| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 引言 | 第8-15页 |
| 1.1 蛋白质的重要性 | 第8-12页 |
| 1.1.1 蛋白质的定义 | 第8页 |
| 1.1.2 蛋白质的组成 | 第8-10页 |
| 1.1.3 蛋白质的结构 | 第10-11页 |
| 1.1.4 蛋白质对生命体活动的重要意义 | 第11-12页 |
| 1.2 剪接体 | 第12-15页 |
| 1.2.1 对剪接体的基本认识 | 第12-13页 |
| 1.2.2 剪接体的国内外研究现状 | 第13页 |
| 1.2.3 人源剪接体补全及建模的意义 | 第13-15页 |
| 2 蛋白质一级结构和三级结构的获取 | 第15-20页 |
| 2.1 简述 | 第15页 |
| 2.2 实验上获得蛋白质空间结构的方法 | 第15-17页 |
| 2.2.1 X射线衍射(XRD) | 第15页 |
| 2.2.2 核磁共振(NMR) | 第15-16页 |
| 2.2.3 冷冻电镜(Cryo-EM) | 第16-17页 |
| 2.3 理论上获得蛋白质三维结构的方法 | 第17-18页 |
| 2.3.1 简述 | 第17页 |
| 2.3.2 从头预测法 | 第17页 |
| 2.3.3 同源建模 | 第17-18页 |
| 2.4 MODELER补全工作的原理 | 第18-20页 |
| 3 对剪接体5XJC中缺失的原子信息的补全 | 第20-36页 |
| 3.1 简述 | 第20页 |
| 3.2 剪接体5XJC中蛋白质的结构以及功能 | 第20-21页 |
| 3.3 补全步骤 | 第21-23页 |
| 3.3.1 5XJC.ali序列对比文件 | 第21-22页 |
| 3.3.2 5XJC.pdb文件 | 第22-23页 |
| 3.3.3 model-single.py文件 | 第23页 |
| 3.4 补全结果分析 | 第23-34页 |
| 3.4.1 简述 | 第23-24页 |
| 3.4.2 A链的补全及分析 | 第24-25页 |
| 3.4.3 C链的补全及分析 | 第25页 |
| 3.4.4 I链的补全及分析 | 第25-26页 |
| 3.4.5 J链的补全及分析 | 第26-27页 |
| 3.4.6 K链的补全及分析 | 第27页 |
| 3.4.7 L链的补全及分析 | 第27-28页 |
| 3.4.8 P链的补全及分析 | 第28-29页 |
| 3.4.9 Q链的补全及分析 | 第29-30页 |
| 3.4.10 R链的补全及分析 | 第30页 |
| 3.4.11 V链的补全及分析 | 第30-31页 |
| 3.4.12 Y链的补全及分析 | 第31-32页 |
| 3.4.13 Z链的补全及分析 | 第32页 |
| 3.4.14 a链的补全及分析 | 第32-33页 |
| 3.4.15 h链的补全及分析 | 第33页 |
| 3.4.16 k链的补全及分析 | 第33-34页 |
| 3.4.17 n链的补全及分析 | 第34页 |
| 3.5 综合讨论 | 第34-36页 |
| 4 结论 | 第36-38页 |
| 4.1 本论文工作 | 第36页 |
| 4.2 创新点 | 第36页 |
| 4.3 工作展望 | 第36-38页 |
| 4.3.1 对补全蛋白质中缺失原子信息的建议 | 第36-37页 |
| 4.3.2 对剪接体中核酸部分的补全展望 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-42页 |
| 附录A 剪接体缺失肽链残基序列及其对应的补全序列统计 | 第42-46页 |
| 附录B 相关代码说明 | 第46-47页 |
| 附录C DOPE评分结果及补全结构筛选 | 第47-48页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49页 |