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盐胁迫下西伯利亚蓼cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析

摘要第1-4页
英文摘要第4-8页
1 前言第8-30页
   ·植物的耐盐生理第8-10页
     ·盐胁迫对植物生理生化的影响第9-10页
     ·盐胁迫效应第10页
   ·植物的耐盐机理第10-15页
     ·离子摄入和区隔化第10-11页
     ·渗透调节第11-12页
     ·盐胁迫诱导蛋白第12-14页
     ·脱落酸第14-15页
     ·酶活性与膜系统的完整性第15页
   ·林木耐盐育种研究第15-16页
   ·基因组学及其研究内容第16-20页
     ·结构基因组学第17-18页
     ·比较基因组学第18-19页
     ·功能基因组学第19页
     ·蛋白质组学和功能蛋白质组学第19-20页
     ·基因组学相关学科第20页
   ·生物信息学第20-25页
     ·生物信息学及其组成第20-21页
     ·生物信息学数据库第21页
     ·数据库查询和数据库搜索第21-24页
     ·生物信息学的主要应用领域第24-25页
   ·表达序列标签第25-27页
     ·EST信息分析的基本思路第25-26页
     ·表达序列标签的应用第26页
     ·植物的表达序列标签第26-27页
   ·DNA测序技术第27-30页
     ·高速发展的测序技术第27-28页
     ·阵列毛细管电泳第28-30页
2 材料与方法第30-49页
   ·实验材料第30-32页
     ·研究材料第30页
     ·菌种与载体第30页
     ·酶及化学试剂第30-31页
     ·引物第31页
     ·培养基配方第31页
     ·主要仪器设备第31-32页
     ·分析软件第32页
   ·实验方法第32-49页
     ·CTAB法提取总RNA第32-33页
     ·磁性球珠分离Poly(A)RNA第33-35页
     ·cDNA第一链合成第35-37页
     ·cDNA第二链合成第37页
     ·cDNA末端处理与分部收集第37-40页
     ·cDNA连接与包装第40-41页
     ·插入片段的PCR检测第41-42页
     ·噬菌体体外切除第42-43页
     ·菌体(质粒)培养第43-44页
     ·模板制备第44页
     ·测序PCR反应第44-46页
     ·上机测序第46页
     ·序列分析第46页
     ·序列分析软件第46-49页
3 结果与分析第49-68页
   ·总RNA的提取和MRNA的分离第49-51页
     ·总RNA提取方法的改良第49-50页
     ·mRNA的分离第50-51页
   ·cDNA文库的构建及质量检测第51-53页
     ·cDNA的合成及纯化第51-52页
     ·cDNA的克隆与体外包装第52页
     ·文库滴度及重组率测定第52-53页
     ·文库插入片段的PCR检测第53页
     ·文库扩增后的滴度测定第53页
   ·DNA序列测定第53-56页
     ·DNA模板第54-55页
     ·测序引物第55-56页
     ·测序循环反应后的纯化操作第56页
     ·仪器的设置和维护第56页
   ·序列软件分析第56-68页
     ·EST数据库的基本信息第56-57页
     ·一致序列的获得第57-59页
     ·网上序列比对第59页
     ·有相似序列的序列分析第59-65页
     ·未知基因预测第65-68页
4 结论第68-69页
参考文献第69-73页
附录第73-87页
 缩略词表第73-74页
 BLAST比对相似性较高的物种、基因及表达产物第74-83页
 附图第83-87页
致谢第87页

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