| 提要 | 第1-6页 |
| 第一章 引言 | 第6-19页 |
| ·蛋白质-DNA 相互作用 | 第6-9页 |
| ·DNA 结合蛋白 | 第9-12页 |
| ·生物信息学概述 | 第12-14页 |
| ·研究目的与方法 | 第14-16页 |
| ·研究现状 | 第16-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-38页 |
| ·数据集 | 第19-21页 |
| ·DNA 结合氨基酸残基的定义 | 第21-22页 |
| ·氨基酸残基与DNA 结合的偏好性 | 第22-23页 |
| ·分类特征的提取 | 第23-29页 |
| ·支持向量机的构建 | 第29-34页 |
| ·分类器评估 | 第34-37页 |
| ·编程实现 | 第37-38页 |
| 第三章 结果 | 第38-56页 |
| ·DNA 结合氨基酸残基的组成偏向性 | 第38-41页 |
| ·核函数参数的优化 | 第41-44页 |
| ·不同氨基酸分类特征下DNA 结合氨基酸残基的预测 | 第44-50页 |
| ·序列环境在预测中的作用 | 第50-51页 |
| ·DNA 结合氨基酸残基预测方法的效果例证 | 第51-56页 |
| 第四章 讨论 | 第56-61页 |
| ·阴性数据与阳性数据的平衡问题 | 第56-57页 |
| ·参数优化中的计算问题 | 第57-58页 |
| ·预测结果比较分析 | 第58-60页 |
| ·预测方法验证分析 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 摘要 | 第68-70页 |
| Abstract | 第70-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 导师简介 | 第73页 |