摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 引言 | 第10-22页 |
1.1 淡水蚌的分类及其作用 | 第10-11页 |
1.1.1 淡水蚌的分类 | 第10页 |
1.1.2 淡水蚌的经济价值及生态作用 | 第10-11页 |
1.2 无齿蚌属的研究历史及分类 | 第11-14页 |
1.3 DNA条形码在分类学中的应用 | 第14-20页 |
1.3.1 DNA条形码的产生和发展 | 第14-15页 |
1.3.2 DNA条形码技术的原理 | 第15页 |
1.3.3 DNA条形码技术在分类学中的应用 | 第15-16页 |
1.3.4 DNA条形码技术与传统DNA分类(DNA Taxonomy)的关系 | 第16-17页 |
1.3.5 DNA条形码技术在蚌类分类中的运用 | 第17-19页 |
1.3.6 DNA条形码候选基因的特点 | 第19-20页 |
1.4 本研究的目的意义 | 第20-22页 |
1.4.1 研究目的 | 第20-21页 |
1.4.2 研究意义 | 第21-22页 |
第二章 材料与方法 | 第22-29页 |
2.1 样本采集与鉴定 | 第22-24页 |
2.2 实验所用试剂及仪器 | 第24页 |
2.2.1 实验试剂 | 第24页 |
2.2.2 实验仪器 | 第24页 |
2.3 实验方法 | 第24-26页 |
2.3.1 样本解剖及取样 | 第24-25页 |
2.3.2 基因组DNA提取与检测 | 第25页 |
2.3.3 扩增引物 | 第25页 |
2.3.4 PCR扩增 | 第25-26页 |
2.3.5 PCR扩增产物测序 | 第26页 |
2.4 数据处理 | 第26-29页 |
2.4.1 序列比对与校正 | 第26-27页 |
2.4.2 系统发育树的构建 | 第27页 |
2.4.3 计算种内和种间遗传距离 | 第27-29页 |
第三章 结果与分析 | 第29-48页 |
3.1 DNA提取与PCR扩增及测序 | 第29页 |
3.2 基因序列分析 | 第29-31页 |
3.2.1 COI-COII基因序列分析 | 第29-30页 |
3.2.2 ND1基因序列分析 | 第30页 |
3.2.3 三个基因联合数据分析 | 第30-31页 |
3.3 无齿蚌属物种有效性分析及其系统发育 | 第31-43页 |
3.3.1 无齿蚌属物种有效性分析 | 第31-41页 |
3.3.3 未知物种鉴定及无齿蚌属的系统发育 | 第41-43页 |
3.4 相对遗传距离的计算 | 第43-48页 |
3.4.1 物种合并前的相对遗传距离计算 | 第43-45页 |
3.4.2 有效物种的相对遗传距离计算 | 第45-48页 |
第四章 讨论 | 第48-54页 |
4.1 物种合并的合理性 | 第48-49页 |
4.2 关于无齿蚌属条形码的选择 | 第49-51页 |
4.2.1 雌雄比率不均一 | 第49-51页 |
4.2.2 雄性线粒体基因序列难以扩增 | 第51页 |
4.2.3 部分个体COI-COII序列难以扩增 | 第51页 |
4.3 DNA条形码技术的局限 | 第51-52页 |
4.4 无齿蚌属的重新分类 | 第52-54页 |
1 背角无齿蚌Anodonta woodiana | 第52页 |
2 椭圆背角无齿蚌Anodonta elliptica | 第52页 |
3 蚶形无齿蚌Anodonta arcaeformis | 第52-53页 |
4 光滑无齿蚌Anodonta lucida | 第53页 |
5 具角无齿蚌Anodonta angula | 第53页 |
6 Anodonta shangraoensis | 第53-54页 |
第五章 结论与展望 | 第54-56页 |
5.1 主要结论 | 第54页 |
5.2 展望 | 第54-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-61页 |
附录 | 第61-63页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第63页 |