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新腹足目贝类DNA条形码系统构建及系统发育研究

摘要第1-8页
Abstract第8-16页
第一章 文献综述第16-37页
 1 DNA 条形码第17-23页
   ·DNA 条形码的概念、原理第17-18页
   ·DNA 条形码的优越性第18-19页
   ·DNA 条形码的分析流程第19页
   ·DNA 条形码的分析方法第19-20页
   ·DNA 条形码在海洋生物中的应用第20-22页
   ·基于 DNA 条形码和传统分类学的整合物种鉴定第22-23页
 2 分子系统发育学第23-26页
   ·系统发育学的发展第23页
   ·分子系统发育学的概念第23-24页
   ·分子系统发育学的分析方法第24-26页
 3 新腹足目贝类概况第26-28页
   ·新腹足目贝类的形态特征第26-27页
   ·新腹足目贝类的生活习性第27-28页
   ·新腹足目贝类的地理分布第28页
   ·新腹足目系统发育第28页
 4 骨螺科贝类概况第28-34页
   ·外部形态特征第29页
   ·生活习性与地理分布第29页
   ·形态学物种鉴定第29-31页
   ·基于形态学和分子方法的系统发育研究第31-34页
 5 织纹螺属贝类概况第34-35页
   ·外部形态特征第34页
   ·生活习性与地理分布第34页
   ·形态学物种鉴定第34-35页
   ·织纹螺属贝类食品安全问题第35页
 6 本研究的立题依据、研究内容及其目的意义第35-37页
   ·立题依据第35-36页
   ·研究内容及其目的意义第36-37页
第二章 骨螺科贝类DNA 条形码与系统发育研究第37-57页
 0 引言第37-38页
 1 材料与方法第38-46页
   ·样品采集与鉴定第38页
   ·DNA 提取、PCR 扩增与测序第38-44页
   ·数据分析第44-46页
 2 结果第46-54页
   ·基于 DNA 条形码的物种鉴定第46-47页
     ·COI 条形码分析第46页
     ·16S rDNA 条形码分析第46-47页
     ·核基因条形码分析第47页
     ·红螺属物种鉴定第47页
   ·骨螺科内亚科间的系统发育关系第47-54页
 3 讨论第54-56页
   ·骨螺科贝类 COI 特异性引物第54页
   ·线粒体和核基因条形码的功能比较第54-55页
   ·骨螺科内亚科间的进化关系第55-56页
 4 结论第56-57页
第三章 织纹螺属贝类隐存多样性研究第57-78页
 0 引言第57-59页
 1 材料与方法第59-60页
   ·样品采集与鉴定第59页
   ·DNA 提取,PCR 扩增与测序第59页
   ·距离法和单系法条形码分析第59-60页
   ·特征法条形码分析第60页
 2 结果第60-74页
   ·基于单系法、距离法和特征法的 COI 条形码构建第65页
   ·基于单系法和特征法的 16S rDNA 条形码构建第65-66页
   ·基于单系法和特征法的 ITS-1 条形码构建第66-74页
 3 讨论第74-78页
   ·织纹螺属隐存多样性第74-75页
   ·DNA 条形码物种鉴定第75-78页
第四章 新腹足目贝类分子系统发育研究第78-100页
 0 引言第78-80页
 1 材料与方法第80-90页
   ·样品的采集第80页
   ·DNA 提取、PCR 扩增与 DNA 测序第80页
   ·序列编辑、整合与分析第80-88页
   ·系统发生树的构建第88-90页
     ·模型选择第89页
     ·贝叶斯系统发育树的构建第89页
     ·最大简约法系统发育树的构建第89-90页
     ·最大似然法系统发育树的构建第90页
 2 结果第90-92页
   ·序列长度与特征第90页
   ·单基因数据集的系统发育分析第90页
   ·基于整合数据集的新进腹足总目系统发育分析第90-91页
   ·基于整合数据集的新腹足目系统发育分析第91-92页
 3 讨论第92-99页
   ·基于多基因位点和大量样本分析的新进腹足总目的系统发育第92-97页
   ·多基因位点和大量样本对新腹足目贝类系统发育研究的影响第97-98页
   ·基于整合数据集的新腹足目系统发育分析第98-99页
 4 结论第99-100页
第五章 DNA 条形码分析方法的比较研究第100-119页
 0 引言第100-101页
 1 材料与方法第101-105页
   ·样品采集第101-102页
   ·DNA 提取,PCR 扩增与测序第102页
   ·距离法和单系法条形码分析第102-104页
   ·特征法条形码分析第104-105页
 2 结果第105-116页
   ·基于距离法的条形码分析结果第105-107页
   ·单系法分析结果第107-108页
   ·特征法分析结果第108-116页
     ·种水平第108页
     ·属水平第108-116页
 3 讨论第116-118页
   ·单系法和距离法 DNA 条形码物种鉴定第116-117页
   ·特征法分析第117-118页
 4 结论第118-119页
参考文献第119-133页
致谢第133-134页
攻读学位期间已发表的学术成果第134-135页

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