盐胁迫下西伯利亚蓼cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析
摘要 | 第1-4页 |
英文摘要 | 第4-8页 |
1 前言 | 第8-30页 |
·植物的耐盐生理 | 第8-10页 |
·盐胁迫对植物生理生化的影响 | 第9-10页 |
·盐胁迫效应 | 第10页 |
·植物的耐盐机理 | 第10-15页 |
·离子摄入和区隔化 | 第10-11页 |
·渗透调节 | 第11-12页 |
·盐胁迫诱导蛋白 | 第12-14页 |
·脱落酸 | 第14-15页 |
·酶活性与膜系统的完整性 | 第15页 |
·林木耐盐育种研究 | 第15-16页 |
·基因组学及其研究内容 | 第16-20页 |
·结构基因组学 | 第17-18页 |
·比较基因组学 | 第18-19页 |
·功能基因组学 | 第19页 |
·蛋白质组学和功能蛋白质组学 | 第19-20页 |
·基因组学相关学科 | 第20页 |
·生物信息学 | 第20-25页 |
·生物信息学及其组成 | 第20-21页 |
·生物信息学数据库 | 第21页 |
·数据库查询和数据库搜索 | 第21-24页 |
·生物信息学的主要应用领域 | 第24-25页 |
·表达序列标签 | 第25-27页 |
·EST信息分析的基本思路 | 第25-26页 |
·表达序列标签的应用 | 第26页 |
·植物的表达序列标签 | 第26-27页 |
·DNA测序技术 | 第27-30页 |
·高速发展的测序技术 | 第27-28页 |
·阵列毛细管电泳 | 第28-30页 |
2 材料与方法 | 第30-49页 |
·实验材料 | 第30-32页 |
·研究材料 | 第30页 |
·菌种与载体 | 第30页 |
·酶及化学试剂 | 第30-31页 |
·引物 | 第31页 |
·培养基配方 | 第31页 |
·主要仪器设备 | 第31-32页 |
·分析软件 | 第32页 |
·实验方法 | 第32-49页 |
·CTAB法提取总RNA | 第32-33页 |
·磁性球珠分离Poly(A)RNA | 第33-35页 |
·cDNA第一链合成 | 第35-37页 |
·cDNA第二链合成 | 第37页 |
·cDNA末端处理与分部收集 | 第37-40页 |
·cDNA连接与包装 | 第40-41页 |
·插入片段的PCR检测 | 第41-42页 |
·噬菌体体外切除 | 第42-43页 |
·菌体(质粒)培养 | 第43-44页 |
·模板制备 | 第44页 |
·测序PCR反应 | 第44-46页 |
·上机测序 | 第46页 |
·序列分析 | 第46页 |
·序列分析软件 | 第46-49页 |
3 结果与分析 | 第49-68页 |
·总RNA的提取和MRNA的分离 | 第49-51页 |
·总RNA提取方法的改良 | 第49-50页 |
·mRNA的分离 | 第50-51页 |
·cDNA文库的构建及质量检测 | 第51-53页 |
·cDNA的合成及纯化 | 第51-52页 |
·cDNA的克隆与体外包装 | 第52页 |
·文库滴度及重组率测定 | 第52-53页 |
·文库插入片段的PCR检测 | 第53页 |
·文库扩增后的滴度测定 | 第53页 |
·DNA序列测定 | 第53-56页 |
·DNA模板 | 第54-55页 |
·测序引物 | 第55-56页 |
·测序循环反应后的纯化操作 | 第56页 |
·仪器的设置和维护 | 第56页 |
·序列软件分析 | 第56-68页 |
·EST数据库的基本信息 | 第56-57页 |
·一致序列的获得 | 第57-59页 |
·网上序列比对 | 第59页 |
·有相似序列的序列分析 | 第59-65页 |
·未知基因预测 | 第65-68页 |
4 结论 | 第68-69页 |
参考文献 | 第69-73页 |
附录 | 第73-87页 |
缩略词表 | 第73-74页 |
BLAST比对相似性较高的物种、基因及表达产物 | 第74-83页 |
附图 | 第83-87页 |
致谢 | 第87页 |