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高通量分析人食管鳞癌甲基化差异基因的相关研究

中英文缩略语表第7-8页
中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一部分 CCNYL1在人食管鳞状细胞癌中甲基化与去甲基化研究第13-57页
    前言第14-18页
    材料与方法第18-41页
        1. 实验材料第18-28页
            1.1 组织样本第18页
            1.2 菌种、质粒及细胞株第18-19页
            1.3 主要试剂第19-21页
            1.4 主要仪器设备第21-22页
            1.5 引物的合成与设计第22-23页
            1.6 重要试剂的配制第23-28页
        2. 研究方法第28-41页
            2.1 细胞处理第28页
            2.2 DNA甲基化测序第28-29页
            2.3 Bisulfite sequencing PCR检测第29-32页
            2.4 总RNA和总蛋白的提取第32-34页
            2.5 DNA、RNA和蛋白的浓度测定第34页
            2.6 逆转录(Reverse Transcription,RT)与PCR扩增第34-35页
            2.7 Western Blotting(WB)第35-37页
            2.8 感受态细胞的制备第37页
            2.9 转化第37页
            2.10 质粒提取及鉴定第37-39页
            2.11 质粒瞬时转染第39页
            2.12 细胞增殖实验第39-40页
            2.13 统计学分析第40-41页
    实验结果第41-52页
        1. 高通量测序分析ESCC组织的甲基化图谱及表达图谱第41-45页
            1.1 RRBS测序获得ESCC组织甲基化差异特征第42-43页
            1.2 ESCC组织差异基因功能富集第43-44页
            1.3 RRBS测序与芯片表达谱关联分析结果第44-45页
        2. BSP验证结果第45-48页
            2.1 CCNYL1基因DMR PCR扩增及单个CpG位点甲基化频率第45-47页
            2.2 CCNYL1基因DMR整体甲基化状态分析第47-48页
        3. CCNYL1基因表达水平第48-49页
        4. CCNYL1在细胞株中的研究第49-52页
            4.1 CCNYL1在体外细胞株中DNA甲基化、mRNA及蛋白的表达情况第49-50页
            4.2 5-aza-dC处理细胞株,CCNYL1甲基化水平降低,表达水平升高第50页
            4.3 过表达CCNYL1基因,抑制食管癌细胞生长第50-52页
    讨论第52-56页
    展望第56页
    结论第56-57页
第二部分 HSD11B1L在人食管鳞状细胞癌中的DNA甲基化研究和预后分析第57-80页
    前言第58-60页
    材料与方法第60-67页
        1. 实验材料第60-62页
            1.1 组织样本第60页
            1.2 菌种及细胞株第60页
            1.3 主要试剂第60-61页
            1.4 主要仪器设备第61页
            1.5 引物的合成物设计第61-62页
        2. 研究方法第62-67页
            2.1 细胞处理第62页
            2.2 DNA甲基化测序第62-63页
            2.3 BSP检测第63页
            2.4 总RNA和总蛋白的提取第63页
            2.5 DNA、RNA和蛋白的浓度测定第63页
            2.6 PCR扩增第63-64页
            2.7 Western Blotting第64页
            2.8 感受态细胞的制备第64页
            2.9 转化第64页
            2.10 质粒小量提取及鉴定第64页
            2.11 细胞增殖实验第64页
            2.12 Transwell实验第64-66页
            2.13 数据的获取及分析第66-67页
    实验结果第67-76页
        1. RRBS测序获得ESCC中转移与非转移组织DNA甲基化差异基因的功能富集第67页
        2. ESCC转移与非转移组织DNA甲基化差异基因与表达差异基因关联分析第67-68页
        3. RRBS测序结果验证第68-69页
        4. 表达谱芯片结果验证第69页
        5. HSD11B1L在细胞株中的研究第69-76页
            5.1 HSD11B1L在细胞株中的甲基化及表达水平呈负相关第69-70页
            5.2 敲除HSD11B1L基因,食管癌细胞株的体外增殖及迁移侵袭能力均下降第70-73页
            5.3 HSD11B1L基因甲基化与临床病理特征之间的关系第73-75页
            5.4 HSD11B1L甲基化与预后的关系第75-76页
    讨论第76-79页
    展望第79页
    结论第79-80页
参考文献第80-84页
文献综述第84-91页
    参考文献第87-91页
致谢第91-92页
硕士在读期间发表与待发表论文第92-93页
基金资助第93-94页

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