节节麦基因组数据平台的构建
| 提要 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| ·数据平台开发的背景及意义 | 第11-12页 |
| ·基因组测序 | 第12-15页 |
| ·DNA 测序技术 | 第12-14页 |
| ·短序列组装和分类 | 第14-15页 |
| ·主要内容及意义 | 第15-16页 |
| 第2章 分子生物信息数据库背景 | 第16-21页 |
| ·生物信息学数据库概述 | 第16-17页 |
| ·分子生物信息数据库分类 | 第17-18页 |
| ·分子生物信息数据库的多样性 | 第17-18页 |
| ·一次和二次数据库 | 第18页 |
| ·节节麦基因组的生物背景 | 第18-19页 |
| ·国内外小麦基因组数据库发展现状 | 第19-20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第3章 需求分析和总体设计 | 第21-26页 |
| ·数据平台需求分析 | 第21-22页 |
| ·数据组装和分析的工作流程 | 第21页 |
| ·数据平台的前台功能设计 | 第21-22页 |
| ·数据平台可行性分析 | 第22-24页 |
| ·经济可行性分析 | 第23页 |
| ·技术可行性分析 | 第23页 |
| ·组织可行性分析 | 第23-24页 |
| ·社会可行性分析 | 第24页 |
| ·数据平台总体设计 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第4章 重叠群构建算法与序列分析 | 第26-48页 |
| ·重叠群构建算法模型的设计 | 第26-29页 |
| ·重叠群构建算法的现存问题 | 第26-27页 |
| ·重叠群构建算法的架构和流程 | 第27-28页 |
| ·重叠群构建算法的输入序列 | 第28-29页 |
| ·重叠群构建算法模型的实现 | 第29-36页 |
| ·基于 BWT 参考比对的组装 | 第29-34页 |
| ·优化组装模型的建立 | 第34-35页 |
| ·运行结果的统计 | 第35-36页 |
| ·系统评估 | 第36-42页 |
| ·测试数据与评估环境 | 第36页 |
| ·系统比较分析 | 第36-38页 |
| ·系统准确性分析 | 第38-41页 |
| ·系统性能评估 | 第41-42页 |
| ·序列分析流程 | 第42-43页 |
| ·SNPS 的挖掘与分类 | 第43-46页 |
| ·小麦基因组 SNPs 的研究现状 | 第43-44页 |
| ·SNPs 的检测 | 第44-45页 |
| ·SNPs 的分类 | 第45-46页 |
| ·基因本体论富集分析 | 第46-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第5章 节节麦基因组数据平台的详细设计 | 第48-68页 |
| ·节节麦基因组数据库的设计 | 第48-52页 |
| ·数据库的逻辑设计 | 第48-49页 |
| ·数据库的物理设计 | 第49-52页 |
| ·功能模块的设计与实现 | 第52-67页 |
| ·数据平台的主页设计 | 第52-54页 |
| ·用户管理模块 | 第54-56页 |
| ·基因组查询模块 | 第56-58页 |
| ·基因组展示模块 | 第58-61页 |
| ·基因组可视化模块 | 第61-63页 |
| ·下载管理模块 | 第63-64页 |
| ·生物信息学工具 | 第64-65页 |
| ·其他功能的实现 | 第65-67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 第6章 总结与展望 | 第68-70页 |
| ·主要工作总结 | 第68-69页 |
| ·未来工作展望 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
