摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6页 |
第1章 小窝与小窝蛋白的功能研究进展 | 第9-30页 |
1.1 分子动力学模拟在研究蛋白质生物过程方面的应用和发展 | 第9-13页 |
1.1.1 分子动力学模拟的原理 | 第9-11页 |
1.1.2 分子动力学模拟的应用及挑战 | 第11-13页 |
1.2 小窝(caveolae)和小窝蛋白(caveolin)的研究进展 | 第13-28页 |
1.2.1 脂筏(lipid rafts)与小窝 | 第13-14页 |
1.2.2 小窝的形成 | 第14-15页 |
1.2.3 小窝的生物学功能 | 第15-19页 |
1.2.4 小窝与相关疾病 | 第19-22页 |
1.2.5 小窝蛋白(caveolin) | 第22-28页 |
1.3 本章小结 | 第28-30页 |
第2章 不对称双层膜模型的构建 | 第30-37页 |
2.1 引言 | 第30-31页 |
2.2 分子动力学模拟体系的构建 | 第31-33页 |
2.3 分子动力学模拟 | 第33-34页 |
2.4 结果与讨论 | 第34-36页 |
2.4.1 不对称双层膜的厚度 | 第34页 |
2.4.2 不对称双层膜的膜面积 | 第34-35页 |
2.4.3 不对称双层膜中磷脂有序性的分析 | 第35-36页 |
2.5 本章小结 | 第36-37页 |
第3章 小窝蛋白-1和不对称双层膜复合体的动力学行为研究 | 第37-59页 |
3.1 引言 | 第37-38页 |
3.2 分子动力学模拟体系的构建 | 第38-39页 |
3.3 分子动力学模拟 | 第39-40页 |
3.4 结果与讨论 | 第40-57页 |
3.4.1 小窝蛋白-1(residues 82-136)两个α-螺旋的RMSD值分析 | 第40页 |
3.4.2 小窝蛋白-1(residues 82-136)二级结构的变化 | 第40-44页 |
3.4.3 小窝蛋白-1(residues 82-136)在膜中构象的变化 | 第44-47页 |
3.4.4 小窝蛋白-1(residues 82-136)在膜中的插入深度 | 第47-49页 |
3.4.5 小窝蛋白-1(residues 82-136)自身及其与脂类间的作用 | 第49-53页 |
3.4.6 模拟过程中胆固醇的分布 | 第53-54页 |
3.4.7 小窝蛋白-1(residues 82-136)的插入对不对称双层膜的扰动 | 第54-57页 |
3.5 本章小结 | 第57-59页 |
第4章 全文总结及展望 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-73页 |
致谢 | 第73页 |