| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 课题背景 | 第10-11页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第11-12页 |
| 1.3 国内外相关技术发展现状 | 第12-15页 |
| 1.3.1 蛋白质远同源性检测研究现状 | 第12-13页 |
| 1.3.2 DNA结合蛋白识别研究现状 | 第13-14页 |
| 1.3.3 集成学习在生物学中的应用现状 | 第14-15页 |
| 1.4 本文的主要研究内容和内容安排 | 第15-17页 |
| 1.4.1 主要研究内容 | 第15页 |
| 1.4.2 本文内容安排 | 第15-17页 |
| 第2章 基于伪二肽组成的蛋白质远源同源性识别方法 | 第17-27页 |
| 2.1 引言 | 第17页 |
| 2.2 蛋白质远同源性数据集的构建 | 第17-18页 |
| 2.3 蛋白质远同源性预测方法 | 第18-23页 |
| 2.3.1 序列谱方法 | 第18-19页 |
| 2.3.2 伪二肽组成 | 第19-21页 |
| 2.3.3 蛋白质远同源性的检测模型建立 | 第21-22页 |
| 2.3.4 蛋白质远同源性检测的集成学习方法 | 第22-23页 |
| 2.4 蛋白质远同源性实验结果与分析 | 第23-26页 |
| 2.4.1 性能评价指标 | 第23-24页 |
| 2.4.2 性能评估 | 第24-26页 |
| 2.5 本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 基于序列谱和伪氨基酸组成的DNA结合蛋白识别方法 | 第27-38页 |
| 3.1 引言 | 第27页 |
| 3.2 DNA结合蛋白的数据集构建 | 第27-28页 |
| 3.3 基于序列谱和伪氨基酸组成的DNA结合蛋白预测方法 | 第28-31页 |
| 3.3.1 序列谱方法 | 第28页 |
| 3.3.2 伪氨基酸组成 | 第28-30页 |
| 3.3.3 DNA结合蛋白的集成学习方法 | 第30页 |
| 3.3.4 交叉验证方法 | 第30-31页 |
| 3.4 DNA结合蛋白实验结果与分析 | 第31-36页 |
| 3.4.1 性能评价指标 | 第31页 |
| 3.4.2 性能评估 | 第31-36页 |
| 3.5 本章小结 | 第36-38页 |
| 第4章 融合序列谱和自交叉协方差的DNA结合蛋白识别方法 | 第38-44页 |
| 4.1 引言 | 第38页 |
| 4.2 基于序列谱和自交叉协方差DNA结合蛋白预测方法 | 第38-40页 |
| 4.2.1 序列谱方法 | 第38页 |
| 4.2.2 自交叉协方差方法 | 第38-39页 |
| 4.2.3 距离对方法 | 第39-40页 |
| 4.2.4 DNA结合蛋白的集成学习方法 | 第40页 |
| 4.3 DNA结合蛋白实验结果与分析 | 第40-43页 |
| 4.3.1 性能评价指标 | 第40页 |
| 4.3.2 性能评估 | 第40-43页 |
| 4.4 本章小结 | 第43-44页 |
| 第5章 基于近邻传播聚类算法的DNA结合蛋白识别方法 | 第44-50页 |
| 5.1 引言 | 第44页 |
| 5.2 基于近邻传播聚类算法的DNA结合蛋白预测方法 | 第44-47页 |
| 5.2.1 缩减字母表 | 第44-45页 |
| 5.2.2 基于缩减字母表的距离对向量化方法 | 第45页 |
| 5.2.3 距离计算方法 | 第45页 |
| 5.2.4 近邻传播聚类算法 | 第45-47页 |
| 5.3 DNA结合蛋白实验结果与分析 | 第47-49页 |
| 5.3.1 性能评价指标 | 第47页 |
| 5.3.2 性能评估 | 第47-49页 |
| 5.4 本章小结 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-60页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
