| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一部分 综述 | 第6-14页 |
| 1.1 类黄酮生物合成途径简介 | 第6-8页 |
| 1.1.1 类黄酮化合物的基本概况 | 第6-7页 |
| 1.1.2 类黄酮化合物代谢途径 | 第7-8页 |
| 1.2 植物类黄酮合成途径中的查尔酮异构酶（chalcone isomerase） | 第8-12页 |
| 1.2.1 查尔酮异构酶（CHI）的基本概况 | 第8-10页 |
| 1.2.2 查尔酮异构酶（CHI）对类黄酮代谢的影响 | 第10-11页 |
| 1.2.3 查尔酮异构酶（CHI）在多数植物中由基因家族编码 | 第11-12页 |
| 1.3 含 CCDD 基因组的野生稻物种和有关二倍体物种概况 | 第12-14页 |
| 第二部分 药用野生稻查尔酮异构酶基因家族的生物信息学分析 | 第14-22页 |
| 2.1 材料和方法 | 第14-15页 |
| 2.1.1 转录组获得 | 第14-15页 |
| 2.1.2 生物信息学分析 | 第15页 |
| 2.2 结果和分析 | 第15-21页 |
| 2.2.1 药用野生稻 CHI 家族基因的序列的理化性质分析 | 第15-16页 |
| 2.2.2 信号肽的预测和分析 | 第16-17页 |
| 2.2.3 基因编码蛋白的亚细胞定位 | 第17页 |
| 2.2.4 疏水性与亲水性的预测和分析 | 第17-18页 |
| 2.2.5 二级结构的预测和分析 | 第18-19页 |
| 2.2.6 三级结构的预测和分析 | 第19页 |
| 2.2.7 CHI 基因家族编码蛋白保守区预测与分析 | 第19-20页 |
| 2.2.8 CHI 基因家族的系统发育关系分析 | 第20-21页 |
| 2.3 小结 | 第21-22页 |
| 第三部分 CHI 基因家族在具 CCDD 基因组野生稻中的分子进化 | 第22-42页 |
| 3.1 引言 | 第22页 |
| 3.2 实验材料和方法 | 第22-28页 |
| 3.2.1 引物设计 | 第23页 |
| 3.2.2 基因组总 DNA 的提取 | 第23页 |
| 3.2.3 总 RNA 提取 | 第23-24页 |
| 3.2.4 反转录 cDNA 第一链 | 第24-25页 |
| 3.2.5 PCR 扩增和目的片段的纯化回收 | 第25-26页 |
| 3.2.6 克隆 | 第26-27页 |
| 3.2.7 序列测定 | 第27-28页 |
| 3.3 数据处理 | 第28页 |
| 3.4 实验结果 | 第28-30页 |
| 3.5 2 个查尔酮异构酶编码基因分子进化分析 | 第30-40页 |
| 3.5.1 Ochi4 基因 | 第30-37页 |
| 3.5.2 Ochi5 基因序列 | 第37-40页 |
| 3.6 讨论 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-49页 |
| 致谢 | 第49页 |
