| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 研究背景及研究意义 | 第12-15页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第12-13页 |
| 1.1.2 国内外研究现状 | 第13-14页 |
| 1.1.3 研究意义 | 第14-15页 |
| 1.2 本文主要工作 | 第15-16页 |
| 1.3 论文结构和章节安排 | 第16页 |
| 1.4 本章小结 | 第16-18页 |
| 2 网络医学相关研究及方法 | 第18-34页 |
| 2.1 网络医学概述 | 第18-21页 |
| 2.1.1 复杂网络的定义和特性 | 第18-20页 |
| 2.1.2 网络医学 | 第20-21页 |
| 2.2 相关方法介绍 | 第21-26页 |
| 2.2.1 网络拓扑特征 | 第21-24页 |
| 2.2.2 基于模块度的BGLL社团划分方法 | 第24-25页 |
| 2.2.3 基于结构信息内容的树形结构相似性计算方法 | 第25-26页 |
| 2.3 数据来源及其预处理 | 第26-33页 |
| 2.3.1 数据来源 | 第26-29页 |
| 2.3.2 数据预处理 | 第29-33页 |
| 2.4 本章小结 | 第33-34页 |
| 3 DDI网络的拓扑特性分析 | 第34-52页 |
| 3.1 DDI网络的基本拓扑特性 | 第34-40页 |
| 3.1.1 度分布 | 第34-37页 |
| 3.1.2 介数 | 第37-38页 |
| 3.1.3 集聚系数 | 第38-39页 |
| 3.1.4 紧密中心性 | 第39-40页 |
| 3.2 DDI网络拓扑特性间的相关性分析 | 第40-44页 |
| 3.2.1 度与集聚系数 | 第40-41页 |
| 3.2.2 度与紧密中心性 | 第41-42页 |
| 3.2.3 集聚系数与紧密中心性 | 第42页 |
| 3.2.4 介数与集聚系数 | 第42-44页 |
| 3.3 DDI网络的模块性分析 | 第44-50页 |
| 3.3.1 药物相互作用的模块分析 | 第44-46页 |
| 3.3.2 模块性与药物功能关系分析 | 第46-48页 |
| 3.3.3 模块性与药物疾病关系分析 | 第48-50页 |
| 3.4 本章小结 | 第50-52页 |
| 4 DDI分子网络机理分析 | 第52-71页 |
| 4.1 DDI分子网络模块分析研究 | 第52-56页 |
| 4.1.1 分子网络模块划分 | 第52-53页 |
| 4.1.2 定性DDI的分子网络模块分析 | 第53-56页 |
| 4.1.3 不同类型DDI的分子网络模块分析 | 第56页 |
| 4.2 DDI药物靶点机理分析研究 | 第56-59页 |
| 4.2.1 靶点相似性的计算 | 第57-58页 |
| 4.2.2 定性DDI的药物靶点机理结果分析 | 第58页 |
| 4.2.3 不同类型DDI的药物靶点机理结果分析 | 第58-59页 |
| 4.3 DDI药物功能特性分析研究 | 第59-63页 |
| 4.3.1 药物ATC分类结构相似性的计算 | 第59-60页 |
| 4.3.2 定性DDI的功能特性结果分析 | 第60-61页 |
| 4.3.3 不同类型DDI的功能特性结果分析 | 第61-63页 |
| 4.4 DDI化学结构相似性规律研究 | 第63-69页 |
| 4.4.1 药物化学结构相似性的计算 | 第64-66页 |
| 4.4.2 定性DDI的化学结构相似性规律结果分析 | 第66-67页 |
| 4.4.3 不同类型DDI的化学结构相似性规律结果分析 | 第67-69页 |
| 4.5 本章小结 | 第69-71页 |
| 5 基于相似性的DDI预测 | 第71-81页 |
| 5.1 研究方法概述 | 第71-72页 |
| 5.2 研究方法的实现 | 第72-76页 |
| 5.2.1 DDI矩阵M_1的形成 | 第72-73页 |
| 5.2.2 相似性矩阵M_2的形成 | 第73-74页 |
| 5.2.3 预测矩阵M_3的形成 | 第74-76页 |
| 5.3 实验结果及评价 | 第76-78页 |
| 5.4 讨论 | 第78-79页 |
| 5.5 本章小结 | 第79-81页 |
| 6 总结与展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-86页 |
| 作者简历及攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第86-88页 |
| 学位论文数据集 | 第88页 |
