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太湖沉积物厌氧氨氧化细菌分布、多样性及其活性研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第1章 绪论第11-37页
    1.1 厌氧氨氧化作用研究进展第11-15页
        1.1.1 厌氧氨氧化的发现第13-14页
        1.1.2 厌氧氨氧化过程机理第14-15页
    1.2 厌氧氨氧化细菌研究进展第15-24页
        1.2.1 生理生化特征第15-17页
        1.2.2 环境分布特征第17-19页
        1.2.3 多样性研究方法进展第19-21页
        1.2.4 群落影响因素第21-24页
    1.3 厌氧氨氧化速率活性研究手段及方法学进展第24-30页
        1.3.1 厌氧氨氧化速率第24-25页
        1.3.2 研究方法与机理第25-27页
        1.3.3 厌氧氨氧化活性影响因素第27-30页
    1.4 本研究的内容与意义第30-37页
        1.4.1 研究背景及意义第30-34页
        1.4.2 研究内容与研究目标第34-35页
        1.4.3 拟解决的关键科学问题第35页
        1.4.4 技术路线第35-37页
第2章 太湖不同湖区沉积物中厌氧氨氧化细菌的水平分布特征及多样性第37-56页
    2.1 前言第37-38页
    2.2 材料与方法第38-41页
        2.2.1 采样地概况及样品采集第38-39页
        2.2.2 沉积物理化性质分析第39页
        2.2.3 沉积物DNA提取第39页
        2.2.4 厌氧和好氧氨氧化菌功能基因定量第39-40页
        2.2.5 高通量测序和DGGE图谱分析第40-41页
        2.2.6 数据统计分析第41页
    2.3 结果与分析第41-52页
        2.3.1 不同湖区沉积物理化性质第41-44页
        2.3.2 不同湖区沉积物厌氧和好氧氨氧化菌的基因丰度第44-46页
        2.3.3 不同湖区沉积物厌氧氨氧化细菌相对丰度第46-47页
        2.3.4 不同湖区沉积物氨氧化微生物丰度与环境因子关系性第47页
        2.3.5 不同湖区沉积物厌氧和好氧氨氧化细菌群落结构和聚类分析第47-51页
        2.3.6 不同湖区沉积物中厌氧和好氧氨氧化菌群落与环境因子的关系第51-52页
    2.4 讨论第52-54页
        2.4.1 不同湖区沉积物中厌氧和好氧氨氧化菌的丰度特征第52-54页
        2.4.2 不同湖区沉积物中厌氧氨氧化细菌的群落分布特征第54页
    2.5 结论第54-56页
第3章 太湖沉积物柱中厌氧氨氧化细菌的垂直分布特征与多样性第56-76页
    3.1 前言第56-57页
    3.2 材料与方法第57-61页
        3.2.1 采样地概况及样品采集第57-58页
        3.2.2 沉积物理化性质分析第58页
        3.2.3 沉积物DNA提取第58页
        3.2.4 功能基因及16S rRNA基因定量第58-59页
        3.2.5 高通量测序和生信分析第59-61页
        3.2.6 数据统计分析第61页
    3.3 结果与分析第61-72页
        3.3.1 沉积物理化性质的垂直变化第61-65页
        3.3.2 沉积物厌氧氨氧化细菌功能基因丰度垂直变化第65-66页
        3.3.3 沉积物厌氧氨氧化细菌群落组成的垂直变化第66-69页
        3.3.4 沉积物厌氧氨氧化细菌多样性的垂直变化第69页
        3.3.5 环境因子与沉积物厌氧氨氧化细菌丰度、群落和多样性的关系第69-72页
    3.4 讨论第72-75页
        3.4.1 太湖沉积物中厌氧氨氧化细菌丰度垂直变化特征第72-73页
        3.4.2 太湖沉积物中厌氧氨氧化细菌群落的垂直变化特征第73-75页
    3.5 小结第75-76页
第4章 太湖沉积物厌氧氨氧化活性及其对环境因子的响应第76-92页
    4.1 前言第76页
    4.2 材料与方法第76-79页
        4.2.1 样品采集第76-77页
        4.2.2 沉积物理化性质分析第77页
        4.2.3 沉积物好氧氨氧化速率的测定第77页
        4.2.4 沉积物厌氧氨氧化速率和反硝化速率的测定第77-78页
        4.2.5 pH值响应实验第78页
        4.2.6 碳源响应实验第78-79页
    4.3 结果与分析第79-87页
        4.3.1 太湖沉积物的好氧氨氧化速率第79-80页
        4.3.2 太湖沉积物的厌氧氨氧化速率和反硝化速率第80-81页
        4.3.3 太湖沉积物中厌氧氨氧化对N素转化的贡献第81-82页
        4.3.4 氨氧化速率、反硝化速率与环境因子的关系第82-84页
        4.3.5 太湖沉积物厌氧氨氧化活性对pH值的响应第84-86页
        4.3.6 添加碳源对厌氧氨氧化速率的影响第86页
        4.3.7 添加碳源对N_2O和CO_2浓度的影响第86-87页
    4.4 讨论第87-91页
        4.4.1 太湖沉积物中厌氧氨氧化速率与好氧氨氧化的关系第87-88页
        4.4.2 太湖沉积物中厌氧氨氧化活性对N素转化的贡献第88-89页
        4.4.3 太湖沉积物中厌氧氨氧化活性对环境因子的响应第89-91页
    4.5 结论第91-92页
第5章 总结及展望第92-95页
    5.1 总结第92-93页
    5.2 研究特色与创新点第93-94页
    5.3 不足与展望第94-95页
参考文献第95-118页
附录 Ⅰ第118-120页
附录 Ⅱ第120-121页
致谢第121-122页

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