| 中文摘要 | 第6-8页 |
| 英文摘要 | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| §1.1 生物信息学 | 第10页 |
| §1.2 蛋白质 | 第10-12页 |
| §1.3 蛋白质序列的相似性分析 | 第12-19页 |
| 1.3.1 基于序列比对的方法 | 第12-13页 |
| 1.3.2 基于非序列比对的方法 | 第13-19页 |
| 1.3.2.1 蛋白质序列的特征提取方法 | 第14-18页 |
| 1.3.2.2 常用的距离函数 | 第18-19页 |
| §1.4 本文的主要工作 | 第19-21页 |
| 第二章 基于五字符模型和氨基酸对累积频率的蛋白质序列3D图形表示 | 第21-39页 |
| §2.1 引言 | 第21-22页 |
| §2.2 基于五字符模型的3D图形表示 | 第22-24页 |
| §2.3 蛋白质序列的特征提取 | 第24-25页 |
| §2.4 实验 | 第25-39页 |
| 2.4.1 9个物种ND5蛋白质序列的相似性分析 | 第25-31页 |
| 2.4.2 35个冠状病毒S蛋白的相似性分析 | 第31-39页 |
| 第三章 基于氨基酸理化性质的蛋白质序列3D图形表示 | 第39-59页 |
| §3.1 引言 | 第39-40页 |
| §3.2 基于氨基酸理化性质的3D图形表示 | 第40-41页 |
| 3.2.1 氨基酸理化性质数据库——AAindex | 第40页 |
| 3.2.2 基于氨基酸理化性质的图形表示 | 第40-41页 |
| §3.3 蛋白质序列的特征提取 | 第41-43页 |
| 3.3.1 蛋白质序列的数字特征 | 第41-42页 |
| 3.3.2 主成分分析 | 第42页 |
| 3.3.3 特征向量降维 | 第42-43页 |
| §3.4 实验 | 第43-59页 |
| 3.4.1 9个物种ND5蛋白质序列的相似性分析 | 第43-46页 |
| 3.4.2 35个冠状病毒S蛋白的相似性分析 | 第46-48页 |
| 3.4.3 24种脊椎动物转铁蛋白序列的相似性分析 | 第48-51页 |
| 3.4.4 50种动物β-珠蛋白序列的相似性分析 | 第51-59页 |
| 第四章 基于CGR的一种蛋白质序列特征提取方法 | 第59-80页 |
| §4.1 引言 | 第59-60页 |
| §4.2 蛋白质序列的CGR图形表示 | 第60-62页 |
| §4.3 基于CGR的蛋白质序列特征提取 | 第62-63页 |
| §4.4 实验 | 第63-77页 |
| 4.4.1 9个物种ND5蛋白质序列的相似性分析 | 第63-65页 |
| 4.4.2 24种脊椎动物转铁蛋白序列的相似性分析 | 第65-66页 |
| 4.4.3 50种动物β-珠蛋白序列的相似性分析 | 第66-67页 |
| 4.4.4 5个家族的36条蛋白质序列的相似性分析 | 第67-73页 |
| 4.4.5 27条抗冻蛋白序列的相似性分析 | 第73-77页 |
| §4.5 讨论 | 第77-80页 |
| 第五章 总结与展望 | 第80-82页 |
| 附录 | 第82-88页 |
| 参考文献 | 第88-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 攻读博士学位期间完成论文情况 | 第97-98页 |
| 个人简介 | 第98-99页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第99页 |
