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基于DNA条形码的无齿蚌属物种有效性分析及其系统发育研究

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
第一章 引言第10-22页
    1.1 淡水蚌的分类及其作用第10-11页
        1.1.1 淡水蚌的分类第10页
        1.1.2 淡水蚌的经济价值及生态作用第10-11页
    1.2 无齿蚌属的研究历史及分类第11-14页
    1.3 DNA条形码在分类学中的应用第14-20页
        1.3.1 DNA条形码的产生和发展第14-15页
        1.3.2 DNA条形码技术的原理第15页
        1.3.3 DNA条形码技术在分类学中的应用第15-16页
        1.3.4 DNA条形码技术与传统DNA分类(DNA Taxonomy)的关系第16-17页
        1.3.5 DNA条形码技术在蚌类分类中的运用第17-19页
        1.3.6 DNA条形码候选基因的特点第19-20页
    1.4 本研究的目的意义第20-22页
        1.4.1 研究目的第20-21页
        1.4.2 研究意义第21-22页
第二章 材料与方法第22-29页
    2.1 样本采集与鉴定第22-24页
    2.2 实验所用试剂及仪器第24页
        2.2.1 实验试剂第24页
        2.2.2 实验仪器第24页
    2.3 实验方法第24-26页
        2.3.1 样本解剖及取样第24-25页
        2.3.2 基因组DNA提取与检测第25页
        2.3.3 扩增引物第25页
        2.3.4 PCR扩增第25-26页
        2.3.5 PCR扩增产物测序第26页
    2.4 数据处理第26-29页
        2.4.1 序列比对与校正第26-27页
        2.4.2 系统发育树的构建第27页
        2.4.3 计算种内和种间遗传距离第27-29页
第三章 结果与分析第29-48页
    3.1 DNA提取与PCR扩增及测序第29页
    3.2 基因序列分析第29-31页
        3.2.1 COI-COII基因序列分析第29-30页
        3.2.2 ND1基因序列分析第30页
        3.2.3 三个基因联合数据分析第30-31页
    3.3 无齿蚌属物种有效性分析及其系统发育第31-43页
        3.3.1 无齿蚌属物种有效性分析第31-41页
        3.3.3 未知物种鉴定及无齿蚌属的系统发育第41-43页
    3.4 相对遗传距离的计算第43-48页
        3.4.1 物种合并前的相对遗传距离计算第43-45页
        3.4.2 有效物种的相对遗传距离计算第45-48页
第四章 讨论第48-54页
    4.1 物种合并的合理性第48-49页
    4.2 关于无齿蚌属条形码的选择第49-51页
        4.2.1 雌雄比率不均一第49-51页
        4.2.2 雄性线粒体基因序列难以扩增第51页
        4.2.3 部分个体COI-COII序列难以扩增第51页
    4.3 DNA条形码技术的局限第51-52页
    4.4 无齿蚌属的重新分类第52-54页
        1 背角无齿蚌Anodonta woodiana第52页
        2 椭圆背角无齿蚌Anodonta elliptica第52页
        3 蚶形无齿蚌Anodonta arcaeformis第52-53页
        4 光滑无齿蚌Anodonta lucida第53页
        5 具角无齿蚌Anodonta angula第53页
        6 Anodonta shangraoensis第53-54页
第五章 结论与展望第54-56页
    5.1 主要结论第54页
    5.2 展望第54-56页
致谢第56-57页
参考文献第57-61页
附录第61-63页
攻读学位期间的研究成果第63页

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