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番茄WRKY基因克隆及分析

摘要第1-10页
Abstract第10-14页
第一章 文献综述第14-25页
 1 转录因子的概念、结构特征、类型第14页
   ·转录因子的概念第14页
   ·转录因子的结构特征第14页
   ·转录因子的类型第14页
 2 WRKY 转录因子家族第14-18页
   ·WRKY 转录因子结构特点及其分类第15页
   ·WRKY 转录因子的表达活性第15-17页
   ·WRKY 转录因子的生物学功能第17-18页
 3 RACE 简介第18-21页
   ·RACE 原理第18-19页
   ·SMART-RACE第19-20页
   ·RACE 的应用第20-21页
 4 实时荧光定量PCR 技术简介、定量方法及应用第21-25页
   ·实时荧光定量PCR 工作原理第21-22页
   ·实时荧光定量的常用的荧光化学方法第22-24页
     ·DNA 结合染料(SYBR Green I)第22-23页
     ·Taq Man 实验第23-24页
   ·实时荧光定量PCR 的定量方法第24页
   ·实时荧光定量PCR 的应用第24-25页
第二章 番茄WRKY 基因的克隆及生物信息学分析第25-56页
 1 实验材料第25-27页
   ·植物材料第25页
   ·菌种第25页
   ·常用试剂及溶液配制第25-26页
     ·常用酶和试剂第25页
     ·常用溶液和缓冲液的配制第25-26页
   ·PCR 所用引物及其序列第26页
   ·所用软件及网址第26-27页
   ·主要仪器设备第27页
 2 实验方法第27-39页
   ·RNA 的提取第27-29页
     ·番茄总RNA 提取第27-28页
     ·无RNase-free 的DNase 处理第28-29页
   ·5'单链cDNA 的合成(sscDNA 的合成)第29-30页
   ·特异片段的获得第30-31页
   ·5'RACE第31页
   ·3'单链cDNA 的合成(sscDNA 的合成)第31-32页
   ·特异片段的获得第32页
   ·3'RACE第32-33页
   ·番茄WRKY 全长基因和全长cDNA 的克隆第33-35页
     ·番茄基因组DNA 的提取第33-34页
     ·单链cDNA 的合成第34页
     ·PCR 反应第34-35页
   ·PCR 产物的回收第35页
   ·PCR 产物与pMD-19T 载体的连接第35-36页
   ·连接产物转化大肠杆菌DH5α第36页
   ·质粒的制备第36-37页
   ·重组体的鉴定第37-38页
     ·酶切鉴定第37页
     ·PCR 鉴定第37-38页
   ·阳性克隆的序列测定第38页
   ·生物信息学分析第38-39页
 3 结果分析第39-56页
   ·提取的番茄总RNA 纯度和完整性分析第39页
   ·3'特异片段的获得第39-41页
     ·以cDNA 为模板获得番茄WRKY 基因3'特异片段第39-40页
     ·重组质粒的酶切鉴定第40-41页
   ·5'特异片段的获得第41-42页
     ·以cDNA 为模板获得番茄WRKY 基因5'特异片段第41页
     ·重组质粒的PCR 鉴定第41-42页
     ·重组质粒的酶切鉴定第42页
   ·RACE 实验克隆全长基因第42-46页
     ·3'RACE 实验第42-44页
     ·5'RACE 实验第44-46页
   ·番茄WRKY 全长基因和全长cDNA 的克隆第46-47页
   ·番茄WRKY 全长cDNA 的拼接及生物信息学分析第47-56页
     ·番茄WRKY 基因序列拼接结果及推测的蛋白序列第47-48页
     ·CDD 分析第48-49页
     ·开放阅读框(ORF)预测和限制性酶切位点分析第49页
     ·Blastn 分析第49-50页
     ·限制性酶切位点分析第50页
     ·同源性分析第50-53页
     ·WRKY 蛋白结构和功能预测第53-56页
第三章 实时荧光定量PCR 分析番茄WRKY 基因的表达模式第56-74页
 1 材料与方法第57页
   ·实验材料第57页
   ·主要仪器设备第57页
   ·主要试剂药品第57页
 2 实验方法第57-60页
   ·番茄苗处理第57-58页
   ·引物设计第58页
   ·番茄不同处理下总RNA 提取第58-59页
   ·番茄单链cDNA 获得第59页
   ·标准曲线的制备第59-60页
     ·标准品的制备第59-60页
     ·按下列组分配制荧光定量PCR 的反应液第60页
   ·各个不同处理实时荧光定量PCR 反应第60页
   ·荧光定量PCR 数据分析第60页
 3 结果分析第60-74页
   ·actin 基因与目的基因荧光定量PCR 条件优化第62页
   ·标准曲线的建立第62-64页
   ·番茄WRKY 基因在各个不同处理下的表达情况分析第64-72页
     ·JA 不同时间处理番茄WRKY 基因表达情况第64-66页
     ·SA 不同时间处理番茄WRKY 基因表达情况第66-68页
     ·NaCl 不同时间处理番茄WRKY 基因表达情况第68-70页
     ·4℃不同时间处理番茄WRKY 基因表达情况第70-72页
   ·番茄WRKY 基因的组织特异性表达分析第72-74页
第四章 讨论第74-76页
参考文献第76-81页
附录第81-82页
攻读硕士学位期间发表论文情况第82-83页
致谢第83页

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