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PPARG基因对奶山羊乳腺脂肪酸代谢的调控作用研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第16-28页
    1.1 羊奶的成分及其营养价值概述第16页
    1.2 泌乳过程中脂肪酸代谢研究进展第16-21页
        1.2.1 乳腺细胞外源吸收脂肪酸第17-18页
        1.2.2 脂肪酸的活化与运输第18页
        1.2.3 脂肪酸的从头合成与去饱和化第18-19页
        1.2.4 甘油三酯的合成与乳脂滴的组装第19-20页
        1.2.5 SREBP 与乳腺脂肪酸代谢第20-21页
    1.3 PPAR 家族与脂肪酸代谢第21-26页
        1.3.1 PPAR 家族及其组织表达分布第22页
        1.3.2 PPAR 家族与其激动剂第22-24页
        1.3.3 PPARG 调控脂肪酸代谢第24-25页
        1.3.4 PPARG 与疾病第25-26页
    1.4 PPARG 在泌乳过程中的功能研究第26-27页
    1.5 本研究的目的与意义第27-28页
第二章 山羊乳腺组织转录组测序与生物信息学分析第28-37页
    2.1 材料与方法第28-29页
        2.1.1 主要试剂和仪器第28页
        2.1.2 样品采集与 RNA 提取第28页
        2.1.3 mRNA 的纯化与处理第28-29页
        2.1.4 文库构建第29页
        2.1.5 上机测序第29页
        2.1.6 数据分析与序列组装第29页
        2.1.7 转录本的功能注释第29页
        2.1.8 基因表达丰度分析第29页
    2.2 结果第29-33页
        2.2.1 转录组 de novo 拼接结果第29-30页
        2.2.2 Unigene 长度和 GC 含量分析第30-31页
        2.2.3 Unigene 功能注释第31页
        2.2.4 GO 分类第31-32页
        2.2.5 KOG 分类第32-33页
        2.2.6 脂肪酸代谢过程中的几个关键因子第33页
    2.3. 讨论第33-36页
        2.3.1 转录组测序结果的质量第33-35页
        2.3.2 山羊乳腺组织中脂肪酸代谢相关基因第35-36页
    2.4 本章小结第36-37页
第三章 PPARG 的克隆、生物信息学分析与组织表达第37-46页
    3.1 材料与方法第37-39页
        3.1.1 主要试剂第37页
        3.1.2 主要仪器第37-38页
        3.1.3 引物设计第38页
        3.1.4 山羊不同组织以及不同泌乳时期乳腺组织的采集第38页
        3.1.5 总 RNA 的提取与 cDNA 的合成第38页
        3.1.6 PPARG 的克隆与鉴定第38页
        3.1.7 PPARG 的生物信息学分析第38-39页
        3.1.8 荧光定量检测 PPARG第39页
        3.1.9 数据分析第39页
    3.2 结果第39-44页
        3.2.1 PPARG1 和 PPARG2 的克隆第39页
        3.2.2 同源性分析第39-40页
        3.2.3 结构预测与分析第40-41页
        3.2.4 组织表达分析第41-43页
        3.2.5 PPARG 在泌乳不同时期的表达差异第43-44页
    3.3 讨论第44-45页
        3.3.1 奶山羊 PPARG 基因的克隆第44页
        3.3.2 奶山羊 PPARG 基因的结构分析第44页
        3.3.3 PPARG 组织表达谱第44-45页
    3.4 本章小结第45-46页
第四章 山羊乳腺上皮细胞中 PPARG 的活性检测第46-57页
    4.1 材料与方法第46-49页
        4.1.1 主要材料第46-47页
        4.1.2 主要仪器第47页
        4.1.3 PPRE 序列和定量引物的合成第47页
        4.1.4 载体构建第47页
        4.1.5 细胞培养与处理第47-48页
        4.1.6 RNA 的提取与荧光定量 PCR 检测第48页
        4.1.7 细胞转染与处理第48页
        4.1.8 荧光素酶检测第48页
        4.1.9 MTT 试验第48-49页
        4.1.10 细胞内脂肪酸的提取第49页
        4.1.11 脂肪酸的检测第49页
        4.1.12 数据分析第49页
    4.2 结果第49-53页
        4.2.1 pGL3-PPRE 载体的构建第49页
        4.2.2 PPRE 在山羊乳腺细胞中的活性分析第49-50页
        4.2.3 PPRE 在 MCF-7 细胞中的活性分析第50页
        4.2.4 罗格列酮影响乳腺上皮细胞中脂肪酸代谢基因的表达第50-52页
        4.2.5 罗格列酮激活 PPARG 影响乳腺上皮细胞的增殖第52-53页
        4.2.6 罗格列酮激活 PPARG 对乳腺上皮细胞中脂肪酸组成的影响第53页
    4.3 讨论第53-56页
        4.3.1 PPARG 对 PPRE 荧光素酶活性的影响第53-54页
        4.3.2 罗格列酮激活 PPARG 对脂肪酸代谢相关基因的影响第54-55页
        4.3.3 罗格列酮激活 PPARG 对细胞内脂肪酸组成的影响第55页
        4.3.4 PPARG 与乳腺上皮细胞的增殖第55-56页
    4.4 小结第56-57页
第五章 PPARG 基因的 RNA 干扰研究第57-70页
    5.1 材料与方法第57-60页
        5.1.1 主要仪器设备第57页
        5.1.2 主要试验材料第57-58页
