| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-28页 |
| ·数量性状位点(QTL)在植物抗旱相关性状研究中的应用 | 第10-19页 |
| ·QTL在水稻抗旱相关性状研究中的应用 | 第10-14页 |
| ·QTL在高梁抗旱相关性状研究中的应用 | 第14-16页 |
| ·QTL在玉米抗旱相关性状研究中的应用 | 第16-17页 |
| ·问题及展望 | 第17-19页 |
| ·植物抗旱相关基因的研究进展 | 第19-25页 |
| ·渗透调节的关键基因 | 第19-21页 |
| ·水分胁迫反应基因 | 第21-22页 |
| ·信号传递的调控基因 | 第22-24页 |
| ·活性氧清除相关的酶基因 | 第24-25页 |
| ·问题及展望 | 第25页 |
| ·生物信息学在植物QTL研究中的进展 | 第25-28页 |
| ·植物QTL相关的数据库 | 第25-26页 |
| ·植物QTL相关的分子标记数据库 | 第26页 |
| ·生物芯片技术在植物QTL研究中的应用 | 第26-28页 |
| 第二章 构建基于QTL整合图谱的基因鉴定方法及在抗旱研究中的应用 | 第28-55页 |
| ·摘要 | 第28-30页 |
| ·数据和方法 | 第30-33页 |
| ·数据的获得 | 第30页 |
| ·基于遗传图谱的QTL整合方法 | 第30-31页 |
| ·基于物理图谱的QTL整合方法 | 第31页 |
| ·利用QTL信息进行作物功能基因电子克隆的方法 | 第31-33页 |
| ·结果与分析 | 第33-49页 |
| ·水稻抗旱QTL遗传图谱的整合 | 第33-35页 |
| ·高梁抗旱QTL遗传图谱的整合 | 第35-37页 |
| ·玉米抗旱QTL遗传图谱的整合 | 第37-39页 |
| ·基于物理图谱的数据整合结果 | 第39-44页 |
| ·基于物理图谱的抗旱功能基因的电子克隆 | 第44-46页 |
| ·候选基因的功能验证 | 第46-49页 |
| ·讨论 | 第49-55页 |
| ·不同作物抗旱QTL作图比较 | 第49-51页 |
| ·基因和QTL的聚集现象 | 第51页 |
| ·功能基因电子克隆方法的比较 | 第51-54页 |
| ·面临的困难与下一阶段的任务 | 第54-55页 |
| 第三章 PlantQTL-GE:植物QTL相关候选基因鉴定和功能预测的数据库 | 第55-72页 |
| ·PlantQTL-GE数据库的设计与实现 | 第55-67页 |
| ·功能介绍 | 第55-59页 |
| ·数据库基本框架 | 第59-61页 |
| ·数据库构建的方法 | 第61-67页 |
| ·数据库应用实例:目标QTL区间内抗旱相关EST表达谱分析与候选基因筛选 | 第67-72页 |
| ·RM241-RM349区间内抗旱相关EST筛选 | 第68页 |
| ·有预测功能的候选基因选择 | 第68-70页 |
| ·转录因子候选基因筛选 | 第70-72页 |
| 第四章 PMBA:植物QTL相关芯片数据分析软件 | 第72-82页 |
| ·软件开发要求 | 第72页 |
| ·软件的功能 | 第72-77页 |
| ·水稻和拟南芥cDNA芯片数据的输入 | 第73页 |
| ·本地BLAST功能 | 第73-74页 |
| ·远程BLAST功能 | 第74-75页 |
| ·数据转换功能 | 第75页 |
| ·芯片数据和数量性状位点(QTL)数据的整合 | 第75-76页 |
| ·QTL内部基因的GO分类 | 第76-77页 |
| ·PMBA在抗旱研究中的应用 | 第77-81页 |
| ·差异表达基因的BLAST分析 | 第77-78页 |
| ·差异表达基因与QTL的综合分析 | 第78-79页 |
| ·RM241-RM349 QTL区间内基因的GO分类 | 第79-81页 |
| ·软件的更新 | 第81-82页 |
| 第五章 总结与展望 | 第82-84页 |
| ·总结 | 第82-83页 |
| ·进一步研究的方向 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-95页 |
| 附录一 在读期间获得的科研成果 | 第95-96页 |
| 附录二 PlantQTL-GE数据库核心源码 | 第96-105页 |
| 附录三 PMBA芯片分析软件核心源码 | 第105-111页 |
| 至谢 | 第111-112页 |
