基因表达数据的谱聚类方法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第12-13页 |
| 1.2 基因表达谱数据概述 | 第13-15页 |
| 1.2.1 基因表达谱数据的获取 | 第13-14页 |
| 1.2.2 基因表达谱数据的特点 | 第14-15页 |
| 1.2.3 基因表达谱数据的预处理 | 第15页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第15-17页 |
| 1.3.1 基因表达数据的聚类研究现状 | 第16页 |
| 1.3.2 谱聚类的研究现状 | 第16-17页 |
| 1.4 研究难点 | 第17-18页 |
| 1.5 主要研究目标和内容 | 第18-19页 |
| 1.6 论文结构安排 | 第19-20页 |
| 第2章 相关理论基础 | 第20-29页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 特征提取方法 | 第20-21页 |
| 2.2.1 主成份分析 | 第20-21页 |
| 2.2.2 局部线性嵌入 | 第21页 |
| 2.3 聚类算法介绍 | 第21-25页 |
| 2.3.1 基于划分的聚类算法 | 第22页 |
| 2.3.2 层次聚类算法 | 第22页 |
| 2.3.3 模糊聚类算法 | 第22-23页 |
| 2.3.4 基于网格和密度的聚类算法 | 第23页 |
| 2.3.5 谱聚类算法 | 第23-25页 |
| 2.3.5.1 非规范拉普拉斯矩阵 | 第24页 |
| 2.3.5.2 规范拉普拉斯矩阵 | 第24-25页 |
| 2.4 相似性度量方法 | 第25-26页 |
| 2.5 聚类算法的评价标准 | 第26-28页 |
| 2.6 小结 | 第28-29页 |
| 第3章 基于线性表达的谱聚类 | 第29-42页 |
| 3.1 引言 | 第29页 |
| 3.2 基于K近邻约束的稀疏表达系数的谱聚类 | 第29-32页 |
| 3.2.1 稀疏表达系数 | 第29-30页 |
| 3.2.2 K近邻约束的稀疏表达系数向量 | 第30-31页 |
| 3.2.3 构造相似度矩阵 | 第31页 |
| 3.2.4 算法描述 | 第31-32页 |
| 3.3 基于局部约束的协同表达系数的谱聚类 | 第32-34页 |
| 3.3.1 协同表达系数 | 第32-33页 |
| 3.3.2 局部约束的协同表达系数向量 | 第33页 |
| 3.3.3 算法描述 | 第33-34页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第34-41页 |
| 3.4.1 数据集描述与实验设置 | 第34-36页 |
| 3.4.2 相似度矩阵的对比分析 | 第36-37页 |
| 3.4.3 表达系数的对比分析 | 第37-38页 |
| 3.4.4 聚类结果的对比分析 | 第38-41页 |
| 3.5 小结 | 第41-42页 |
| 第4章 基于非负矩阵分解的谱聚类 | 第42-53页 |
| 4.1 引言 | 第42页 |
| 4.2 非负矩阵分解算法 | 第42-44页 |
| 4.2.1 非负矩阵分解的数学描述 | 第42-43页 |
| 4.2.2 非负矩阵分解的实现 | 第43-44页 |
| 4.3 基于非负矩阵分解的谱聚类算法 | 第44-45页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第45-52页 |
| 4.4.1 数据集描述与实验设置 | 第45-47页 |
| 4.4.2 相似度矩阵的对比分析 | 第47-48页 |
| 4.4.3 聚类结果的对比分析 | 第48-52页 |
| 4.5 小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 附录 A 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第62-63页 |
| 附录 B 攻读学位期间所参与的科研活动 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
