| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-13页 |
| 前言 | 第13-20页 |
| 第一篇 大规模cDNA序列测定实验体系的建立 | 第20-29页 |
| 第一章 实验材料与主要试剂 | 第22-24页 |
| 海马组织cDNA文库来源 | 第22页 |
| 实验主要试剂 | 第22页 |
| 实验主要仪器 | 第22-24页 |
| 第二章 实验方法和过程 | 第24-27页 |
| 大规模测序实验体系的建立 | 第24-26页 |
| 质粒DNA大规模测序 | 第26-27页 |
| 第三章 实验结果 | 第27-28页 |
| 质粒提取结果 | 第27页 |
| 电泳定量结果 | 第27页 |
| 测序结果 | 第27-28页 |
| 第四章 大规模测序生产管理体系的建立 | 第28-29页 |
| 第二篇 大规模cDNA序列数据的计算机处理与分析过程 | 第29-49页 |
| 第一章 cDNA序列计算机处理与分析使用的主要资源 | 第31-33页 |
| 主要的公共数据库及其网址 | 第31页 |
| 公用生物信息数据处理分析软件 | 第31-32页 |
| 作者编写的数据处理程序和基因表达模式新标准化算法程序 | 第32页 |
| 生物数据库系统及其开发工具 | 第32-33页 |
| 第二章 cDNA序列的计算机处理与生物信息分析过程 | 第33-49页 |
| 原始测序胶图的处理 | 第34-35页 |
| 数据的传输与保存 | 第35页 |
| 碱基析取和测序质量监控 | 第35-36页 |
| 序列预处理 | 第36页 |
| Genbank公共数据库的BLAST搜索 | 第36-37页 |
| 人胎脑海马cDNA关系数据库系统的建立 | 第37-41页 |
| 已知基因分类和数字式基因表达谱的建立 | 第41页 |
| 与相关组织基因表达谱的比较——建立比较基因表达谱 | 第41-42页 |
| 表达谱数据的标准化处理 | 第42-48页 |
| 基因表达谱聚类分析 | 第48-49页 |
| 第三篇 150天人胎脑海马cDNA序列生物信息处理与分析结果 | 第49-66页 |
| 第一章 原始测序数据的初步处理分析结果 | 第50-52页 |
| 测序质量监控 | 第50页 |
| 数据预处理 | 第50-51页 |
| 公共数据库BLAST同源性比较 | 第51-52页 |
| 第二章 人胎脑海马cDNA序列生物信息处理与分析结果 | 第52-66页 |
| 已知基因分类 | 第52-53页 |
| 150天人胎脑海马数字基因表达谱 | 第53-57页 |
| 比较基因表达谱 | 第57-61页 |
| 基因表达谱数据的标准化处理结果和算法性能评估 | 第61-63页 |
| 表达谱聚类分析 | 第63-66页 |
| 第四篇 150天人胎脑海马基因表达特征及其生物学意义的初步探讨和分析 | 第66-80页 |
| 第一章 关于本研究在策略方法上的几点探讨 | 第68-72页 |
| cDNA序列数据库系统的主要特点 | 第68页 |
| 关于数据库中数据的说明 | 第68-69页 |
| 基因表达模式标准化算法的初步探讨 | 第69-70页 |
| 关于表达谱聚类方法的初步探讨 | 第70-72页 |
| 第二章 人胎脑海马基因表达特征及其生物学意义的初步探讨和分析 | 第72-80页 |
| 基因分类揭示150天人胎脑海马的总体基因表达特征 | 第72-73页 |
| 基因表达频率分布的特点 | 第73-74页 |
| 发育中期人胎脑海马细胞生理生化特征的进一步探讨 | 第74-77页 |
| 可能存在的问题和进一步研究的方向 | 第77-80页 |
| 结束语 | 第80-84页 |
| 附录A 部分分子生物学实验的操作步骤 | 第84-88页 |
| A1 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备和转化 | 第84页 |
| A2 细菌培养 | 第84-85页 |
| A3 质粒DNA提取的两种方法 | 第85-86页 |
| A4 质粒DNA琼脂糖凝胶电泳定量 | 第86页 |
| A5 DNA序列测定的主要方法 | 第86-88页 |
| 附录B 生物数据库系统的建立、配置与实现 | 第88-93页 |
| B1 生物数据库系统的建立和配置 | 第88-90页 |
| B2 生物数据库系统的实现 | 第90-93页 |
| 参考文献 | 第93-97页 |
| 文献综述一 基因表达分析方法的研究进展 | 第97-108页 |
| 文献综述二 蛋白质三维结构预测与模建的研究进展 | 第108-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
