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遗传性心脏传导阻滞家系全外显子测序研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
1 引言第8-10页
    1.1 心脏传导阻滞第8页
    1.2 心脏传导阻滞相关基因第8-9页
        1.2.1 SCN5A第8页
        1.2.2 HCN4第8页
        1.2.3.NKX2-5第8-9页
        1.2.4 LMNA第9页
        1.2.5 TRPM4第9页
    1.3 全外显子测序的应用第9-10页
2 资料和方法第10-15页
    2.1 患者资料和血标本采集第10页
    2.2 单个核细胞富集和保存第10页
    2.3 gDNA的抽提第10-11页
    2.4 全外显子测序第11页
    2.5 数据处理第11-13页
        2.5.1 数据产出统计第11页
        2.5.2 测序数据过滤第11页
        2.5.3 参考序列比对和数据统计第11-12页
        2.5.4 SNP检测第12-13页
        2.5.5 Indel检测第13页
        2.5.6 变异位点筛选,变异基因富集第13页
    2.6 Sanger测序验证变异位点第13页
    2.7 变异查重第13页
    2.8 在cBioPortal描述变异位的空间位置第13-14页
    2.9 绘制位点的蛋白模式图第14-15页
3 结果第15-31页
    3.1 患者资料第15-19页
    3.2 数据分析结果第19-26页
        3.2.1 测序的序列数据以FASTQ格式存储第19页
        3.2.2 用VCF格式来描述SNP及INDEL的结果第19-20页
        3.2.3 用于描述测序数据错误率的统计内容第20页
        3.2.4 目标区域测序覆盖度和测序深度结果第20-22页
        3.2.5 样本SNV注释结果第22-23页
        3.2.6 InDel检测结果第23-24页
        3.2.7 变异位点筛选结果第24-26页
    3.3 Sanger测序验证变异位点第26-30页
    3.4 变异查重第30页
    3.5 SCN5A R1139Q的空间位置第30-31页
4 讨论第31-33页
5 结论第33-34页
参考文献第34-38页
致谢第38-39页
附录第39-45页
    附录A 主要仪器与设备第39页
    附录B 缩略词及单位说明第39页
    附录C 主要试剂及耗材第39-40页
    附录D 综述第40-45页
        参考文献第44-45页

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