| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 甲状腺癌的研究现状 | 第10页 |
| 1.3 长链非编码RNA与竞争性内源RNA的研究概述 | 第10-14页 |
| 1.3.1 长链非编码RNA的研究状况 | 第10-11页 |
| 1.3.2 竞争性内源RNA研究现状 | 第11-13页 |
| 1.3.3 长链非编码RNAs作为竞争性内源RNA的研究 | 第13-14页 |
| 1.4 技术路线 | 第14-15页 |
| 1.5 论文的主要工作与结构安排 | 第15-16页 |
| 2 差异表达基因分析 | 第16-23页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 转录组数据 | 第16页 |
| 2.3 鉴定差异表达基因 | 第16-18页 |
| 2.4 差异表达基因的功能分析 | 第18页 |
| 2.5 差异表达基因结果分析 | 第18-22页 |
| 2.5.1 差异表达基因分析 | 第18-21页 |
| 2.5.2 差异表达基因的功能富集分析 | 第21-22页 |
| 2.6 本章小结 | 第22-23页 |
| 3 ceRNA网络构建及关键驱动基因分析 | 第23-32页 |
| 3.1 引言 | 第23页 |
| 3.2 基因调控网络的构建 | 第23-25页 |
| 3.2.1 基因调控网络构建与关键驱动基因鉴定的方法 | 第23-24页 |
| 3.2.2 基因调控网络与关键驱动基因的结果分析 | 第24-25页 |
| 3.3 基因共表达网络的构建 | 第25-28页 |
| 3.3.1 基因共表达网络构建与关键驱动基因鉴定方法 | 第25-27页 |
| 3.3.2 基因共表达网络构建与关键驱动基因的结果分析 | 第27-28页 |
| 3.4 ceRNA网络构建及lncRNAs/m RNAs的竞争性内源机制分析 | 第28-29页 |
| 3.5 生存分析 | 第29-31页 |
| 3.5.1 生存分析的方法 | 第29-30页 |
| 3.5.2 生存分析结果 | 第30-31页 |
| 3.6 本章小结 | 第31-32页 |
| 4 疾病与药物或基因的关联分析 | 第32-43页 |
| 4.1 引言 | 第32页 |
| 4.2 研究方法 | 第32-34页 |
| 4.2.1 正常和患病样本的基因共表达网络构建 | 第32页 |
| 4.2.2 差异连接分析 | 第32-34页 |
| 4.2.3 药物与扰动基因标签 | 第34页 |
| 4.3 结果分析 | 第34-41页 |
| 4.3.1 比较正常和患病样本间的基因共表达网络 | 第34-38页 |
| 4.3.2 使用网络药物基因组学方法优先考虑药物和基因靶标 | 第38-41页 |
| 4.3.3 定量评估基因和药物靶标基因的优先级 | 第41页 |
| 4.4 关键ceRNAs的药物预测 | 第41-42页 |
| 4.5 本章小结 | 第42-43页 |
| 5 总结与展望 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-54页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
