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SARS冠状病毒亚基因组RNA的分析和鉴定

Table of Contents第1-9页
List of Figures第9-10页
List of Tables第10-11页
摘要第11-13页
Abstract第13-16页
INTRODUCTION第16-69页
 CHARACTERISTICS AND CLASSIFICATION OF CORONAVIRUSES第16-27页
  Mechanism of Coronavirus Infection第18-19页
  Receptor Proteins as Determinants of Coronavirus Infection第19-21页
  Virus Entry第21-22页
  Pathogenesis第22-23页
  Cytopathogenesis and Spreading of Progeny第23-25页
  Species Specificity, Tissue Tropism, and Age-Dependent Resistance第25-27页
 SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME第27-36页
  The Outbreak第27-29页
  Clinical Information第29页
  Symptoms第29页
  Investigations第29-30页
  Diagnostic Tests第30页
  Diagnosis第30-31页
  Mortality Rate第31页
  Treatment第31-34页
  Current state of Etiologic Knowledge第34-36页
 GENOME ORGANIZATION OF SARS-COV第36-49页
  The 5' - Untranslated Region第41-42页
  The Replicase Gene第42-44页
  SARS-CoV RNA-Dependent RNA Polymerase第44-45页
  SARS-CoV Proteinases第45-46页
   1. Main Proteinase 3CLpro第45-46页
   2. Accessory Proteinase PLpro第46页
  Single Stranded RNA Binding Protein第46-47页
  Endoribonuclease第47-48页
  RNA Helicase第48-49页
 SARS-COV STRUCTURAL PROTEINS第49-58页
  Spike protein第49-51页
  Envelop Protein (E)第51-53页
  Membrane Protein (M)第53-54页
  Nucleocapsid Protein (N)第54-55页
  SARS Coronavirus Accessory Proteins第55-56页
  The 3' -Stem-Loop II-like Motif (s2m motif) in SARS-CoV第56-58页
 CORONAVIRUS REPLICATION AND TRANSCRIPTION第58-69页
  Leader-Primed Transcription第61-63页
  The Replicon Model第63页
  Discontinuous Transcription during Negative-Strand RNA Synthesis第63-66页
  Sequence Elements Regulating Transcription第66-69页
OBJECTIVES第69-70页
MATERIALS AND METHODS第70-80页
 Cells, Viruses, Antibodies and Bacteria第70-71页
 In Silico Analysis第71页
 Construction of Plasmids第71-74页
 Northern Blot第74-75页
 Transfection and Western Blotting第75-76页
 General Molecular-Biology Techniques第76页
 Extraction of RNA from Virus Infected Cells第76-77页
 Synthesis of Viral cDNAs第77页
 Polymerase Chain Reactions (PCR)第77-78页
 Agarose Gel Electrophoresis for Nucleic Acids第78页
 Ligation, Transformation and Screening for Positive Clones第78-80页
RESULTS第80-104页
 Features of the Genomic Structure of SARS-CoV Isolate WHU第80-84页
 Co-existence of both Positive and Negative-Strand Subgenomic RNA in SARS-CoV Infected Cells第84-89页
 Identification of Novel Subgenomic RNAs第89-94页
 Subgenomic RNAs 2-1 and 3-1 could be Functional Messages第94-96页
 Expression Profile of SARS-CoV Subgenomic RNAs第96-99页
 Role of 5'-UTR in Viral Translation第99-102页
 Uniqueness and Stability of the Junction Sequences of each Subgenomic RNAs第102-104页
DISCUSSION第104-117页
REFERENCES第117-149页
ACKNOWLEDGMENT第149-151页
Papers Published to be Published During the PhD Study(博士研究生期间发表和待发表的论文:)第151页

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