| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-13页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| ·棉属的分类和利用 | 第14-17页 |
| ·棉属的分类 | 第14-15页 |
| ·棉属的利用 | 第15-17页 |
| ·棉花干旱转录组研究 | 第17-20页 |
| ·棉花和干旱 | 第17-18页 |
| ·转录组水平的耐旱研究 | 第18-19页 |
| ·高通量转录组测序 | 第19-20页 |
| ·EST及EST-SSR | 第20-23页 |
| ·EST概述及进展 | 第20-21页 |
| ·EST-SSR概述及进展 | 第21-23页 |
| ·遗传图谱 | 第23-28页 |
| ·遗传图谱概述 | 第23-24页 |
| ·遗传图谱构建的理论基础 | 第24-25页 |
| ·作图群体的选择 | 第25-26页 |
| ·棉花种间高密度遗传图谱研究进展 | 第26-28页 |
| ·研究的目的及意义 | 第28-30页 |
| 第二章 达尔文氏棉幼苗干旱胁迫条件下Solexa转录组测序 | 第30-44页 |
| ·实验材料与方法 | 第30-34页 |
| ·实验材料 | 第30-31页 |
| ·实验方法 | 第31-34页 |
| ·结果与分析 | 第34-41页 |
| ·RNA质量检测 | 第34-35页 |
| ·转录组测序及拼接 | 第35页 |
| ·基于全部转录本GC含量分析 | 第35-36页 |
| ·基因注释和功能分类 | 第36-39页 |
| ·差异表达基因分析和富集分析 | 第39-41页 |
| ·讨论 | 第41-44页 |
| ·达尔文氏棉干旱相关EST的规模化获得 | 第41-42页 |
| ·高丰度表达差异基因分析 | 第42-44页 |
| 第三章 达尔文氏棉EST-SSR标记开发与利用 | 第44-61页 |
| ·实验材料和方法 | 第44-50页 |
| ·实验材料 | 第44-45页 |
| ·实验试剂 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46-49页 |
| ·数据处理 | 第49-50页 |
| ·结果与分析 | 第50-55页 |
| ·EST-SSR发生频率 | 第50页 |
| ·EST-SSR位点的特征分布 | 第50-52页 |
| ·EST-SSR新标记开发及多态性检测 | 第52-53页 |
| ·EST-SSR引物的多态性信息含量和可转移性分析 | 第53页 |
| ·遗传相似系数和聚类分析 | 第53-54页 |
| ·陆达F2群体遗传图谱上的定位 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-61页 |
| ·关于EST-SSR的特征 | 第55-57页 |
| ·关于SSR标记的冗余性 | 第57-58页 |
| ·关于新开发标记的多态性 | 第58页 |
| ·关于EST-SSR可转移性及棉属的聚类分析 | 第58-59页 |
| ·关于EST-SSR遗传图谱定位 | 第59-61页 |
| 第四章 陆地棉×达尔文氏棉种间高密度遗传图谱构建 | 第61-80页 |
| ·实验材料和方法 | 第62-64页 |
| ·供试材料 | 第62页 |
| ·群体构建 | 第62页 |
| ·棉花基因组DNA提取 | 第62页 |
| ·SSR多态性引物筛选 | 第62页 |
| ·群体基因分型数据读取及命名 | 第62-63页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第63-64页 |
| ·结果与分析 | 第64-77页 |
| ·不同SSR引物的多态性 | 第64-65页 |
| ·多态性引物对群体基因分型 | 第65-66页 |
| ·定位到遗传连锁图谱的SSR标记 | 第66页 |
| ·遗传连锁图谱的特征 | 第66-67页 |
| ·多位点引物在染色体上的分布 | 第67-77页 |
| ·讨论 | 第77-80页 |
| ·关于作图群体的选择 | 第77页 |
| ·关于图谱中存在的偏分离 | 第77-78页 |
| ·关于构建的高密遗传图谱 | 第78-80页 |
| 第五章 全文结论及下一步研究展望 | 第80-82页 |
| ·全文结论 | 第80-81页 |
| ·下一步研究展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-94页 |
| 附录 | 第94-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
| 作者简历 | 第122页 |