基于信息离散度的DNA序列相似性分析研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| ·项目来源 | 第11页 |
| ·研究背景和意义 | 第11-13页 |
| ·信息论方法在生物信息学中的应用 | 第13-15页 |
| ·论文主要工作 | 第15页 |
| ·论文结构安排 | 第15-16页 |
| ·本章小结 | 第16-17页 |
| 第2章 DNA序列相似性分析方法 | 第17-29页 |
| ·信息理论方法 | 第17-19页 |
| ·序列比对方法 | 第19-21页 |
| ·双序列比对 | 第19-20页 |
| ·多序列比对 | 第20-21页 |
| ·统计特征方法 | 第21-22页 |
| ·基于图形表示的方法 | 第22-24页 |
| ·聚类分析方法 | 第24-28页 |
| ·聚类分析的步骤 | 第24-25页 |
| ·主要的聚类方法 | 第25-27页 |
| ·生物信息处理中的聚类技术 | 第27-28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第3章 基于信息离散度的DNA序列相似性分析 | 第29-41页 |
| ·FDOD方法 | 第29-33页 |
| ·完全信息集 | 第29-30页 |
| ·FDOD函数及其性质 | 第30-31页 |
| ·FDOD方法在生物信息学中的应用 | 第31页 |
| ·FDOD方法中信息集对结果的影响 | 第31-33页 |
| ·基于BB信息离散度的DNA序列相似性分析 | 第33-35页 |
| ·BB信息集 | 第33-34页 |
| ·序列间的距离度量 | 第34页 |
| ·相似性分析的方法 | 第34-35页 |
| ·实验与结果 | 第35-40页 |
| ·实验数据 | 第35-36页 |
| ·结果与分析 | 第36-38页 |
| ·与FDOD方法的比较 | 第38-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第4章 基于广义信息距离的DNA序列直接聚类 | 第41-53页 |
| ·相关知识 | 第41-44页 |
| ·Shannon信息熵 | 第41页 |
| ·FDOD函数与Shannon熵的关系 | 第41-42页 |
| ·离散量 | 第42-43页 |
| ·离散增量不等式 | 第43-44页 |
| ·广义信息距离 | 第44页 |
| ·修正的FDOD和GID | 第44-45页 |
| ·实验和分析 | 第45-47页 |
| ·实验数据 | 第45页 |
| ·结果与分析 | 第45-47页 |
| ·基于修正的广义信息距离的直接聚类算法 | 第47-51页 |
| ·算法描述 | 第47-48页 |
| ·实验结果 | 第48-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 结论 | 第53-55页 |
| 1. 本文工作总结 | 第53-54页 |
| 2. 进一步工作展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 附录A （攻读硕士学位期间所发表的学术论文目录） | 第61页 |
