| 中文摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-14页 |
| ·生物信息学的研究内容和发展概况 | 第10-13页 |
| ·本课题所要解决的问题 | 第13页 |
| ·本课题的选题背景 | 第13-14页 |
| 第二章 有关的生物学知识综述 | 第14-18页 |
| ·序列查询和递交 | 第14-15页 |
| ·序列相似性搜索 | 第15-16页 |
| ·多序列比对 | 第16页 |
| ·进化树 | 第16-18页 |
| 第三章 多序列比对技术和算法研究 | 第18-32页 |
| ·生物学背景 | 第18页 |
| ·比较两个序列 | 第18-26页 |
| ·多序列比对算法 | 第26-32页 |
| 第四章 重构种系发生树 | 第32-38页 |
| ·三种方法重构种系发生树 | 第32页 |
| ·距离矩阵算法 | 第32-36页 |
| ·改进的距离矩阵算法 | 第36-38页 |
| 第五章 多序列比对和进化树生成集成软件的设计和实现 | 第38-50页 |
| ·流程图 | 第38-43页 |
| ·算法的验证和结果 | 第43-46页 |
| ·改进的距离矩阵算法的程序实现 | 第46-50页 |
| 第六章 CLUSTAL 用户平台使用说明 | 第50-54页 |
| ·概述 | 第50页 |
| ·多序列比对 | 第50-51页 |
| ·二序列比对参数设置 | 第51页 |
| ·多序列比对参数的设置 | 第51-52页 |
| ·输出格式选择 | 第52-53页 |
| ·生成种系发生树的设置 | 第53-54页 |
| 第七章 结论 | 第54-55页 |
| ·概述工作 | 第54页 |
| ·论文的意义 | 第54页 |
| ·不足和展望 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-58页 |
| 攻读硕士期间取得的研究成果 | 第58-59页 |