| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 课题来源 | 第9页 |
| 1.2 课题研究背景及目的意义 | 第9-12页 |
| 1.2.1 课题背景 | 第9-10页 |
| 1.2.2 课题目的和意义 | 第10-12页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第12-14页 |
| 1.4 主要研究内容 | 第14-15页 |
| 1.5 论文组织结构 | 第15-17页 |
| 第2章 相关技术知识综述 | 第17-28页 |
| 2.1 引言 | 第17页 |
| 2.2 测序技术简介 | 第17-19页 |
| 2.3 拼接策略介绍 | 第19-23页 |
| 2.3.1 Greedy-extension策略 | 第19-20页 |
| 2.3.2 Overlap-Layout-Consensus策略 | 第20-21页 |
| 2.3.3 deBruijn图策略 | 第21-23页 |
| 2.4 宏基因组序列拼接相关知识介绍 | 第23-27页 |
| 2.4.1 微生物分类等级 | 第23-24页 |
| 2.4.2 文件格式介绍 | 第24-25页 |
| 2.4.3 宏基因组拼接 | 第25-27页 |
| 2.5 本章小结 | 第27-28页 |
| 第3章 宏基因组拼接算法设计 | 第28-49页 |
| 3.1 引言 | 第28-29页 |
| 3.2 MEGAHIT的研究分析 | 第29-34页 |
| 3.2.1 MEGAHIT介绍 | 第29-31页 |
| 3.2.2 MEGAHIT存在问题分析 | 第31-34页 |
| 3.3 简单分叉结构移除算法 | 第34-38页 |
| 3.3.1 Tip结构分析处理 | 第36页 |
| 3.3.2 Bubble结构分析处理 | 第36-38页 |
| 3.4 基于随机森林的分叉结构处理算法 | 第38-46页 |
| 3.4.1 分叉结构及特征选择 | 第39-41页 |
| 3.4.2 随机森林模型的生成 | 第41-46页 |
| 3.5 图结构划分 | 第46-48页 |
| 3.6 本章小结 | 第48-49页 |
| 第4章 实验结果对比分析 | 第49-59页 |
| 4.1 引言 | 第49页 |
| 4.2 试验环境与试验数据 | 第49-51页 |
| 4.3 实验验证方法 | 第51-52页 |
| 4.4 实验结果及评价 | 第52-58页 |
| 4.5 本章小结 | 第58-59页 |
| 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67页 |