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乳酸链球菌素nisin前导肽酶NisP的结构与功能研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
目录第9-13页
符号说明第13-14页
第一章 引言第14-28页
 第一节 乳酸链球菌素nisin的主要研究第14-20页
     ·羊毛硫抗生素简介第14页
     ·乳酸链球菌素nisin研究概况第14-16页
     ·乳酸链球菌素nisin相关蛋白研究概况第16-20页
       ·NisB对nisin前体中特定丝氨酸和苏氨酸进行脱水第17-18页
       ·NisC催化羊毛硫环的形成第18-19页
       ·NisT负责修饰后nisin前体的跨膜运输第19页
       ·NisI和NisFEG使乳酸乳球菌具有对nisin的免疫性第19页
       ·NisRK双组分调节系统调节nisin的生物合成第19-20页
       ·NisP切除nisin前体的前导肽第20页
 第二节 Nisin前导肽酶NisP相关研究第20-26页
     ·丝氨酸蛋白酶研究概况第20-22页
     ·枯草杆菌酶研究概况第22-23页
     ·NisP相关研究概况第23-26页
       ·nisP基因的发现第23-24页
       ·NisP负责nisin前体中前导肽的切除第24页
       ·NisP是定位于细胞表面的丝氨酸蛋白酶第24-26页
 第三节 本论文的研究目的、意义及内容第26-27页
 第四节 论文结构安排第27-28页
第二章 NisP蛋白的晶体学研究第28-56页
 第一节 NisP的基因克隆和表达第28-37页
     ·nisP基因克隆和表达载体构建第28-32页
       ·nisP基因的克隆第28-29页
       ·NisP表达载体的构建第29-32页
     ·NisP蛋白的表达第32-33页
       ·NisP过量表达菌株的获得第32页
       ·NisP蛋白的大规模表达第32-33页
     ·NisP蛋白的纯化第33-37页
       ·亲和层析第33-34页
       ·阴离子交换层析第34-36页
       ·凝胶过滤层析第36-37页
 第二节 硒代NisP蛋白的表达及纯化第37-39页
 第三节 NisP蛋白的晶体筛选及优化第39-43页
     ·蛋白质结晶的原理及方法第39-41页
     ·NisP蛋白晶体的筛选及优化第41-43页
 第四节 硒代NisP蛋白晶体数据收集及结构解析第43-51页
     ·硒代NisP蛋白晶体数据的收集及处理第44页
     ·硒代NisP蛋白晶体结构解析第44-51页
       ·硒原子位置确定和初始相位的获得第44-45页
       ·NisP结构模型的搭建及修正第45-46页
       ·NisP蛋白结构模型的评估第46-51页
 第五节 NisP结构分析及特征第51-56页
     ·NisP蛋白结构描述第51-53页
     ·NisP蛋白的活性中心第53-54页
     ·NisP蛋白结构中结合的C末端短肽第54-56页
第三章 NisP蛋白的C末端自剪切第56-71页
 第一节 NisP蛋白C末端自剪切的酶活实验验证第56-62页
     ·NisP活性中心突变体表达载体构建第56-59页
     ·NisP活性中心突变体蛋白的表达及纯化第59-60页
     ·酶活测定第60-62页
 第二节 NisP蛋白C末端自剪切的Western blot实验验证第62-66页
     ·双标签AN-NisP蛋白的构建第62-65页
     ·双标签AN-NisP蛋白Western blot实验分析第65-66页
 第三节 NisP蛋白C末端剪切位点确认第66-71页
     ·点突变实验验证NisP蛋白自剪切位点第66-68页
     ·质谱实验验证NisP蛋白的自剪切位点第68-71页
第四章 NisP蛋白C末端自剪切意义的探索第71-80页
 第一节 NisP蛋白C末端自剪切对其活性影响的检验第71-77页
     ·体外酶活实验检测NisP对其C末端的剪切活性第71-73页
     ·抑菌实验检测体外情况下NisP蛋白在nisin成熟中活性第73-74页
     ·乳酸乳球菌内检验NisP蛋白在nisin成熟中活性第74-77页
 第二节 NisP蛋白C末端剪切对乳酸乳球菌生长的影响第77-80页
     ·乳酸乳球菌生长情况测定第77-78页
     ·相同OD_(600)下抑菌情况的测定第78-79页
     ·NisP蛋白C末端自剪切可能导致其从细胞表面释放第79-80页
第五章 NisP底物选择性的讨论第80-86页
 第一节 NisP对nisin前体的识别与切割第80-82页
 第二节 NisP对其他底物的识别与切割第82-86页
     ·NisP对其自身N末端序列的识别与切割第82-83页
     ·NisP对其自身C末端序列的识别与切割第83-84页
     ·NisP底物的比较第84-86页
第六章 NisP活性对钙离子依赖性的讨论第86-93页
 第一节 NisP蛋白结构中未结合有钙离子第86-91页
 第二节 钙离子对NisP蛋白活性影响测定第91-93页
第七章 结论第93-95页
附录A结核分枝杆菌内切核酸酶Ⅳ的结构生物学研究第95-109页
 第一节 研究背景第95-99页
  A.1.1 DNA损伤及修复第95-96页
  A.1.2 内切核酸酶Ⅳ参与了结核分枝杆菌中DNA损伤修复第96-99页
 第二节 实验过程及结果第99-109页
  A.2.1 end基因的克隆与表达载体构建第99页
  A.2.2 End蛋白的表达与纯化第99-102页
  A.2.3 End蛋白晶体筛选、数据收集及结构解析第102-104页
  A.2.4 End蛋白结构描述第104-107页
  A.2.5 讨论第107-109页
参考文献第109-118页
致谢第118-119页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第119页

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