| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-48页 |
| ·组蛋白翻译后修饰 | 第12-24页 |
| ·组蛋白 | 第12页 |
| ·蛋白变体 | 第12-14页 |
| ·翻译后修饰 | 第14-17页 |
| ·组蛋白密码 | 第17-20页 |
| ·质谱分析方法 | 第20-24页 |
| ·疾病组蛋白翻译后修饰 | 第24页 |
| ·定量蛋白质组学 | 第24-34页 |
| ·绝对定量 | 第25-26页 |
| ·相对定量 | 第26-31页 |
| ·定量新方法 | 第31-32页 |
| ·定量方法比较 | 第32-33页 |
| ·定量分析软件 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-48页 |
| 第二章 基于质谱组蛋白翻译后修饰定性方法研究 | 第48-81页 |
| ·研究背景 | 第48-49页 |
| ·实验部分 | 第49-56页 |
| ·试剂与材料 | 第49-50页 |
| ·仪器设备 | 第50页 |
| ·溶液配置 | 第50-51页 |
| ·组蛋白提取及胶内鉴定 | 第51-54页 |
| ·在线分子质量测定 | 第54页 |
| ·反相色谱分离收集 | 第54页 |
| ·多酶酶解 | 第54-55页 |
| ·酶解肽段反相色谱质谱分析 | 第55页 |
| ·酶解肽段亲水色谱质谱分析 | 第55-56页 |
| ·酶解肽段数据库搜索 | 第56页 |
| ·甲基化标准肽段特征离子确认 | 第56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-74页 |
| ·组蛋白提取及胶内鉴定 | 第56-59页 |
| ·在线分子质量测定 | 第59-64页 |
| ·酶解肽段反相色谱质谱分析 | 第64-68页 |
| ·酶解肽段亲水色谱质谱分析 | 第68-71页 |
| ·甲基化标准肽段特征离子确认 | 第71-74页 |
| ·本章小结 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-80页 |
| 附录 | 第80-81页 |
| 第三章 体内终端氨基酸标记定量蛋白质组学新方法 | 第81-108页 |
| ·研究背景 | 第81-83页 |
| ·实验部分 | 第83-87页 |
| ·试剂与材料 | 第83-84页 |
| ·仪器设备 | 第84页 |
| ·溶液配置 | 第84-85页 |
| ·细胞培养 | 第85页 |
| ·全蛋白提取 | 第85页 |
| ·细胞标记效率确定 | 第85页 |
| ·细胞全蛋白混合、还原烷基化及酶解 | 第85-86页 |
| ·离线二维强阳离子交换-反相色谱质谱分析 | 第86页 |
| ·蛋白质定性搜库分析 | 第86-87页 |
| ·蛋白质定量分析 | 第87页 |
| ·重复性和动态范围测试 | 第87页 |
| ·结果和讨论 | 第87-103页 |
| ·IVTAL方法的理论分析 | 第87-91页 |
| ·细胞标记效率确认 | 第91-93页 |
| ·Arg-C和Lys-N酶解条件确定 | 第93页 |
| ·蛋白质鉴定搜库条件的确定 | 第93-95页 |
| ·IVTAL方法在HeLa标记细胞中的应用 | 第95-97页 |
| ·IVTAL方法的重复性 | 第97页 |
| ·IVTAL方法的动态范围 | 第97-100页 |
| ·IVTAL方法中提供的补充定量信息 | 第100-101页 |
| ·IVTAL对于蛋白质翻译后修饰定量分析的优势 | 第101-102页 |
| ·IVTAL对于蛋白质定性的优势 | 第102-103页 |
| ·本章小结 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-108页 |
| 第四章 二级离子对定量数据分析和优化软件 | 第108-143页 |
| ·研究背景 | 第108-109页 |
| ·实验部分 | 第109-112页 |
| ·ITMSQ软件定量模块 | 第109-110页 |
| ·b,y碎片离子质量偏差对IVTAL定量准确度的影响 | 第110-111页 |
| ·b,y碎片离子强度对IVTAL定量准确度的影响 | 第111页 |
| ·ITMSQ软件优化模块 | 第111-112页 |
| ·IVTAL方法变化蛋白上下调界限的确定 | 第112页 |
| ·实际样品统计学分析 | 第112页 |
| ·结果和讨论 | 第112-122页 |
| ·ITMSQ软件定量思路 | 第112-113页 |
| ·ITMSQ软件优化思路 | 第113-114页 |
| ·ITMSQ软件在IVTAL方法中的应用 | 第114-122页 |
| ·本章小结 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-126页 |
| 附录 | 第126-143页 |
| 第五章 全面体内终端氨基酸标记定量蛋白质组学新方法 | 第143-181页 |
| ·研究背景 | 第143-144页 |
| ·实验部分 | 第144-149页 |
| ·试剂与材料 | 第144-145页 |
| ·仪器设备 | 第145页 |
| ·溶液配置 | 第145-146页 |
| ·甲基化标记 | 第146页 |
| ·细胞培养 | 第146页 |
| ·细胞全蛋白提取 | 第146页 |
| ·细胞标记效率确定 | 第146页 |
| ·细胞全蛋白还原烷基化及trypsin酶解和甲基化标记 | 第146-147页 |
| ·离线两维高pH反相-低pH反相色谱质谱分析 | 第147页 |
| ·蛋白质定性搜库分析 | 第147-148页 |
| ·蛋白质定量分析 | 第148页 |
| ·重复性考察 | 第148页 |
| ·G-IVTAL在透析血清对人肝癌细胞HepG2影响研究中的应用 | 第148-149页 |
| ·结果和讨论 | 第149-165页 |
| ·全面体内终端氨基酸标记方法的理论分析 | 第149-151页 |
| ·细胞标记效率的确认 | 第151-153页 |
| ·二甲基化标记反应的考察 | 第153-157页 |
| ·高pH反相色谱分离 | 第157-158页 |
| ·G-IVTAL方法在HepG2标记细胞中的应用 | 第158-161页 |
| ·G-IVTAL方法在透析血清对HepG2细胞影响研究中的应用 | 第161-165页 |
| ·本章小结 | 第165-166页 |
| 参考文献 | 第166-170页 |
| 附录 | 第170-181页 |
| 博士学位攻读期间学术发表情况 | 第181-183页 |
| 致谢 | 第183-185页 |
