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燕麦属物种系统发育与分子进化研究

摘要第1-12页
Abstract第12-16页
第一章 概论第16-29页
 1 燕麦属的分类系统和染色体组研究第16-20页
 2 燕麦属物种系统进化研究概况及存在问题第20-26页
   ·燕麦属物种系统进化研究概况第20-25页
   ·燕麦属研究中存在的问题第25-26页
 3 本研究的目标和方法第26-29页
第二章 燕麦属细胞质基因组PCR-RFLP分析第29-38页
 1 前言第29-30页
 2 材料与方法第30-35页
   ·供试材料第30-33页
   ·实验方法第33-35页
   ·数据处理第35页
 3 结果与分析第35-37页
   ·细胞质基因组STS-PCR标记扩增产物的多态性第35页
   ·STS-PCR标记扩增产物酶切后的多样性第35-37页
 4 讨论第37-38页
第三章 叶绿体微卫星标记及其在燕麦属中的应用第38-51页
 1 前言第38-39页
 2 材料和方法第39-42页
   ·供试材料和DNA提取第39页
   ·PCR扩增和银染检测第39页
   ·基因组多样性分析第39-42页
   ·鉴别分析第42页
   ·多态信息含量和聚类分析第42页
 3 结果与分析第42-48页
   ·ccSSR标记的多态性第42页
   ·判别分析第42-45页
   ·多态信息含量和聚类分析第45-48页
 4 讨论第48-51页
   ·ccSSR分子标记的有效性分析第48-49页
   ·分类鉴别分析第49页
   ·二倍体燕麦的关系第49-50页
   ·多倍体物种的母系亲本第50-51页
第四章 利用叶绿体matK和trnL-F探讨燕麦属多倍体的母系亲本第51-61页
 1 前言第51-52页
 2 材料和方法第52-54页
   ·植物材料第52页
   ·PCR扩增第52-54页
   ·序列分析第54页
 3 结果与分析第54-58页
   ·叶绿体片段trnL-F的序列和系统进化分析第54-56页
   ·matK基因序列和系统进化分析第56-57页
   ·trnL-F和matK序列的合并分析第57-58页
 4 讨论第58-61页
   ·A基因组和C基因组的分化第58页
   ·燕麦属A基因组二倍体间的关系第58-59页
   ·燕麦属多倍体的母系亲本第59-61页
第五章 核糖体ITS序列在燕麦属中的系统进化及其系统学意义第61-76页
 1 前言第61-62页
 2 材料和方法第62-65页
   ·植物材料第62-63页
   ·扩增、克隆和测序第63-64页
   ·数据处理第64-65页
 3 结果与分析第65-70页
   ·ITS多态性第65-67页
   ·系统发育分析第67-70页
 4 讨论第70-76页
   ·ITS序列在燕麦属多倍体中的进化第70-72页
   ·ITS的进化机制第72页
   ·ITS序列在系统发育重建上的启示第72-76页
第六章 5S rRNA基因序列在燕麦属染色体组鉴定和基因组关系分析中的运用第76-104页
 1 前言第76-78页
 2 材料与方法第78-81页
   ·实验材料、DNA提取及5S rRNA基因扩增第78页
   ·克隆测序第78页
   ·序列分析第78-81页
 3 结果与分析第81-98页
   ·序列比对和5S rDNA单元类型的确定第81-96页
   ·5S rDNA各单元类型的一致序列第96-97页
   ·系统发育分析第97-98页
 4 讨论第98-104页
   ·5S rDNA各单元类型所代表的基因型第98-100页
   ·基于5S rDNA序列推测燕麦属多倍体起源第100-102页
   ·5S rDNA序列的致同进化第102-104页
第七章 利用LEAFY基因间区探讨燕麦属网状进化和多倍体起源第104-139页
 1 前言第104-105页
 2 材料和方法第105-108页
   ·植物材料第105-106页
   ·PCR扩增、克隆第106页
   ·数据分析第106-108页
 3 结果与分析第108-133页
   ·LFY intⅡ序列分析第108-118页
   ·二倍体物种A基因组和C基因组的进化分析第118-121页
   ·AABB四倍体及其相关物种的系统进化分析第121-123页
   ·AACC四倍体物种间及其与A、C基因组二倍体的关系第123-125页
   ·AACCDD物种与A、C基因组相关物种的进化分析第125-129页
   ·燕麦属不同基因组序列合并和分组的系统进化分析第129-133页
 4 讨论第133-139页
   ·燕麦属代表不同基因组的LFY intⅡ序列类型及其拷贝类型第133-135页
   ·燕麦属物种各基因组的起源和进化第135-137页
   ·六倍体燕麦的起源和进化第137-139页
第八章 燕麦属基因组特异标记开发第139-145页
 1 前言第139-140页
 2 材料和方法第140-141页
   ·植物材料第140-141页
   ·引物设计与PCR扩增第141页
 3 结果与分析第141-143页
   ·A基因组特异引物的扩增结果第141-142页
   ·D基因组特异引物的扩增结果第142-143页
 4 讨论第143-145页
结论第145-147页
参考文献第147-167页
附件 低拷贝核基因LEAFY在麦类作物系统发育中的利用评价第167-189页
 1 前言第167-171页
 2 材料和方法第171-173页
   ·植物材料第171页
   ·PCR扩增、克隆和测序第171-173页
   ·序列分析第173页
 3 结果与分析第173-182页
   ·序列基本信息比较第173-175页
   ·单倍型比较第175-177页
   ·核苷酸多样性分析第177-178页
   ·系统发育分析第178-182页
 4 讨论第182-184页
   ·LEAFY基因不同区段在系统发育分析中的利用价值评价第182-183页
   ·LEAFY基因的拷贝类型以及单拷贝基因在系统进化中的正确运用第183-184页
 参考文献第184-189页
本研究主要创新点第189-190页
致谢第190-192页
攻读博士学位期间发表和完成的论文第192页

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