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桑树干旱胁迫转录组测序和P5CS基因的克隆及表达分析

摘要第1-8页
Abstract第8-14页
第1章 绪论第14-24页
   ·研究现状第14-22页
     ·桑树抗旱与 P5CS 基因的研究进展第14-19页
     ·转录组测序(RNAseq)现状第19-22页
   ·研究目的和意义第22-24页
     ·桑树中 P5CS 基因的克隆与表达分析第22-23页
     ·桑树干旱胁迫转录组测序(RNAseq)及差异基因的表达鉴定第23-24页
第2章 桑树中 P5CS(△1吡咯啉5羧酸合成酶)基因的克隆及表达分析第24-39页
   ·材料第24-25页
     ·材料与试剂第24页
     ·主要仪器第24-25页
   ·实验方法第25-29页
     ·桑树总 RNA 提取第25-26页
     ·引物设计第26页
     ·第一链 cDNA 的合成及 RTPCR第26-27页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第27页
     ·从琼脂糖凝胶中回收 DNA 片段第27-28页
     ·DNA 片段的连接转化和培养第28页
     ·桑树 P5CS 全长基因获得第28页
     ·桑树 P5CS 基因的生物信息学分析第28-29页
     ·桑树 P5CS 基因的胁迫表达分析第29页
   ·结果与分析第29-36页
     ·桑树 P5CS 基因的同源性克隆第29-30页
     ·桑树 P5CS 基因 cDNA 全长的克隆第30-31页
     ·桑树 P5CS 基因的全长 cDNA 序列分析第31-32页
     ·桑树 P5CS 基因编码氨基酸的同源性与系统进化分析第32-34页
     ·桑树 P5CS 基因在胁迫条件下的表达分析第34-36页
   ·讨论第36-39页
第3章 桑树干旱胁迫的转录组测序(RNAseq)及差异基因的鉴定第39-57页
   ·材料与方法第39-45页
     ·植物材料及试剂第39-40页
     ·样品总 RNA 提取第40页
     ·测序文库的构建第40页
     ·簇生成和上机测序第40-42页
     ·测序数据处理与分析第42-43页
     ·差异基因的表达鉴定第43-45页
   ·结果与分析第45-54页
     ·样品及测序的质检第45-47页
     ·测序数据的组装与分析第47-48页
     ·数据库注释和功能分类第48-51页
     ·SSR 注释分析第51-52页
     ·差异表达基因分析第52-53页
     ·筛选基因的鉴定分析第53-54页
   ·讨论第54-57页
结论与展望第57-59页
参考文献第59-65页
已登录 GenBank 序列号第65-66页
攻读硕士学位期间发表的论文第66-67页
致谢第67页

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