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基于DNA-pooling全基因组重测序初步筛查CAD易感基因变异位点

摘要第4-7页
Summary第7-9页
主要英文缩略词表第12-13页
第一章 绪论第13-19页
    1.1 前言第13-16页
    1.2 整体设计思路第16-19页
第二章 实验材料与方法第19-27页
    2.1 实验材料第19-20页
        2.1.1 研究对象第19页
        2.1.2 实验相关的设备、试剂及软件第19-20页
    2.2 实验方法第20-25页
        2.2.1 样本处理及保存第20页
        2.2.2 外周血DNA提取、质控以及DNA pooling制备第20-22页
        2.2.3 DNA重测序第22-25页
    2.3 统计学方法第25页
        2.3.1 一般资料统计方法第25页
        2.3.2 生物信息学数据分析及统计方法第25页
    2.4 实验的技术路线图第25-27页
第三章 实验结果第27-43页
    3.1 一般资料统计第27页
    3.2 全基因组重测序易感基因变异位点筛查第27-40页
        3.2.1 全基因组重测序数据质控结果第27-28页
        3.2.2 全基因组重测序数据与参考基因组比对及质控结果第28-30页
        3.2.3 SNPs的识别与注释分析结果第30-33页
        3.2.4 InDels的识别与注释分析结果第33-37页
        3.2.5 SVs的识别与注释分析结果第37-38页
        3.2.6 CNVs的识别与注释分析结果第38-40页
    3.3 与冠心病相关易感位点功能分析第40-43页
        3.3.1 PPI网络基因筛查第40-41页
        3.3.2 易感基因变异位点GO功能分析第41-43页
第四章 讨论第43-49页
第五章 实验结论第49-51页
第六章 参考文献第51-57页
附录 综述第57-67页
    参考文献第63-67页
作者攻读学位期间科研成果第67-69页
致谢第69页

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