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玉米CMS-S核恢复基因及玉米对淹水胁迫响应基因的功能分析

中文摘要第1-10页
Abstract第10-14页
Abbreviation第14-15页
1 前言第15-38页
 1.1 玉米细胞质雄性不育研究进展第15-32页
  1.1.1 玉米细胞质雄性不育系的胞质分类第15-18页
  1.1.2 玉米 CMS核基因的遗传第18-20页
  1.1.3 玉米 CMS-S雄花育性的不稳定遗传第20-21页
  1.1.4 育性相关mtDNA读码框(ORF)的克隆与表达第21-26页
  1.1.5 不同育性材料间基因表达的差异第26-27页
  1.1.6 育性相关核基因的克隆及雄性不育性恢复机理的假说第27-31页
  1.1.7 近期对玉米 CMS分子生物学研究的主要方向第31-32页
 1.2 玉米对淹水胁迫早期响应基因的研究进展第32-36页
  1.2.1 淹水胁迫对玉米的伤害及其原因第32页
  1.2.2 玉米根系的厌氧代谢第32-33页
  1.2.3 基因表达与厌氧蛋白合成及其调节基因表达第33-35页
  1.2.4 厌氧信号氧敏感因子第35页
  1.2.5 玉米对淹水胁迫的适应第35-36页
 1.3 本研究的目的与意义第36-38页
  1.3.1 玉米 CMS-S核恢复基因(Rf3)克隆与功能研究第36-37页
  1.3.2 玉米对低氧胁迫早期响应基因的克隆与功能研究第37-38页
2 材料与方法第38-47页
 2.1 植物材料第38页
 2.2 材料的处理方法第38-39页
  2.2.1 玉米材料的淹水处理第38页
  2.2.2 玉米不同发育时期的小孢子和花粉的分离第38-39页
 2.3 总 RNA抽提与mRNA的纯化第39页
 2.4 cDNA文库的构建第39-40页
 2.5 玉米基因组DNA亲和杂交体系的建立及cDNA文库的均一化第40-41页
 2.6 DNA Microarray的制作、杂交及数据处理第41-42页
 2.7 Northern杂交分析第42-44页
  2.7.1 电泳与转膜第42-43页
  2.7.2 探针标记第43页
  2.7.3 杂交第43-44页
  2.7.4 膜的重复利用第44页
 2.8 持家基因cDNA片段的扩增与克隆第44-45页
 2.9 全长cDNA的扩增与克隆第45页
 2.10 SSH分析第45-46页
  2.10.1 SSH分析与扣除文库的构建第45页
  2.10.2 差异表达基因cDNA片段的筛选第45-46页
 2.11 玉米和水稻的比较基因组分析第46-47页
3 结果与分析第47-87页
 3.1 覆盖多个组织和发育时期的均一化cDNA文库的构建第47-53页
  3.1.1 总 RNA的提取与 poly(A~+)RNA的纯化第47-48页
  3.1.2 玉米持家基因的克隆第48-49页
  3.1.3 独立cDNA文库的构建第49页
  3.1.4 cDNA均一化文库的构建及均一化效果分析第49-50页
  3.1.5 cDNA文库质量评价第50-53页
 3.2 不同发育时期的花粉中基因表达差异分析第53-58页
  3.2.1 不同发育时期的小孢子和花粉的分离第53-55页
  3.2.2 芯片的点制与质量检测第55-56页
  3.2.3 不同发育时期花粉中基因表达分析第56-58页
 3.3 不同基因型的花粉中基因表达差异分析第58-76页
  3.3.1 不同基因型间基因表达模式的差异第58-59页
  3.3.2 不同基因型间2倍以上差异表达的克隆数第59-60页
  3.3.3 差异表达基因的功能分析第60-69页
  3.3.4 凋亡相关基因在不同基因型花粉中的表达第69-71页
  3.3.5 细胞凋亡和信号转导相关基因表达的时空特异性第71页
  3.3.6 几个玉米基因的全长cDNA克隆第71-76页
 3.4 不育与育性恢复花粉中基因表达差异的SSH分析第76-79页
  3.4.1 正向和反向扣除文库的建立与评价第76-77页
  3.4.2 正向和反向扣除文库中克隆的差异筛选第77页
  3.4.3 差异表达基因的功能分析第77-79页
 3.5 几个重要的候选基因在玉米染色体上的定位研究第79-81页
 3.6 不育系花药组织和花粉细胞的DNA寡聚核糖体片段第81-82页
 3.7 玉米根系对淹水胁迫的早期响应研究第82-87页
  3.7.1 淹水 2h后玉米根系中的基因表达第82-83页
  3.7.2 1个在低氧条件下诱导表达的类锌指蛋白基因的表达第83-87页
4 讨论第87-102页
 4.1 MONL文库质量说明饱和基因组杂交法均一化cDNA文库是有效的第87-88页
 4.2 饱和基因组杂交法与其它均一化方法的比较第88-89页
 4.3 S-(Rf3)和S-(rf3)花粉发育过程中的生理生化差异第89-92页
 4.4 可育与败育花粉发育过程中的信号传导的差异及其调控第92-94页
  4.4.1 Ca~2+信号传导第92-93页
  4.4.2 G蛋白信号传导第93页
  4.4.3 依赖多糖的信号传导第93-94页
 4.5 细胞凋亡与玉米 S-型细胞质雄性不育第94-97页
 4.6 核基因对细胞质基因表达的调控第97-99页
 4.7 玉米类锌指蛋白可能在蛋白质生物合成中起作用第99-100页
 4.8 翻译水平的调节在玉米淹水早期对低氧胁迫响应中起着重要的作用第100-102页
参考文献第102-119页
致谢第119-120页
附录1: Genomic DNA isolation (CTAB)第120页
附录2: Total RNA Extraction第120-121页
附录3: Small-scale mRNA Isolation(For PolyATtract~(?) Systems IV ,promega,USA)第121-122页
附录4: Plasmid Mini-Preps第122-123页
附录5: Nucleo Trap Gel Extraction Protocol第123-124页
附录6: DNA isolation for DNA Ladder第124-125页
附录7: 在校期间已发表和待发表的学术论文第125页

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