| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 模型符号说明 | 第9-10页 |
| 英文缩略词 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-18页 |
| ·植物数量性状遗传体系 | 第11页 |
| ·植物数量性状主基因+多基因混合遗传分析方法 | 第11-13页 |
| ·植物数量性状主基因+多基因混合遗传研究进展 | 第13-16页 |
| ·植物数量性状分离分析软件包研究进展 | 第16-17页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 SEA软件包的原理与方法 | 第18-25页 |
| ·分离分析法混合分布理论 | 第18-22页 |
| ·基本概念 | 第18页 |
| ·似然函数 | 第18页 |
| ·AIC准则 | 第18-19页 |
| ·适合性检验 | 第19页 |
| ·分布参数的极大似然估计 | 第19-20页 |
| ·极大似然估计的EM算法 | 第20-22页 |
| ·分离世代个体的后验概率 | 第22页 |
| ·SEA软件包的编程语言与集成环境 | 第22-25页 |
| ·C/C++编程语言 | 第22-23页 |
| ·Microsoft Visual Studio 2010可视化集成编程环境 | 第23-25页 |
| 第三章 软件系统分析与设计 | 第25-31页 |
| ·软件系统分析 | 第25-26页 |
| ·原有研究基础 | 第25页 |
| ·试验研究条件 | 第25-26页 |
| ·软件系统设计 | 第26-31页 |
| ·总体目标 | 第26页 |
| ·计算流程图 | 第26页 |
| ·开发的关键技术 | 第26页 |
| ·使用平台及系统要求 | 第26-27页 |
| ·支持数据文件格式 | 第27-28页 |
| ·功能设计 | 第28-29页 |
| ·主界面设计 | 第29-31页 |
| 第四章 植物数量性状分离分析软件包的改进 | 第31-39页 |
| ·界面设计 | 第31页 |
| ·功能模块 | 第31-32页 |
| ·模型选择功能模块 | 第31页 |
| ·遗传参数计算功能模块 | 第31-32页 |
| ·分离世代个体的后验概率计算模块 | 第32页 |
| ·结果输出格式 | 第32页 |
| ·算法模块 | 第32-39页 |
| ·线性算法包Clapack V3.1.1 | 第33-36页 |
| ·约束条件的线性方程求解 | 第33-34页 |
| ·最小二乘法求解遗传参数 | 第34-36页 |
| ·Boost V1.51.0 | 第36-39页 |
| ·似然函数和概率的计算 | 第36-37页 |
| ·模型适合的均匀性检验的概率计算 | 第37页 |
| ·Smirnov检验_nW~2和Kolmogorov检验D_n的概率计算 | 第37-39页 |
| 第五章 系统实现与Monte Carlo模拟研究 | 第39-58页 |
| ·软件系统实现 | 第39-40页 |
| ·软件系统类图 | 第39-40页 |
| ·参数极大似然估计算法实现 | 第40页 |
| ·软件的界面与功能 | 第40-50页 |
| ·单世代分离分析软件功能 | 第40-46页 |
| ·F_2单世代分离分析软件(SEA-F2)功能 | 第40-45页 |
| ·F_(2:3)单世代分离分析软件(SEA-F3)功能 | 第45页 |
| ·回交自交系BIL分离分析软件(SEA-BIL)功能 | 第45页 |
| ·B_(1:2)和B_(2:2)家系群体分离分析软件(SEA-BCF)功能 | 第45-46页 |
| ·多世代分离分析软件功能 | 第46-47页 |
| ·P_1、P_2、F_1和F_2四世代联合分离分析软件(SEA-G4F2)功能 | 第46页 |
| ·P_1、P_2、F_1和F_(2.3)四世代联合分离分析软件(SEA-G4F3)功能 | 第46页 |
| ·P_1、P_2、F_1、B_(1:2)和B_(2:2)联合分离分析软件(SEA-G5BCF)功能 | 第46-47页 |
| ·P_1、P_2、F_1、F_2和F_(2:3)五世代联合分离分析软件(SEA-G5)功能 | 第47页 |
| ·分离世代个体后验概率分析软件(GClasser)功能 | 第47-50页 |
| ·Monte Carlo模拟研究 | 第50-58页 |
| ·F_2单世代分离分析(SEA-F2) | 第50-51页 |
| ·F_(2:3)单世代分离分析(SEA-F3) | 第51-52页 |
| ·回交自交系BIL分离分析(SEA-BIL) | 第52页 |
| ·P_1、P_2、F_1和F_2四世代联合分离分析(SEA-G4F2) | 第52-53页 |
| ·P_1、P_2、F_1和F_(2:3)四世代联合分离分析(SEA-G4F3) | 第53-54页 |
| ·P_1、P_2、F_1、F_2和F_(2:3)五世代联合分离分析(SEA-G5) | 第54-55页 |
| ·B_(1:2)和B_(2:2)家系群体分离分析(SEA-BCF) | 第55-56页 |
| ·P_1、P_2、F_1、B_(1:2)和B_(2:2)联合分离分析(SEA-G5BCF) | 第56-58页 |
| 第六章 讨论 | 第58-61页 |
| ·植物数量性状分离分析与QTL定位等遗传分析方法的比较 | 第58页 |
| ·不同编译环境的比较 | 第58-59页 |
| ·植物数量性状分离分析软件包(SEA) | 第59-61页 |
| ·数据的导入 | 第59-60页 |
| ·结果的分析 | 第60页 |
| ·数据质量 | 第60-61页 |
| 全文结论与创新点 | 第61-62页 |
| 全文结论 | 第61页 |
| 创新点 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 附：硕士期间己发表和待发表的相关论文 | 第68页 |
