| Acknowledgements | 第7-14页 |
| Abstract | 第14-22页 |
| Abstract in Chinese(摘要) | 第23-30页 |
| Chapter 1 Cyclin dependent kinas 2:structure,cell cycle,and cancer | 第30-45页 |
| 1.1 Introduction | 第31-33页 |
| 1.2 Insight to the structure of CDK2 and its activation by cyclin binding | 第33-37页 |
| 1.2.1 ATP binding site comparison | 第35-37页 |
| 1.3 CDK2 inhibitory regulation | 第37-38页 |
| 1.4 Conclusion | 第38-39页 |
| Reference | 第39-45页 |
| Chapter 2 Pharmacological inhibitors of cyclin dependent kinas 2:selectivity and potency | 第45-103页 |
| 2.1 Introduction | 第46-48页 |
| 2.2 CDK2 inhibitors targeting the ATP binding pocket | 第48-80页 |
| 2.2.1 Purine analogues | 第48-58页 |
| 2.2.2 Aminothiazole-based inhibitors | 第58-61页 |
| 2.2.3 Oxindole-based inhibitors | 第61-72页 |
| 2.2.4 Pyridine-based CDK2 inhibitors | 第72-74页 |
| 2.2.5 Pyrrazole-based inhibitors | 第74-76页 |
| 2.2.6 Triazole-based inhibitors | 第76-77页 |
| 2.2.7 Quinazoline-based inhibitors | 第77-78页 |
| 2.2.8 Other ATP competitive inhibitors | 第78-80页 |
| 2.3 CDK2 inhibitors targeting allosteric ligand binding pocket | 第80-81页 |
| 2.4 CDK2 inhibitors in clinical trial | 第81-84页 |
| 2.5 Conclusion | 第84-85页 |
| References | 第85-103页 |
| Chapter 3 Molecular modeling studies to characterizeN-phenylpyrimidin-2-amines selectivity for cdk2 andcdk4 through 3d-qsar and molecular dynamics simulation | 第103-157页 |
| 3.1 Introduction | 第104-107页 |
| 3.2 Computational Methods | 第107-115页 |
| 3.2.1 Dataset for 3D-QSAR analyses | 第107-109页 |
| 3.2.2 Molecular docking simulations | 第109-111页 |
| 3.2.3 Molecular electrostatic potential(MESP)and Mulliken charge analyses | 第111-112页 |
| 3.2.4 Molecular dynamics simulations | 第112-115页 |
| 3.3 Results and Discussion | 第115-149页 |
| 3.3.1 3D-QSAR models generated by CoMFA and CoMSIA | 第115-127页 |
| 3.3.2 Docking simulated binding modes of inhibitors on CDK2 and CDK4 | 第127-131页 |
| 3.3.3 Molecular electrostatic potential(MESP) and Mulliken charge analyses | 第131-135页 |
| 3.3.4 Dynamic simulations and comprehensive analyses of structural flexibility and stability | 第135-149页 |
| 3.4 Conclusions | 第149-151页 |
| References | 第151-157页 |
| Chapter 4 Molecular simulations studies on the binding selectivity of 2-anilino-4-(thiazol-5-yl)-pyrimidines incomplexes with CDK2 and CDK7 | 第157-203页 |
| 4.1 Introduction | 第158-162页 |
| 4.3 Computational details | 第162-167页 |
| 4.3.1 Initial processing of protein structure | 第162-163页 |
| 4.3.2 Binding site comparisons | 第163-164页 |
| 4.3.3 Molecular electrostatic potential(MESP)analysis | 第164页 |
| 4.3.4 Molecular dynamics simulations | 第164-167页 |
| 4.4 Results and Discussion | 第167-195页 |
| 4.4.1 Molecular docking | 第167-171页 |
| 4.4.2 Binding site comparison | 第171-173页 |
| 4.4.4 MESP,NBO and structure based pharmacophore analyses | 第173-178页 |
| 4.4.5 Comprehensive analysis of structural flexibility and stability | 第178-195页 |
| 4.5 Conclusions | 第195-197页 |
| References | 第197-203页 |
| Chapter 5 Summary and future prospective | 第203-207页 |
| Summary | 第204-205页 |
| 5.1 Future prospective | 第205-207页 |
| Author biography | 第207页 |
| Author Introduction | 第207页 |
| Honors and Awards | 第207页 |
| List of publications | 第207页 |
| Publications from dissertation | 第207页 |
| Other Publications | 第207页 |
