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家蚕(Bombyx mori)全基因组细胞色素P450基因结构与进化分析及CYP18A1克隆与功能研究

中文摘要第1-8页
ABSTRACT第8-16页
第一章 文献综述第16-44页
   ·细胞色素P450酶系与细胞色素P450第16-22页
     ·细胞色素P450酶系第16页
     ·细胞色素P450第16-22页
       ·P450的结构特征第17-18页
       ·P450的类型第18-20页
       ·P450的命名第20-21页
       ·P450种类的多样性第21-22页
   ·昆虫细胞色素P450的研究进展第22-36页
     ·昆虫细胞色素P450蛋白的序列特征第22-23页
     ·昆虫细胞色素P450基因的基本特性第23-26页
       ·昆虫细胞色素P450基因的多样性第23-25页
       ·昆虫细胞色素P450基因的可诱导性第25-26页
     ·昆虫细胞色素P450基因的功能第26-34页
       ·蜕皮激素的合成与代谢第26-30页
       ·保幼激素的合成与代谢第30-31页
       ·信息激素的代谢第31页
       ·植物次生物质的代谢第31-33页
       ·杀虫剂的代谢第33-34页
     ·家蚕细胞色素P450的研究进展第34-36页
   ·昆虫细胞色素P450基因的进化第36-39页
     ·基因簇第36页
     ·假基因第36页
     ·内含子与外显子第36-37页
     ·直向同源基因第37页
     ·种系发生第37-39页
     ·进化机制第39页
   ·基因组学在昆虫细胞色素P450研究中的应用与进展第39-44页
     ·基因组研究技术与P450s的分离第40-42页
       ·基因组测序第40-41页
       ·表达序列标签技术第41页
       ·DNA微阵列技术第41页
       ·差异显示反转录PCR技术第41-42页
     ·基因组作图与功能基因定位第42页
     ·比较基因组学在基因的预测与进化研究中的应用第42-43页
     ·P450基因结构与内含子起源第43-44页
第二章 引言第44-48页
   ·研究目的和意义第44-45页
   ·主要研究内容第45-46页
   ·研究路线第46-48页
第三章 家蚕细胞色素P450基因的生物信息分析第48-66页
   ·材料与方法第48-49页
     ·数据来源第48-49页
     ·方法与步骤第49页
   ·结果与分析第49-63页
     ·家蚕细胞色素P450s的分析第49-51页
     ·假基因第51-54页
     ·基因分类与序列间系统发生关系第54-56页
     ·家蚕P450s的内含子分析第56-57页
     ·家蚕P450s的基因组分布与成簇排列状况第57-59页
     ·家蚕P450s的主要结构域的保守性分析第59-60页
     ·家蚕P450s的表达分析第60-62页
       ·家蚕P450s的EST表达分析第60页
       ·家蚕P450s芯片数据的表达分析第60-62页
     ·参与保幼激素合成的环氧化酶(epoxidatase)基因预测第62-63页
   ·结论与讨论第63-66页
第四章 家蚕细胞色素P450基因的比较基因组学分析第66-82页
   ·材料与方法第66-67页
     ·数据来源第66页
     ·软件与程序第66页
     ·方法第66-67页
   ·结果与分析第67-75页
     ·家蚕和果蝇的进化树构建第67页
     ·蜜蜂P450s进化树和基因结构图的构建第67-69页
     ·P450基因的共线性第69-70页
     ·Clan3基因的结构分析第70-71页
     ·Clan4基因的结构分析第71-73页
     ·Clan2基因的结构分析第73页
     ·线粒体集团基因的结构分析第73-74页
     ·三个昆虫P450s的内含子分布对比分析第74-75页
   ·结论与讨论第75-82页
     ·昆虫P450s的分布差异及其功能分析第76-78页
     ·三个昆虫P450s的共线性分析第78页
     ·昆虫P450s的基因结构比较分析第78-79页
     ·昆虫P450s与其基因组的关系第79-82页
第五章 家蚕CYP9A基因簇的基因克隆及进化分析第82-98页
   ·材料与方法第82-88页
     ·材料第82-84页
     ·方法第84-88页
       ·RNA的提取第84-85页
       ·cDNA第一链的合成第85页
       ·引物设计和PCR反应第85-86页
       ·目的片段的回收第86页
       ·目的片段与载体的连接第86页
       ·感受态细胞的制备第86-87页
       ·转化第87页
       ·阳性克隆的筛选和验证第87-88页
       ·克隆基因的序列分析第88页
       ·RT-PCR第88页
   ·结果与分析第88-96页
     ·CYP9A基因cDNA的克隆和序列分析第88-92页
     ·CYP9A基因在各组织器官的表达谱分析第92页
     ·CYP9A基因的进化分析第92-96页
   ·结论与讨论第96-98页
第六章 家蚕P450基因CYPl8Al的表达分析与功能研究第98-114页
   ·材料与方法第98-101页
     ·材料第98页
       ·实验材料第98页
       ·主要试剂及其配制第98页
       ·主要仪器设备第98页
     ·方法第98-101页
       ·引物设计和PCR反应第98-99页
       ·RT-PCR第99页
       ·RNA干涉载体的构建第99-100页
       ·dsRNA的合成第100页
       ·荧光定量PCR检测第100-101页
   ·结果与分析第101-109页
     ·CYPl8Al基因cDNA的克隆和序列分析第101-104页
     ·CYPl8Al基因表达活性分析第104-106页
       ·RT-PCR检测第104-105页
       ·家蚕CYPl8Al在蛹、蛾期表达的芯片数据分析第105-106页
     ·直向同源基因CYPl8Al的同源性分析第106页
     ·家蚕CYPl8Al和其它与类固醇调节相关基因的同源性分析第106-108页
     ·虫体dsRNA注射及后期观察第108-109页
     ·RNAi效果分子检测第109页
   ·结论与讨论第109-114页
第七章 综合和结论第114-118页
参考文献第118-138页
附录第138-142页
博士在读期间发表文章及参加课题情况第142-144页
致谢第144页

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