拟南芥花药基因调控网络的构建
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-19页 |
| ·选题背景和选题意义 | 第12-13页 |
| ·研究现状 | 第13-16页 |
| ·研究内容 | 第16-17页 |
| ·论文结构 | 第17-19页 |
| 第二章 基因调控网络模型 | 第19-27页 |
| ·基因调控网络的概述 | 第20-21页 |
| ·基因调控网络模型 | 第21-25页 |
| ·贝叶斯网络模型 | 第21-22页 |
| ·神经网络模型 | 第22-23页 |
| ·布尔网络模型 | 第23-24页 |
| ·概率布尔网络模型 | 第24-25页 |
| ·用基因相关性和TFBS构建GRN | 第25页 |
| ·用信息论方法构建GRN | 第25-27页 |
| 第三章 生物软件和理论知识的介绍 | 第27-39页 |
| ·拟南芥数据库 | 第27-30页 |
| ·花药表达基因数据 | 第27-28页 |
| ·拟南芥基因共表达数据 | 第28-29页 |
| ·拟南芥基因上游序列 | 第29-30页 |
| ·基元预测工具 | 第30-36页 |
| ·MEME基元预测工具 | 第31-32页 |
| ·Weeder Wed基元预测工具 | 第32-33页 |
| ·基元预测工具的分析 | 第33-36页 |
| ·最大团算法 | 第36-39页 |
| ·最大算法基本定义 | 第36页 |
| ·最大团问题的数学描述 | 第36-37页 |
| ·最大团算法的应用 | 第37-39页 |
| 第四章 花药基因调控网络的构建 | 第39-52页 |
| ·花药共表达基因的筛选 | 第39-43页 |
| ·实验的具体步骤 | 第39-41页 |
| ·实验的结果和验证 | 第41-43页 |
| ·共表达基因的基元预测 | 第43-45页 |
| ·基元到转录因子的转换 | 第45-47页 |
| ·STAMP网络工具的介绍 | 第45-46页 |
| ·基元到转录因子的转换 | 第46-47页 |
| ·调控网络的构建 | 第47-51页 |
| ·预测结果 | 第47-48页 |
| ·高可信度调控关系的筛选 | 第48-50页 |
| ·高可信度调控网络的生物学意义 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 总结和展望 | 第52-54页 |
| ·总结 | 第52页 |
| ·展望 | 第52-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第60页 |
