| 致谢 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-15页 |
| 1 绪论 | 第15-30页 |
| 1.1 甜瓜蔓枯病的研究进展 | 第15-21页 |
| 1.1.1 病原菌的种类和生物学特性 | 第16-17页 |
| 1.1.2 甜瓜蔓枯病的侵染循环过程和流行 | 第17-18页 |
| 1.1.3 病原菌和植物的互作 | 第18-19页 |
| 1.1.4 蔓枯病的防治 | 第19-21页 |
| 1.1.4.1 化学防治 | 第19-20页 |
| 1.1.4.2 农业措施防治 | 第20页 |
| 1.1.4.3 甜瓜的抗蔓枯病育种 | 第20-21页 |
| 1.2 植物遗传图谱的研究进展 | 第21-25页 |
| 1.2.1 植物遗传图谱构建的亲本选择 | 第21-22页 |
| 1.2.2 植物遗传图谱构建的分子标记选择 | 第22-23页 |
| 1.2.3 植物遗传图谱构建方法 | 第23-24页 |
| 1.2.4 遗传图谱在遗传学研究的作用 | 第24-25页 |
| 1.3 高通量测序技术在基因/QTLs定位上的应用 | 第25-28页 |
| 1.3.1 高通量测序在突变体材料上基因定位的应用 | 第25-26页 |
| 1.3.2 高通量测序技术在高密度遗传图谱的构建上的应用 | 第26-27页 |
| 1.3.3 基于全基因组重测序在基因/QTLs定位中的应用 | 第27-28页 |
| 1.4 甜瓜遗传图谱构建及功能基因研究进展 | 第28-29页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第29-30页 |
| 2 甜瓜抗蔓枯病基因的遗传分析 | 第30-38页 |
| 2.1 材料和方法 | 第30-33页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第30页 |
| 2.1.1.1 遗传图谱构建的亲本材料和群体材料 | 第30页 |
| 2.1.1.2 甜瓜蔓枯病菌株 | 第30页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第30页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第30-31页 |
| 2.1.4 实验方法 | 第31-33页 |
| 2.1.4.1 蔓枯病菌的培养 | 第31页 |
| 2.1.4.2 甜瓜的种植 | 第31-32页 |
| 2.1.4.3 蔓枯病的接种 | 第32-33页 |
| 2.2 结果与分析 | 第33-36页 |
| 2.2.1 甜瓜蔓枯病菌株培养 | 第33-34页 |
| 2.2.2 甜瓜亲本的蔓枯病抗性鉴定 | 第34-35页 |
| 2.2.3 甜瓜F_1和F_2群体的蔓枯病抗性鉴定 | 第35-36页 |
| 2.3 讨论 | 第36-38页 |
| 3 甜瓜高密度遗传图谱的构建 | 第38-53页 |
| 3.1 材料和方法 | 第38-43页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第38页 |
| 3.1.1.1 植物材料 | 第38页 |
| 3.1.1.2 基因组数据库序列来源 | 第38页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第38-43页 |
| 3.1.2.1 CTAB法提取基因组DNA | 第38-39页 |
| 3.1.2.2 测序文库的构建和上机测序 | 第39-40页 |
| 3.1.2.3 碱基测序质量和碱基类型的分布 | 第40-41页 |
| 3.1.2.4 测序序列的过滤 | 第41页 |
| 3.1.2.5 与参考基因组比对统计 | 第41页 |
| 3.1.2.6 样品与参考基因组的SNP检测 | 第41-42页 |
| 3.1.2.7 上图标记的筛选 | 第42页 |
| 3.1.2.8 遗传图谱的构建 | 第42页 |
| 3.1.2.9 遗传图谱的比较 | 第42-43页 |
| 3.1.2.10 基因组重新组装 | 第43页 |
| 3.2 实验结果 | 第43-50页 |
| 3.2.1 测序结果统计与评估 | 第43-44页 |
| 3.2.2 与参考基因组比对统计 | 第44-45页 |
| 3.2.3 遗传图谱构建 | 第45-47页 |
| 3.2.4 遗传图谱评估 | 第47-48页 |
| 3.2.5 遗传图谱的比较 | 第48-49页 |
| 3.2.6 基因组重新锚定 | 第49-50页 |
| 3.3 讨论 | 第50-53页 |
| 4 甜瓜抗蔓枯病基因的定位和候选基因分析 | 第53-64页 |
| 4.1 材料和方法 | 第53-57页 |
| 4.1.1 实验材料及处理 | 第53页 |
| 4.1.1.1 实验材料 | 第53页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第53页 |
| 4.1.3 实验方法 | 第53-57页 |
| 4.1.3.1 质量性状关联分析 | 第53页 |
| 4.1.3.2 关联区域基因富集分析 | 第53-54页 |
| 4.1.3.3 实验材料的处理和取样 | 第54页 |
| 4.1.3.4 样品总RNA的提取 | 第54-55页 |
| 4.1.3.5 cDNA第一条链的合成 | 第55-56页 |
| 4.1.3.6 荧光定量PCR技术 | 第56-57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-64页 |
| 4.2.1 质量性状关联分析 | 第57-58页 |
| 4.2.2 关联区域基因KEGG数据库分析 | 第58-59页 |
| 4.2.3 关联区域基因的纯合SNP的检测 | 第59-60页 |
| 4.2.4 关联区域基因的定量鉴定 | 第60-64页 |
| 5 结论与展望 | 第64-65页 |
| 5.1 结论 | 第64页 |
| 5.2 后续工作及展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-76页 |
| 附录 | 第76页 |
| 附录1 关联区域基因荧光定量PCR的引物序列表 | 第76页 |
