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红树林沉积物细菌多样性分析及其功能基因筛选

中文摘要第1-13页
英文摘要第13-15页
1 前言第15-37页
   ·红树林区微生物资源概况第15-17页
     ·红树林区的特点第15页
     ·红树林区微生物资源研究进展第15-16页
     ·红树林沉积物微生物纤维素酶酶系研究第16-17页
   ·环境微生物宏基因组研究第17-30页
     ·宏基因组概念的提出第17-19页
     ·宏基因组技术的原理及其要素第19-30页
       ·环境总DNA 的提取及其纯化第21-24页
       ·载体的选择第24-25页
       ·宿主的选择第25页
       ·宏基因组文库的分析第25-30页
   ·宏基因组技术的应用第30-36页
     ·细菌的多样性研究第30-33页
       ·细菌多样性分析的分子生物学进展第30-32页
       ·宏基因组技术在细菌多样性分析中的应用第32-33页
     ·利用宏基因组技术寻求生物活性物质的表达第33-36页
       ·宏基因组技术在生物活性筛选中的应用优势第33-34页
       ·宏基因组技术在生物活性筛选中的应用实例第34-35页
       ·利用宏基因组技术克隆纤维素酶基因第35-36页
   ·论文研究的目的和意义第36-37页
2. 材料与方法第37-49页
   ·材料第37-40页
     ·样品来源第37页
     ·菌株和质粒第37页
     ·主要试剂第37页
     ·PCR 引物第37页
     ·主要仪器第37-38页
     ·主要培养基第38-39页
     ·溶液配制第39-40页
     ·序列分析软件第40页
   ·基本方法第40-49页
     ·红树林沉积物1651DNA 文库的构建第40-44页
       ·沉积物基因组 DNA 提取第40-41页
       ·基因组 DNA 大片段的纯化第41页
       ·16S rDNA 基因片段的PCR 扩增第41-42页
       ·PCR 产物纯化第42页
       ·PCR 产物与T-vector 连接第42页
       ·感受态细胞的制备第42-43页
         ·CaCl_2 法第42-43页
         ·Inoque 法第43页
         ·转化率的测定第43页
       ·转化第43-44页
       ·文库保存第44页
       ·文库中阳性克隆子筛选及RFLP 分析第44页
     ·红树林沉积物宏基因组文库的构建第44-47页
       ·环境总DNA 提取第44页
       ·总DNA 不完全酶切第44-45页
       ·DNA 定量第45页
       ·质粒pUC19 的提取第45页
       ·质粒酶切第45-46页
       ·线性质粒DNA 回收第46页
       ·线性质粒DNA 去磷酸化第46页
       ·载体与目的DNA 连接第46-47页
       ·感受态细胞制备及转化第47页
       ·宏基因组文库的保存和评估第47页
     ·产纤维素酶克隆子的筛选及其分析第47-49页
       ·产纤维素酶克隆子的筛选第47页
       ·产纤维素酶克隆子的酶活鉴定第47-48页
       ·产纤维素酶克隆子插入片段的分析第48-49页
3 结果与分析第49-67页
   ·红树林沉积物细菌1651DNA 文库的构建第49-58页
     ·沉积物总DNA 的提取和纯化第49-50页
     ·16SrDNA 的扩增第50-51页
     ·16SrDNA 的连接和转化第51页
     ·16SrDNA 文库阳性克隆子筛选及RFLP 分析第51-53页
     ·红树林沉积物细菌多样性分析第53-58页
   ·红树林沉积物宏基因组文库(3-10kb)的构建第58-62页
     ·总DNA 的提取及其纯化第58页
     ·总DNA 的不完全酶切及其3-10k 片段的回收纯化第58-59页
     ·连接载体pUC19 的准备第59页
     ·载体与目的DNA 的连接与转化第59-61页
     ·宏基因组文库的构建第61页
     ·宏基因组文库的评估第61-62页
   ·红树林宏基因组文库中产纤维素酶基因的筛选第62-67页
     ·产纤维素酶克隆子的获得第62-63页
     ·产纤维素酶克隆子的酶活鉴定第63-65页
     ·产纤维素酶克隆子的插入片段分析第65-67页
4 讨论第67-74页
   ·红树林沉积物微生物资源的开发第67页
   ·红树林沉积物细菌1651DNA 文库的构建与分析第67-71页
     ·沉积物细菌 16SrDNA 文库的构建第67-70页
     ·红树林沉积物优势细菌组成分析第70-71页
   ·红树林沉积物宏基因组文库(3-10kb)构建及其活性筛选第71-74页
     ·宏基因组文库的构建第71-72页
     ·红树林沉积物宏基因组文库的活性物质筛选第72-74页
5 结论与展望第74-76页
   ·结论第74页
   ·展望第74-76页
参考文献第76-87页
附录第87-90页
致谢第90页

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