA） | 第28-30页 |
| ·随机扩增多态性分析（RAPD） | 第30-32页 |
| ·DNA 单链构象多态性（SSCP）分析 | 第32-36页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第36-41页 |
| ·荧光原位杂交（FISH） | 第41-43页 |
| ·生物芯片 | 第43-46页 |
| 第二章 DNA 提取与纯化技术研究 | 第46-62页 |
| ·材料与方法 | 第46-55页 |
| ·材料 | 第46-48页 |
| ·实验设备 | 第46-47页 |
| ·样品来源 | 第47页 |
| ·样品的初处理 | 第47-48页 |
| ·实验方法 | 第48-55页 |
| ·总DNA 的提取 | 第48-50页 |
| ·DNA 的纯化 | 第50-51页 |
| ·完整细胞的显微计数 | 第51页 |
| ·DNA 回收 | 第51-52页 |
| ·DNA 和腐殖酸浓度的测定 | 第52页 |
| ·PCR 扩增 | 第52-53页 |
| ·限制性片段长度多态性（RFLP）分析 | 第53页 |
| ·PCR 产物的DGGE 分析 | 第53-55页 |
| ·结果与讨论 | 第55-61页 |
| ·细胞裂解效率 | 第55-56页 |
| ·腐殖酸类物质含量 | 第56-57页 |
| ·提取周期及DNA 回收效率 | 第57-58页 |
| ·DNA 产量和纯度 | 第58-59页 |
| ·RFLP 分析 | 第59-60页 |
| ·DGGE 分析 | 第60-61页 |
| ·结论 | 第61-62页 |
| 第三章 165 rRNA/rDNA 序列分析技术研究堆肥微生物群落结构 | 第62-81页 |
| ·材料与方法 | 第63-70页 |
| ·材料 | 第63页 |
| ·堆肥 | 第63页 |
| ·采样 | 第63页 |
| ·实验方法 | 第63-70页 |
| ·参数测定 | 第63-66页 |
| ·DNA 提取与纯化 | 第66-67页 |
| ·PCR 扩增 | 第67-68页 |
| ·DGGE 分析 | 第68-69页 |
| ·DGGE 图谱相似性（Cs）分析 | 第69页 |
| ·切胶测序 | 第69页 |
| ·系统发育分析 | 第69-70页 |
| ·结果与讨论 | 第70-80页 |
| ·堆肥化过程中的参数变化 | 第70-71页 |
| ·堆肥样品基因组总DNA 的提取与PCR 扩增 | 第71-72页 |
| ·PCR 扩增 | 第72-73页 |
| ·DGGE 指纹图谱结果与Cs 值分析 | 第73-78页 |
| ·嗜热细菌系统发育分析 | 第78-80页 |
| ·结论 | 第80-81页 |
| 第四章 165 rRNA/rDNA 序列分析技术研究序批式生物膜脱氮反应器中细菌群落动态变化 | 第81-95页 |
| ·材料与方法 | 第82-85页 |
| ·材料 | 第82页 |
| ·SBBR 处理工艺 | 第82页 |
| ·生物膜取样 | 第82页 |
| ·实验方法 | 第82-85页 |
| ·生物膜总DNA 提取与纯化 | 第82-83页 |
| ·PCR 扩增 | 第83-84页 |
| ·DGGE 分析 | 第84页 |
| ·统计分析 | 第84页 |
| ·切胶测序和系统发育分析 | 第84-85页 |
| ·结果与讨论 | 第85-93页 |
| ·SBBR 反应器的运行情况 | 第85页 |
| ·DNA 提取与纯化以及PCR 扩增 | 第85-87页 |
| ·DGGE 图谱的细菌多样性统计分析 | 第87-89页 |
| ·细菌系统发育分析 | 第89-93页 |
| ·结论 | 第93-95页 |
| 结论 | 第95-98页 |
| 参考文献 | 第98-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
| 附录A 攻读学位期间发表论文、参与著作和发明专利目录 | 第111-112页 |
