H9N2重组病株药物分子动力学与代谢核心研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 1 绪论 | 第12-22页 |
| ·引言 | 第12-13页 |
| ·H9N2禽流感病毒对人类的危害与威胁 | 第13-14页 |
| ·H9N2与人类新陈代谢网络的研究现状 | 第14-15页 |
| ·H9N2研究涉及的交叉领域 | 第15-19页 |
| ·本文主要研究内容与意义 | 第19-22页 |
| 2 H9N2禽流感病毒研究方法 | 第22-42页 |
| ·H9N2禽流感病毒介绍 | 第22-28页 |
| ·血凝素 | 第24-25页 |
| ·神经氨酸酶 | 第25-27页 |
| ·M2蛋白质 | 第27-28页 |
| ·生物信息学研究概述 | 第28-32页 |
| ·生物信息学的定义与意义 | 第29页 |
| ·生物信息学的研究对象与内容 | 第29-31页 |
| ·主要的生物信息学数据库 | 第31-32页 |
| ·新陈代谢网络的研究内容 | 第32-36页 |
| ·生物算法、力学与优化 | 第36-41页 |
| ·生物算法 | 第36-37页 |
| ·生物统计学 | 第37页 |
| ·统计力学 | 第37-38页 |
| ·结构优化算法 | 第38-39页 |
| ·分子力学 | 第39页 |
| ·分子力场 | 第39-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 3 H9N2中HA和NA密码子偏好性和重组分析 | 第42-60页 |
| ·H9N2基因序列数据来源 | 第42页 |
| ·密码子偏好性方法与分析 | 第42-51页 |
| ·动态规划算法 | 第42-43页 |
| ·序列比对算法 | 第43-45页 |
| ·密码子偏好性 | 第45-47页 |
| ·对应分析方法 | 第47页 |
| ·HA和NA密码子偏好性分析 | 第47-51页 |
| ·基因重组方法与分析 | 第51-59页 |
| ·基因重组 | 第51-52页 |
| ·ML系统进化树 | 第52-53页 |
| ·重组结果分析 | 第53-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 4 H9N2中M2蛋白质分子动力学分析 | 第60-78页 |
| ·M2蛋白质模板选取 | 第60-61页 |
| ·分子动力学 | 第61-65页 |
| ·蛋白质分子动力学 | 第65-69页 |
| ·蛋白质结构分子动力学 | 第65-67页 |
| ·蛋白质分子同源模建 | 第67-68页 |
| ·蛋白质结构预测与功能分析 | 第68-69页 |
| ·同源模建、精修与检验 | 第69-72页 |
| ·同源模建 | 第69-70页 |
| ·精修同源模型 | 第70-71页 |
| ·模型检验 | 第71-72页 |
| ·结果和讨论 | 第72-77页 |
| ·残基预测 | 第72-74页 |
| ·分子对接 | 第74-76页 |
| ·M2蛋白质药物分析 | 第76-77页 |
| ·本章小结 | 第77-78页 |
| 5 人体代谢核心网络的复杂网络分析 | 第78-116页 |
| ·引言 | 第78页 |
| ·复杂网络算法 | 第78-89页 |
| ·新陈代谢网络模型的获取与整理 | 第89-90页 |
| ·新陈代谢网络的拓扑结构分析 | 第90-103页 |
| ·蝴蝶结结构 | 第90-94页 |
| ·小世界效应 | 第94-96页 |
| ·节点的度分布 | 第96-100页 |
| ·自相似特性 | 第100-103页 |
| ·新陈代谢网络的社团结构 | 第103-110页 |
| ·新陈代谢网络的关键节点 | 第110-114页 |
| ·本章小结 | 第114-116页 |
| 结论 | 第116-118页 |
| 展望 | 第118-119页 |
| 创新点摘要 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-136页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第136-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 作者简介 | 第138-139页 |
