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利用磷酸化蛋白质组学策略分析丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PID调节的拟南芥信号通路

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 绪论第8-16页
    1.1 引言第8页
    1.2 植物生长素研究进展第8-10页
        1.2.1 植物生长素的功能第8页
        1.2.2 生长素极性运输第8-9页
        1.2.3 植物生长素运输蛋白研究进展第9页
        1.2.4 植物生长素输出蛋白PIN及其调节者PID激酶研究进展第9-10页
        1.2.5 植物生长素输出蛋白PIN在细胞内的囊泡运输第10页
    1.3 生长素与其他激素的交叉第10-12页
        1.3.1 BR信号及与生长素的相互作用第10-11页
        1.3.2 ABA信号及与生长素的相互作用第11-12页
    1.4 磷酸化蛋白质组学第12-15页
        1.4.1 磷酸化蛋白质组学的研究方法第12-13页
        1.4.2 结合稳定同位素二甲基标记的质谱技术第13-14页
        1.4.3 拟南芥磷酸化蛋白质组学研究进展第14-15页
    1.5 研究的目的和意义第15-16页
2 实验材料与实验方法第16-19页
    2.1 实验材料第16页
    2.2 拟南芥35S::PID过表达体与Col野生型的形态学观察和测定第16页
        2.2.1 拟南芥35S::PID与Col形态学观察第16页
        2.2.2 拟南芥35S::PID与Col主根和侧根测定第16页
    2.3 拟南芥35S::PID过表达体与Col野生型磷酸化蛋白质组学分析第16-19页
        2.3.1 拟南芥蛋白质样品提取第16-17页
        2.3.2 蛋白质的酶解第17页
        2.3.3 肽段的稳定二甲基同位素标记第17页
        2.3.4 固相萃取技术除盐第17页
        2.3.5 金属柱层析分离磷酸化肽段第17-18页
        2.3.6 液相质谱分离与鉴定第18页
        2.3.7 数据库搜索第18页
        2.3.8 差异表达蛋白质和磷酸化蛋白质的功能分类第18-19页
3 结果第19-42页
    3.1 拟南芥35S::PID过表达体和Col野生型主根形态学观察和测定第19页
    3.2 拟南芥35S::PID过表达体和Col野生型同位素二甲基标记第19-20页
    3.3 拟南芥35S::PID过表达体定量蛋白质组学第20-27页
        3.3.1 拟南芥35S::PID蛋白质的鉴定和定量结果第20-21页
        3.3.2 拟南芥35S::PID蛋白质的标记定量散点图第21-22页
        3.3.3 拟南芥35S::PID磷酸化蛋白质的数量第22-23页
        3.3.4 拟南芥35S::PID磷酸化残基的比例第23-24页
        3.3.5 拟南芥35S::PID差异表达全蛋白质和磷酸化蛋白质的功能类群第24-27页
    3.4 拟南芥35S::PID过表达体差异表达蛋白质和磷酸化蛋白质分析第27-42页
        3.4.1 参与囊泡运输过程的差异表达蛋白质第28-29页
        3.4.2 参与内膜转运过程的差异表达蛋白质第29-32页
        3.4.3 参与BR信号过程的差异表达蛋白质第32页
        3.4.4 参与ABA信号过程的差异表达蛋白质第32-34页
        3.4.5 参与钙离子信号过程的差异表达蛋白质第34-36页
        3.4.6 参与基础代谢过程的差异表达蛋白质第36-38页
        3.4.7 参与基因转录调控过程的差异表达蛋白质第38-40页
        3.4.8 参与蛋白质代谢过程的差异表达蛋白质第40-42页
4 讨论第42-63页
    4.1 拟南芥PID蛋白的表达及35S::PID过表达体表型第42页
    4.2 拟南芥35S::PID过表达体二甲基标记技术第42-43页
    4.3 拟南芥35S::PID过表达体内PIN蛋白的囊泡运输第43-46页
    4.4 拟南芥35S::PID过表达体内膜转运子的调控第46-50页
    4.5 拟南芥35S::PID过表达体内BR信号的调节第50-52页
    4.6 拟南芥35S::PID过表达体内ABA信号的调节第52-54页
    4.7 拟南芥35S::PID过表达体内钙离子信号的调节第54-57页
    4.8 拟南芥35S::PID过表达体内基础代谢的调节第57-61页
    4.9 拟南芥35S::PID过表达体蛋白质代谢的调节第61-63页
结论第63-64页
参考文献第64-77页
攻读学位期间发表的学术论文第77-78页
致谢第78-79页

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