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生物大分子电子密度的计算

第一章 绪论第1-10页
第二章 Hartree-Fock理论简介第10-28页
 §2-1 分子体系的描述第10-13页
  2-1-1 分子体系第10-11页
  2-1-2 Born-Oppenheimer近似第11-12页
  2-1-3 平均场近似(单粒子模型)第12页
  2-1-4 平均场近似(单粒子模型)的合理性第12-13页
 §2-2 零级哈密顿本征方程第13-18页
  2-2-1 单粒子模型的哈密顿第13页
  2-2-2 求解零级哈密顿的本征方程第13-14页
  2-2-3 求解单电子薛定谔方程:分子轨道第14-15页
  2-2-4 能量本征值的交换简并第15-17页
  2-2-5 零级能量本征值的自旋简并第17页
  2-2-6 求解定态薛定谔方程的微扰方法第17-18页
 §2-3 Hartree-Fock方程(H-F方程)第18-28页
  2-3-1 变分原理与薛定谔方程第18-19页
  2-3-2 单电子薛定谔方程的变分方法第19-20页
  2-3-3 总能量的表示式第20-21页
  2-3-4 H-F方程的推导第21-23页
  2-3-5 H-F方程的自洽解法第23页
  2-3-6 LCAO自洽场方法和Roothaan方程第23-28页
第三章 量子化学计算第28-38页
 §3-1 基函数的选择第28-30页
  3-1-1 类氢离子波函数第28页
  3-1-2 Slater函数第28-29页
  3-1-3 Gauss函数第29-30页
 §3-2 相关积分的计算第30-34页
  3-2-1 基本积分公式第30-31页
  3-2-2 主要积分的计算第31-34页
 §3-3 一些半经验计算方法第34-38页
  3-3-1 CNDO,全略微分重叠第35-36页
  3-3-2 NDDO,忽略双原子微分重叠法第36页
  3-3-3 INDO,间略微分重叠第36-38页
第四章 大分子电子密度的拼接算法第38-54页
 §4-1 量子化学软件第38-41页
  4-1-1.Gaussian第38-40页
  4-1-2.VASP第40页
  4-1-3.Material Studio第40-41页
 §4-2 大体系的计算方法第41-43页
  4-2-1 QM/MM组合方法第41页
  4-2-2 线性标度半经验量子化学计算方法第41-42页
  4-2-3 计算显微镜方法第42页
  4-2-4 我们的方法:基于近视原理的拼接算法第42-43页
 §4-3 截断对烃链电荷分布的影响第43-48页
 §4-4 拼接算法的实现第48-54页
  4-4-1 电子密度的计算第48-49页
  4-4-2 拼接算法第49页
  4-4-3 计算实例第49-54页
第五章 结论第54-56页
参考文献第56-58页
致谢第58-59页
攻读硕士学位期间的工作第59页

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