基于生物相关谱的化合物活性预测及其网络服务实现
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第10-15页 |
| ·药物发现的困境 | 第10-11页 |
| ·化学空间 | 第11页 |
| ·生物相关化合物的重要性 | 第11-12页 |
| ·生物相关性的提出 | 第12-14页 |
| ·生物相关性 | 第13页 |
| ·生物相关谱 | 第13-14页 |
| ·研究内容 | 第14-15页 |
| 2 数据和方法 | 第15-23页 |
| ·化合物数据集 | 第15-16页 |
| ·KEGG数据库 | 第15页 |
| ·DrugBank数据库 | 第15页 |
| ·MDDR数据库 | 第15页 |
| ·ACD数据库 | 第15-16页 |
| ·FDA批准上市NMEs | 第16页 |
| ·支持向量机 | 第16-18页 |
| ·支持向量机简介 | 第16-17页 |
| ·模型评价方法 | 第17-18页 |
| ·工具与软件 | 第18-19页 |
| ·MOLPRINT 2D | 第18页 |
| ·Open Babel | 第18页 |
| ·Pipeline Pilot | 第18-19页 |
| ·LIBSVM | 第19页 |
| ·编写的脚本及程序 | 第19页 |
| ·BRCD的构建 | 第19-20页 |
| ·BR与BRS的计算 | 第20-21页 |
| ·BRS的计算方法 | 第20页 |
| ·BR的计算方法 | 第20-21页 |
| ·BioRel网络服务 | 第21-23页 |
| 3 化合物活性预测模型 | 第23-34页 |
| ·数据与方法 | 第23-24页 |
| ·化合物数据集 | 第23-24页 |
| ·化合物活性预测模型构建 | 第24页 |
| ·结果与讨论 | 第24-33页 |
| ·BRS表征能力的验证 | 第24-28页 |
| ·化合物活性预测模型的评价 | 第28-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 4 基于生物相关谱的网络服务BioRel的实现 | 第34-40页 |
| ·数据与方法 | 第34页 |
| ·网络服务的构建 | 第34页 |
| ·络服务流程与功能 | 第34-36页 |
| ·计算BR、BRS | 第35页 |
| ·BioRel集成的判别模型 | 第35-36页 |
| ·BioRel集成的回归模型 | 第36页 |
| ·结果与讨论 | 第36-40页 |
| ·BioRel网络服务使用 | 第36-40页 |
| 总结 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
