| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-23页 |
| 1.1 植物抗寒性研究进展 | 第12-18页 |
| 1.1.1 冷胁迫信号转导 | 第12-13页 |
| 1.1.2 植物抗寒生理响应 | 第13-15页 |
| 1.1.3 植物抗寒性分子研究进展 | 第15-18页 |
| 1.2 转录组测序技术在植物转录研究中的应用 | 第18-20页 |
| 1.2.1 转录组简介 | 第18页 |
| 1.2.2 测序技术发展简介 | 第18-19页 |
| 1.2.3 第二代测序技术在植物转录组研究中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3 杂草稻的研究现状 | 第20-22页 |
| 1.3.1 杂草稻的抗寒性研究 | 第20页 |
| 1.3.2 杂草稻的起源研究 | 第20-22页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 冷胁迫杂草稻和栽培稻相对电导率和转录组分析 | 第23-47页 |
| 2.1 相对电导率测定 | 第23-24页 |
| 2.1.1 试验材料与试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第24页 |
| 2.2 转录组分析 | 第24-30页 |
| 2.2.1 供试材料 | 第24-25页 |
| 2.2.2 文库的构建及测序 | 第25-26页 |
| 2.2.3 生物信息分析 | 第26-27页 |
| 2.2.4 基因表达分析 | 第27-28页 |
| 2.2.5 差异表达基因功能注释 | 第28-30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-43页 |
| 2.3.1 相对电导率的测定 | 第30页 |
| 2.3.2 样品总RNA提取质量分析 | 第30-31页 |
| 2.3.3 测序结果统计 | 第31-32页 |
| 2.3.4 与参考基因组比对统计 | 第32-34页 |
| 2.3.5 基因差异表达分析 | 第34-36页 |
| 2.3.6 差异基因聚类分析 | 第36-37页 |
| 2.3.7 RNA-Seq相关性检查 | 第37-38页 |
| 2.3.8 差异基因功能注释 | 第38-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-47页 |
| 第三章 实时荧光定量和半定量分析 | 第47-55页 |
| 3.1 实时荧光定量PCR | 第47-49页 |
| 3.1.1 植物材料前期处理 | 第47页 |
| 3.1.2 反转录合成第一链cDNA | 第47页 |
| 3.1.3 内参基因和待测基因的引物合成 | 第47-48页 |
| 3.1.4 qRT-PCR扩增效率的确定及方法的选择 | 第48-49页 |
| 3.2 半定量分析 | 第49-50页 |
| 3.2.1 植物材料前期处理 | 第49页 |
| 3.2.2 反转录合成第一链cDNA | 第49页 |
| 3.2.3 内参基因和待测基因的引物合成 | 第49页 |
| 3.2.4 PCR扩增 | 第49-50页 |
| 3.3 结果与分析 | 第50-54页 |
| 3.3.1 四种水稻总RNA提取 | 第50页 |
| 3.3.2 实时荧光定量PCR溶解曲线 | 第50-51页 |
| 3.3.3 四种水稻12个基因qRT-PCR扩增结果 | 第51-53页 |
| 3.3.4 半定量结果 | 第53-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-55页 |
| 第四章 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
