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水稻细菌性条斑病菌Tn5突变体的表型筛选与突变位点定位

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 前言第12-25页
   ·水稻细菌性条斑病及其病原菌第12-15页
     ·水稻细菌性条斑病第12-13页
     ·水稻细菌性条斑病菌第13页
     ·水稻细菌性条斑病菌广西菌株第13-14页
     ·水稻细菌性条斑病菌基因组测序研究进展第14-15页
   ·黄单胞菌的主要致病因子第15-20页
     ·Ⅲ型分泌系统第16-17页
     ·胞外多糖与脂多糖第17-18页
     ·胞外水解酶第18-19页
     ·其它致病相关因子第19-20页
   ·转座子插入突变在细菌功能基因组研究中的应用第20-23页
     ·Tn5转座子的特征第20-21页
     ·Tn5转座子的作用机制第21页
     ·Tn5插入突变体库的应用第21-22页
     ·快速获取突变体侧翼序列的方法—质粒拯救第22-23页
   ·本研究的意义、内容和目的第23-25页
     ·研究意义第23页
     ·主要内容与研究目的第23-25页
第二章 材料与方法第25-44页
   ·实验材料第25-31页
     ·菌株与质粒第25-26页
     ·引物第26-27页
     ·抗生素第27页
     ·培养基第27-30页
     ·溶液与缓冲液第30-31页
     ·实验植株第31页
   ·常规微生物学操作第31-34页
     ·细菌的培养与保存第31-32页
     ·表型检测第32-33页
     ·重组质粒的阳性筛选第33页
     ·三亲本接合实验第33-34页
   ·常规分子生物学操作第34-40页
     ·质粒DNA的提取第34页
     ·细菌基因组DNA的提取第34-35页
     ·DNA的纯化第35-36页
     ·DNA的酶切第36页
     ·DNA的电泳第36-37页
     ·DNA的连接第37页
     ·质粒DNA的转化第37-39页
     ·聚合酶链式反应第39-40页
   ·Tn5插入突变体库的构建第40-41页
   ·质粒拯救第41-42页
   ·转座子侧翼序列分析第42页
   ·缺失突变体的构建第42-43页
   ·互补菌株的构建第43页
   ·植株试验第43-44页
     ·致病性的检测第43页
     ·HR反应试验第43-44页
第三章 结果与分析第44-70页
   ·突变体库的构建第44-46页
     ·建库菌株Xoc GX01的PCR验证第44页
     ·Xoc GX01电转感受态细胞的活性检测第44-45页
     ·Tn5随机插入突变第45-46页
   ·Tn5插入突变体库的筛选第46-48页
     ·Tn5插入突变体的PCR验证第46-47页
     ·Tn5插入突变体的表型检测第47-48页
   ·Tn5突变位点定位第48-53页
     ·质粒拯救第48-49页
     ·Tn5转座子侧翼序列的全基因组比对第49-51页
     ·Tn5插入突变体定位信息分析第51-53页
   ·XOC2200和XOC2216的功能研究第53-70页
     ·XOC2200和XOC2216生物信息学分析第53-54页
     ·XOC2200和XOC2216缺失突变体的构建第54-59页
     ·突变体功能互补菌株的构建第59-63页
     ·突变体与互补菌株的生理生化特性分析第63-70页
第四章 总结与讨论第70-75页
   ·结论第70-72页
     ·利用Tn5转座子随机突变获得的Xoc GX01插入突变体库第70页
     ·Tn5插入突变体表型的筛选第70-71页
     ·质粒拯救法快速获取转座子侧翼序列第71页
     ·Tn5插入突变体与缺失突变体第71-72页
   ·讨论第72-75页
     ·Tn5插入突变体中转座子插入拷贝数的确定第72页
     ·获取转座子侧翼序列的方法第72-73页
     ·XOC2200和XOC2216的功能分析第73-75页
参考文献第75-84页
附录第84-86页
致谢第86-87页
攻读学位期间发表论文情况第87页

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