| 中英文縮略词表 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 进化生物学及生物地理学研究概况 | 第16-28页 |
| 1.1 进化生物学研究现状及意义 | 第16-24页 |
| 1.1.1 进化生物学概述 | 第16-18页 |
| 1.1.2 分子系统学与生命之树(TOL) | 第18-20页 |
| 1.1.3 分子进化模型和计算 | 第20-24页 |
| 1.2 生物地理学研究现状及意义 | 第24-27页 |
| 1.3 小结 | 第27-28页 |
| 第二章 菝葜科研究背景 | 第28-44页 |
| 2.1 菝葜科的特点 | 第28-30页 |
| 2.2 菝葜科植物研究现状 | 第30-44页 |
| 2.2.1 经典分类和形态解剖研究 | 第30-39页 |
| 2.2.2 分子系统学研究 | 第39-40页 |
| 2.2.3 生物条形码研究 | 第40页 |
| 2.2.4 菝葜科化石,起源及生物地理学研究 | 第40-42页 |
| 2.2.5 目前存在的问题 | 第42页 |
| 2.2.6 研究内容与目的意义 | 第42-44页 |
| 第三章 菝葜科系统发育与特征进化研究 | 第44-78页 |
| 3.1 材料和方法 | 第46-55页 |
| 3.1.1 分类单元取样 | 第46-47页 |
| 3.1.2 分子系统学实验 | 第47-50页 |
| 3.1.3 系统发育分析 | 第50-54页 |
| 3.1.4 祖先特征重建 | 第54-55页 |
| 3.2 结果分析 | 第55-66页 |
| 3.2.1 系统发育关系 | 第55-63页 |
| 3.2.2 Koyama分组系统的单系性和祖先特征重建 | 第63-66页 |
| 3.3 讨论 | 第66-76页 |
| 3.3.1 菝葜科的范畴及属的划分 | 第66-67页 |
| 3.3.2 菝葜属内的系统发育关系 | 第67-74页 |
| 3.3.3 特征进化和和系统进化意义 | 第74-76页 |
| 3.4 小结 | 第76-78页 |
| 第四章 菝葜科植物的生物地理学研究 | 第78-105页 |
| 4.1 材料与方法 | 第79-88页 |
| 4.1.1 材料与系统发育分析 | 第79-80页 |
| 4.1.2 化石记录和化石种的多样性 | 第80页 |
| 4.1.3 分化时间留分析 | 第80-81页 |
| 4.1.4 生物地理学分析 | 第81-82页 |
| 4.1.5 多样性分化速率分析 | 第82-88页 |
| 4.2 结果分析 | 第88-95页 |
| 4.2.1 化石分布及化石物种多样性 | 第88-89页 |
| 4.2.2 分歧时间估计 | 第89页 |
| 4.2.3 祖先分布重建 | 第89-92页 |
| 4.2.4 多样性分化速率 | 第92-95页 |
| 4.3 讨论 | 第95-103页 |
| 4.3.1 菝葜科始新世-渐新世大灭绝和两次快速分化事件 | 第95-97页 |
| 4.3.2 晚白垩纪北半球起源菝葜科的生物地理历史 | 第97-99页 |
| 4.3.3 跨洋洲际间断分布及多次长距离传播(LDD) | 第99-103页 |
| 小结 | 第103-105页 |
| 第五章 结论和展望 | 第105-108页 |
| 5.1 总结 | 第105-106页 |
| 5.2 展望 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-123页 |
| 附录 | 第123-142页 |
| 在读期间的主要成果 | 第142-145页 |
| 已发表与拟发表文章 | 第142-143页 |
| 国际国内会议报告 | 第143-144页 |
| 参与科研项目 | 第144页 |
| 出国研修状况 | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145-146页 |
