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高、低硝态氮营养条件下烟草根系的转录组学分析

致谢第4-7页
摘要第7-8页
1. 文献综述第8-15页
    1.1 氮素营养胁迫对植物生长发育的影响第8-12页
        1.1.1 氮素营养胁迫对植物器官的影响第8-9页
            1.1.1.1 根系第8页
            1.1.1.2 叶片第8-9页
            1.1.1.3 种子、花第9页
        1.1.2 氮素营养对烟草生长及烟叶质量的影响第9-10页
            1.1.2.1 氮素营养对烟草生长的影响第9页
            1.1.2.2 氮素营养对烟叶质量的影响第9-10页
        1.1.3 氮素胁迫对基因表达的影响第10-12页
            1.1.3.1 氮素胁迫响应基因的研究第10-11页
            1.1.3.2 硝酸根调控基因的表达第11-12页
    1.2 转录组学的相关研究研究及其在植物上的应用第12-14页
        1.2.1 转录组测序技术第12-13页
        1.2.2 转录组学的应用第13-14页
    1.3 研究的目的和意义第14-15页
2. 引言第15-16页
3. 材料与方法第16-18页
    3.1 供试品种及实验方法第16页
    3.2 RNA提取及测序第16页
    3.3 测序数据质量评估分析第16-17页
    3.4 样本相关性分析第17页
    3.5 差异基因的筛选第17页
    3.6 聚类分析、GO富集分析、KEGG富集分析第17-18页
4. 结果与分析第18-43页
    4.1 测序产质量评估第18-23页
        4.1.1 测序数据的产量统计第18-19页
        4.1.2 参考序列比对第19-20页
        4.1.3 测序饱和度分析第20-21页
        4.1.4 测序随机性分析第21-23页
    4.2 样本相关性分析第23-25页
    4.3 差异基因的筛选第25页
    4.4 两种氮营养条件下差异表达基因分析第25-34页
        4.4.1 差异表达基因聚类分析第25-27页
        4.4.2 差异表达基因GO富集分析第27-29页
            4.4.2.1 低氮营养条件下差异表达基因GO富集分析第27-28页
            4.4.2.2 高氮营养条件下差异表达基因GO分析第28-29页
        4.4.3 差异表达基因KEGG富集分析第29-34页
            4.4.3.1 低氮营养条件下差异表达基因的KEGG分析第29-31页
            4.4.3.2 高氮水平营养条件下差异表达基因的KEGG分析第31-32页
            4.4.3.3 高、低氮营养条件下相同KEGG代谢途径分析第32-34页
    4.5 两种氮营养条件下差异转录因子分析第34-43页
        4.5.1 差异表达转录因子聚类分析第34-35页
        4.5.2 两种氮营养条件下差异表达转录因子的GO功能富集分析第35-38页
            4.5.2.1 低氮营养条件下差异表达转录因子的GO功能富集分析第35-37页
            4.5.2.2 高氮营养条件下差异表达转录因子的GO功能富集分析第37-38页
        4.5.3 两种氮营养条件下差异表达转录因子的KEGG功能富集分析第38-43页
            4.5.3.1 低氮营养条件下差异表达转录因子的KEGG功能富集分析第38-41页
            4.5.3.2 高氮营养条件下差异表达转录因子的KEGG功能富集分析第41-43页
5. 讨论第43-46页
    5.1 差异表达基因第43-45页
    5.2 差异表达转录因子第45-46页
6. 结论第46-47页
参考文献第47-54页
英文摘要第54-55页

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