| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-33页 |
| ·研究背景和意义 | 第15-30页 |
| ·生物水及存在的争议 | 第15-23页 |
| ·羧基自组装单层膜的研究现状和存在的争议 | 第23-30页 |
| ·研究目的 | 第30-31页 |
| ·研究内容概述 | 第31-33页 |
| 第二章 理论背景 | 第33-43页 |
| ·分子动力学方法的理论基础 | 第33-37页 |
| ·基本原理 | 第33页 |
| ·牛顿运动方程及其数值解法 | 第33-34页 |
| ·分子力场 | 第34页 |
| ·积分步长与约束方法 | 第34-35页 |
| ·分子动力学的计算流程与模拟步骤 | 第35-37页 |
| ·量子力学计算的基本原理 | 第37-43页 |
| ·Born-Oppenheimer绝热近似 | 第37-41页 |
| ·密度泛函理论方法简介 | 第41-43页 |
| 第三章 羧基自组装单层膜上的内嵌水揭示生物分子表面水的生物功能性 | 第43-59页 |
| ·引言 | 第43-44页 |
| ·模拟与计算方法 | 第44-49页 |
| ·系统搭建 | 第44-45页 |
| ·模拟参数设置 | 第45-47页 |
| ·水的接触角的计算方法 | 第47页 |
| ·氢键能的计算方法 | 第47-48页 |
| ·氢键寿命的计算方法 | 第48页 |
| ·如何寻找最稳定的几何优化构型 | 第48-49页 |
| ·羧基自组装单层膜上的内嵌水-羧基复合结构 | 第49-50页 |
| ·羧基自组装单层膜上复合结构与水滴内的氢键分析 | 第50-52页 |
| ·水分子参与复合结构的形成 | 第52-54页 |
| ·羧基的两种构型 | 第52-53页 |
| ·水分子影响羧基自组装单层膜上的羧基构型 | 第53-54页 |
| ·讨论 | 第54-58页 |
| ·构建羧基自组装单层膜模型省略衬底 | 第54-55页 |
| ·膜表面羧基基团按照FCC(111)晶面排布 | 第55页 |
| ·衬底粗糙程度对于复合结构的影响 | 第55-57页 |
| ·分子动力学模拟收敛性的讨论 | 第57-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 第四章 内嵌水和复合结构的存在影响羧基自组装单层膜的浸润性 | 第59-75页 |
| ·引言 | 第59-60页 |
| ·模拟与计算方法 | 第60-61页 |
| ·链密度不同的羧基自组装单层膜上羧基构型的判断方法 | 第61-64页 |
| ·链密度对羧基自组装单层膜的浸润性的影响 | 第64-69页 |
| ·链密度适中时羧基自组装单层膜上的复合结构 | 第65-68页 |
| ·链密度较密或较疏时羧基自组装单层膜上水的结构 | 第68-69页 |
| ·讨论 | 第69-73页 |
| ·链密度对于羧基构型稳定性的影响 | 第69-70页 |
| ·复合结构内水分子与羧基基团的比例 | 第70-71页 |
| ·自组装单层膜链密度的取值范围 | 第71页 |
| ·链密度与浸润性的关联性的研究背景 | 第71-72页 |
| ·链密度适中区域体系水量多于其它链密度区域 | 第72-73页 |
| ·本章小结 | 第73-75页 |
| 第五章 复合结构增强羧基自组装单层膜表面疏水性的微观机制 | 第75-79页 |
| ·引言 | 第75-76页 |
| ·模拟与计算方法 | 第76页 |
| ·结果与讨论 | 第76-77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 第六章 热涨落的影响 | 第79-85页 |
| ·引言 | 第79页 |
| ·模拟与计算方法 | 第79-80页 |
| ·结果与讨论 | 第80-83页 |
| ·本章小结 | 第83-85页 |
| 第七章 总结与展望 | 第85-89页 |
| ·主要内容和结论 | 第85-86页 |
| ·展望 | 第86-89页 |
| 参考文献 | 第89-113页 |
| 攻读博士期间发表文章目录 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
