致谢 | 第4-7页 |
摘要 | 第7-8页 |
1. 文献综述 | 第8-15页 |
1.1 氮素营养胁迫对植物生长发育的影响 | 第8-12页 |
1.1.1 氮素营养胁迫对植物器官的影响 | 第8-9页 |
1.1.1.1 根系 | 第8页 |
1.1.1.2 叶片 | 第8-9页 |
1.1.1.3 种子、花 | 第9页 |
1.1.2 氮素营养对烟草生长及烟叶质量的影响 | 第9-10页 |
1.1.2.1 氮素营养对烟草生长的影响 | 第9页 |
1.1.2.2 氮素营养对烟叶质量的影响 | 第9-10页 |
1.1.3 氮素胁迫对基因表达的影响 | 第10-12页 |
1.1.3.1 氮素胁迫响应基因的研究 | 第10-11页 |
1.1.3.2 硝酸根调控基因的表达 | 第11-12页 |
1.2 转录组学的相关研究研究及其在植物上的应用 | 第12-14页 |
1.2.1 转录组测序技术 | 第12-13页 |
1.2.2 转录组学的应用 | 第13-14页 |
1.3 研究的目的和意义 | 第14-15页 |
2. 引言 | 第15-16页 |
3. 材料与方法 | 第16-18页 |
3.1 供试品种及实验方法 | 第16页 |
3.2 RNA提取及测序 | 第16页 |
3.3 测序数据质量评估分析 | 第16-17页 |
3.4 样本相关性分析 | 第17页 |
3.5 差异基因的筛选 | 第17页 |
3.6 聚类分析、GO富集分析、KEGG富集分析 | 第17-18页 |
4. 结果与分析 | 第18-43页 |
4.1 测序产质量评估 | 第18-23页 |
4.1.1 测序数据的产量统计 | 第18-19页 |
4.1.2 参考序列比对 | 第19-20页 |
4.1.3 测序饱和度分析 | 第20-21页 |
4.1.4 测序随机性分析 | 第21-23页 |
4.2 样本相关性分析 | 第23-25页 |
4.3 差异基因的筛选 | 第25页 |
4.4 两种氮营养条件下差异表达基因分析 | 第25-34页 |
4.4.1 差异表达基因聚类分析 | 第25-27页 |
4.4.2 差异表达基因GO富集分析 | 第27-29页 |
4.4.2.1 低氮营养条件下差异表达基因GO富集分析 | 第27-28页 |
4.4.2.2 高氮营养条件下差异表达基因GO分析 | 第28-29页 |
4.4.3 差异表达基因KEGG富集分析 | 第29-34页 |
4.4.3.1 低氮营养条件下差异表达基因的KEGG分析 | 第29-31页 |
4.4.3.2 高氮水平营养条件下差异表达基因的KEGG分析 | 第31-32页 |
4.4.3.3 高、低氮营养条件下相同KEGG代谢途径分析 | 第32-34页 |
4.5 两种氮营养条件下差异转录因子分析 | 第34-43页 |
4.5.1 差异表达转录因子聚类分析 | 第34-35页 |
4.5.2 两种氮营养条件下差异表达转录因子的GO功能富集分析 | 第35-38页 |
4.5.2.1 低氮营养条件下差异表达转录因子的GO功能富集分析 | 第35-37页 |
4.5.2.2 高氮营养条件下差异表达转录因子的GO功能富集分析 | 第37-38页 |
4.5.3 两种氮营养条件下差异表达转录因子的KEGG功能富集分析 | 第38-43页 |
4.5.3.1 低氮营养条件下差异表达转录因子的KEGG功能富集分析 | 第38-41页 |
4.5.3.2 高氮营养条件下差异表达转录因子的KEGG功能富集分析 | 第41-43页 |
5. 讨论 | 第43-46页 |
5.1 差异表达基因 | 第43-45页 |
5.2 差异表达转录因子 | 第45-46页 |
6. 结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-54页 |
英文摘要 | 第54-55页 |