        5.1.3 山羊 PPARG 基因的 shRNA 干扰序列的设计与合成第58页
        5.1.4 pENTR/CMV-GFP/U6-shRNA 载体构建第58页
        5.1.5 pDsRed1-C1-PPARG 表达载体的构建第58-59页
        5.1.6 shRNA 有效序列的筛选第59页
        5.1.7 重组腺病毒载体的构建第59页
        5.1.8 腺病毒的包装、扩增与滴度测定第59-60页
        5.1.9 腺病毒感染乳腺上皮细胞最佳 MOI 的测定第60页
        5.1.10 PPARG 基因的 RNA 干扰效率检测第60页
        5.1.11 western blotting 试验第60页
        5.1.12 荧光定量 PCR第60页
    5.2 结果第60-68页
        5.2.1 pENTR/CMV-GFP/U6-shRNA 载体的构建第60-61页
        5.2.2 pDsRed1-C1- PPARG 载体的构建第61-62页
        5.2.3 shRNA 有效干扰序列的筛选第62-63页
        5.2.4 重组腺病毒载体的构建第63页
        5.2.5 腺病毒的包装、扩增及滴度测定第63-64页
        5.2.6 最佳感染复数 MOI(Multiplicity Of Infection)的探索第64-65页
        5.2.7 PPARG 基因干扰效率的检测第65-66页
        5.2.8 PPARG 基因干扰对脂肪酸代谢相关基因的影响第66-68页
    5.3 讨论第68-69页
        5.3.1 腺病毒的包装第68页
        5.3.2 有效 shRNA 的筛选第68页
        5.3.3 干扰 PPARG 对脂肪酸代谢相关基因的影响第68-69页
    5.4 本章小结第69-70页
第六章 PPARG1 的过表达研究第70-82页
    6.1 试验材料与方法第70-73页
        6.1.1 主要试验材料第70页
        6.1.2 主要试验仪器第70页
        6.1.3 重组腺病毒载体构建第70-71页
        6.1.4 超表达病毒 Ad-PPARG1 包装、扩增第71页
        6.1.5 细胞培养与处理第71页
        6.1.6 总 RNA 的提取与荧光定量第71-72页
        6.1.7 Western blotting第72页
        6.1.8 超表达效率检测第72页
        6.1.9 细胞内脂肪酸的提取第72页
        6.1.10 脂肪酸的检测第72页
        6.1.11 数据处理第72页
        6.1.12 超表达 PPARG1 对脂肪酸代谢影响网络图构建第72-73页
    6.2 试验结果第73-78页
        6.2.1 pAd-PPARG1 腺病毒载体的构建第73页
        6.2.2 pAd-PPARG1 腺病毒的包装与扩增第73-74页
        6.2.3 最佳感染复数 MOI(Multiplicity Of Infection)的探索第74页
        6.2.4 PPARG1 基因超表达效率的检测第74-75页
        6.2.5 过表达 PPARG1 影响脂肪酸代谢相关基因第75-77页
        6.2.6 过表达 PPARG1 对脂肪酸组成的影响第77-78页
        6.2.7 过表达 PPARG1 基因网络构建第78页
    6.3 讨论第78-81页
        6.3.1 PPARG1 对脂肪酸代谢的影响第78-79页
        6.3.2 脂肪酸代谢网络构建第79-80页
        6.3.3 PPARG1 对脂肪酸组成的影响第80-81页
    6.4 本章小结第81-82页
第七章 PPARG2 的过表达研究第82-97页
    7.1 试验材料与方法第82-85页
        7.1.1 主要试验材料第82页
        7.1.2 主要试验仪器第82页
        7.1.3 重组腺病毒载体构建第82-83页
        7.1.4 超表达病毒 Ad-PPARG2 包装、扩增第83页
        7.1.5 细胞培养与处理第83页
        7.1.6 总 RNA 的提取与荧光定量第83页
        7.1.7 Western blotting第83-84页
        7.1.8 超表达效率检测第84页
        7.1.9 细胞内脂肪酸的提取第84页
        7.1.10 脂肪酸的检测第84页
        7.1.11 数据处理第84页
        7.1.12 超表达 PPARG1 对脂肪酸代谢影响网络图构建第84-85页
    7.2 试验结果第85-90页
        7.2.1 pAd-PPARG2 腺病毒载体的构建第85页
        7.2.2 pAd-PPARG2 腺病毒的包装与扩增第85-86页
        7.2.3 最佳感染复数 MOI(Multiplicity Of Infection)的探索第86页
        7.2.4 PPARG2 基因超表达效率的检测第86-87页
        7.2.5 过表达 PPARG2 影响脂肪酸代谢相关基因第87-89页
        7.2.6 过表达 PPARG2 对脂肪酸组成的影响第89页
        7.2.7 过表达 PPARG2 基因网络构建第89-90页
    7.3 讨论第90-96页
        7.3.1 病毒载体的高效构建第90页
        7.3.2 基因表达后的翻译调控第90-91页
        7.3.3 PPARG 与脂肪酸代谢网络第91-95页
        7.3.4 PPARG 与脂肪酸的去饱和化第95-96页
    7.4 本章小结第96-97页
结论第97-98页
本研究的创新点第98-99页
存在问题及展望第99-100页
参考文献第100-116页
附录第116-122页
缩略词(Abbreviation)第122-123页
致谢第123-124页
作者简介第124页

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