基于雷琼牛和海子水牛Cytochrome b和Alcohol dehydrogenase基因序列分析探讨分子钟检验以及其系统地位
| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-16页 |
| ·引言 | 第9页 |
| ·分子钟假说 | 第9-10页 |
| ·雷琼牛资源现状及分子系统学研究 | 第10-11页 |
| ·cytb 基因及其在牛亚科家畜种的研究应用 | 第11页 |
| ·ADH 基因的研究应用 | 第11-12页 |
| ·利用 DNA 序列构建系统树的方法 | 第12-15页 |
| ·距离法 | 第12-14页 |
| ·最大简约法 | 第14页 |
| ·最大似然法 | 第14-15页 |
| ·贝叶斯推断法 | 第15页 |
| 本研究要解决的问题 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-21页 |
| ·样本采集 | 第16页 |
| ·总 DNA 的提取及检测 | 第16-17页 |
| ·DNA 的提取 | 第16-17页 |
| ·DNA 质量检测 | 第17页 |
| ·引物设计、PCR 扩增及扩增产物检测 | 第17-19页 |
| ·引物设计 | 第17-18页 |
| ·PCR 扩增 | 第18-19页 |
| ·扩增产物检测 | 第19页 |
| ·PCR 产物的回收、纯化与测序 | 第19-20页 |
| ·数据统计分析方法 | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-42页 |
| ·DNA 提取结果 | 第21页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第21-23页 |
| ·测序结果 | 第23页 |
| ·序列分析 | 第23-27页 |
| ·cytb 基因序列分析 | 第23-26页 |
| ·ADH 基因序列分析 | 第26-27页 |
| ·系统树构建与检验 | 第27-41页 |
| ·分子钟检验 | 第27-33页 |
| ·系统发育检验 | 第33页 |
| ·系统树构建 | 第33-41页 |
| ·物种分歧时间估计 | 第41-42页 |
| 4 讨论 | 第42-45页 |
| ·核苷酸替代模型与序列长度 | 第42页 |
| ·序列类型 | 第42-43页 |
| ·进化速率 | 第43-44页 |
| ·雷琼牛系统地位以及遗传多样性 | 第44页 |
| ·海子水牛系统地位以及遗传多样性 | 第44-45页 |
| 5 结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-50页 |
| 附录 | 第50-58页 |
| 附录 各基因部分测序图谱 | 第50-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第59页 |
