| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 前言 | 第8-17页 |
| 1 组学 | 第8-10页 |
| 1.1 基因组学 | 第9页 |
| 1.2 蛋白质组学 | 第9页 |
| 1.3 代谢组学 | 第9-10页 |
| 1.4 转录组学 | 第10页 |
| 2 转录组学研究技术方法 | 第10-13页 |
| 2.1 Microarray | 第10页 |
| 2.2 SAGE | 第10-11页 |
| 2.3 MPSS | 第11页 |
| 2.4 RNA-Seq | 第11-13页 |
| 3 香菇 | 第13-16页 |
| 3.1 香菇简介 | 第13-14页 |
| 3.2 香菇中与发育过程相关基因的研究进展 | 第14-15页 |
| 3.3 香菇香味基因的研究进展 | 第15页 |
| 3.4 RNA-Seq技术在香菇中的应用 | 第15-16页 |
| 4. 研究目的与意义 | 第16-17页 |
| 第二章 实验材料及方法 | 第17-29页 |
| 1 实验材料、器材及试剂 | 第17页 |
| 1.1 实验材料 | 第17页 |
| 1.2 实验器材与用具 | 第17页 |
| 1.3 实验试剂 | 第17页 |
| 2 实验方法 | 第17-29页 |
| 2.1 材料准备 | 第17-18页 |
| 2.2 转录组测序 | 第18-20页 |
| 2.3 Trizol法提取RNA | 第20-21页 |
| 2.4 Northern blot | 第21-23页 |
| 2.5 反转录 | 第23-24页 |
| 2.6 PCR检测 | 第24页 |
| 2.7 DNA琼脂糖凝胶电泳 | 第24-25页 |
| 2.8 Real-time PCR | 第25页 |
| 2.9 构建质粒 | 第25-29页 |
| 第三章 结果 | 第29-44页 |
| 1 转录组测序数据处理 | 第29-35页 |
| 1.1 香菇子实体生长三个阶段测序及装配 | 第29-30页 |
| 1.2 序列注释 | 第30页 |
| 1.3 GO、COG和KEGG注释 | 第30-33页 |
| 1.4 差异表达基因的分析 | 第33-35页 |
| 2 转录组数据有效性的实验验证 | 第35-38页 |
| 2.1 通过PCR验证数据的有效性 | 第35-36页 |
| 2.2 通过Real-time PCR验证数据的有效性 | 第36-37页 |
| 2.3 通过Northern blot验证数据的有效性 | 第37-38页 |
| 3 转录组数据的相关功能分析 | 第38-44页 |
| 3.1 鲜味物质代谢通路中，基因在三个时期的表达量变化情况 | 第38-40页 |
| 3.2 减数分裂通路中，基因在三个时期的表达量变化情况 | 第40-41页 |
| 3.3 脂肪酸代谢通路中，基因在三个时期的表达量变化情况 | 第41-42页 |
| 3.4 通过基因组和转录组比对得到基因的外显子以及内含子的结构 | 第42-44页 |
| 第四章 讨论 | 第44-46页 |
| 1 香菇的转录组学测序 | 第44页 |
| 2 与鲜味相关的 5’核苷酸、天冬氨酸、谷氨酸代谢通路 | 第44-45页 |
| 3 与香味相关的不饱和脂肪酸的代谢通路 | 第45页 |
| 4 在早期子实体以及成熟子实体之间减数分裂相关基因的表达量不同 | 第45-46页 |
| 第五章 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 在学期间学术成果情况 | 第55页 |
